第十八章_蛋白质的合成与运转--王镜岩《生物化学》第三版笔记(完美打印版)

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1、第十八章蛋白质的合成与运转第一节概述一、遗传密码(一)定义:密码子、遗传密码字典(二)基本特性叮无标点:是连续阅读的,若插入或删除一个碱基,会使以后的读码发生错误,称为移码。回一般不重叠:只有少数基因的遗传密码是重叠的。叮简并性:多数氨基酸有几个不同的密码子,只有色氨酸和甲硫氨酸仅一个密码子。编码相同氨基酸的密码子称为同义密码子。简并性可减少有害突变,也使DNA的碱基组成有较大的变化余地,在物种的稳定性上起一定作用。可摆动性:密码子的专一性主要由头两位碱基决定,第三位不重要,称为摆动性。反密码子上的I可与U、A、C配对,G可与U配对。5^UAG,UAA,UGA不编码氨基酸,作为终

2、止密码子,只能被肽链释放因子识别。AUG是起始密码子。叮通用性:在各种生物中几乎完全通用,但发现线粒体有所不同,如人线粒体中UGA编码色氨酸。二、核糖体(一)结构日核糖体RNA:有很多双螺旋区,16S在识别起始位点中起重要作用。叮核糖体蛋白:多数为纤维状,极少数球状。叮结构模型:椭圆球状,两亚基结合面上有较大空隙,蛋白质的合成在此进行。大亚基上有两个转运RNA位点:氨酰基位点(A)和肽酰基位点(P),还有一个水解GTP的位点。两个亚基的接触面上有信使RNA结合位点,核糖体上还有许多蛋白因子结合位点。(二)多核糖体:由一个信使RNA与一些单个核糖体结合而成,呈念珠状。这样可以同时合

3、成许多肽链,提高了翻译的效率。6个以上的多核糖体具有稳定的结构。第二节翻译的过程一、准备(一)肽链的合成是由氨基端向竣基端进行的,速度很快,大肠杆菌每秒可聚合20个氨基酸。信使RNA是从亍向3,翻译的。(二)氨基酸的活化:由氨酰tRNA合成酶催化,分两步:日形成氨基酸-AMP-酶复合物:氨基酸的竣基与5,磷酸形成高能酸肝键而活化。叮转移:氨基酸转移到转运RNA3'末端,与3,或2,经基结合。总反应为:氨基酸+tRNA+ATP=氨酰tRNA+AMP+PPi此酶专一性很高,只作用于L-氨基酸,每种氨基酸都有一个专一的酶。酶有校对机制,一方面对转运RNA有专一性,另一方面还有水解位点,

4、可水解错误酰化的氨基酸。(三)转运RNA的作用:起接头作用,根据密码子决定氨基酸的去向。转运RNA反密码子的某些突变可抵销一些有害突变,称为校正突变。二、肽链合成的起始(一)起始信号:起始密码子是AUG,其上游约10个核昔酸处有一段富含嗥吟的序列,可与16SrRNA的3,端互补,与起始有关。(二)起始复合物的形成:匸]起始氨基酸:是N-甲酰甲硫氨酸,其转运RNA也有所不同,称为tRNAf,与甲硫氨酸结合后被甲酰化酶以甲酰四氢叶酸甲基化,生成fMet-tRNAfo2J30S起始复合物:信使RNA先与小亚基结合,在起始因子3(IF3)的参与下形成mRNA-30S-IF3复合物,然后在

5、IF1和IF2参与下与fMet-tRNAf和GTP结合,并释放IF3,形成30S起始复合物。叮30S起始复合物与大亚基结合,水解GTP,释放IF1和IF2,形成70S起始复合物。此时转运RNA占据肽酰位点,空着的氨酰位点可接受另一个转运RNA,为肽链延长作好了准备。三、肽链的延伸(一)转运RNA进入氨酰位点:需ATP和两种延伸因子参加。EFTu与GTP结合,再与转运RNA形成复合物,才能与起始复合物结合。然后释放出EFTu-GDP,与EFTs和GTP反应,重新生成EFTu-GTP,参加下一轮反应。EFTu水解GTP前后构象不同,错误的转运RNA会离去,而正确的则与两种状态都有强相

6、互作用。EFTu-GDP离去之前不能形成肽键,它停留的时间越长,错误的转运RNA被排除的几率越大。这是翻译的限速步骤。(二)肽键的形成:肽酰基转移到氨酰位点,同时形成肽键。需大亚基上的肽酰转移酶和钾离子参加。肽酰位点的转运RNA成为空的。嗥吟霉素的结构与氨酰tRNA类似,可形成肽酰嗥吟霉素,易脱落,使合成中断。(三)移位:指核糖体沿信使RNA移动一个密码子。原肽酰位点的转运RNA离开,肽酰tRNA进入肽酰位点。需GTP和延伸因子G(EFG),也叫移位酶。GTP的水解使EFG释放出来。延伸与移位是两个分离的独立过程。四、终止(一)终止信号的识别:有三种蛋白因子:RF1识别UAA、U

7、AG,RF2识别UAA、UGA。RF3协助肽链释放。(二)肽链释放:释放因子使肽酰转移酶水解并释放转运RNA,然后核糖体离开,IF3使核糖体解离,并与小亚基结合,以防重新聚合。五、真核生物的合成(一)核糖体:更大,为60S和40S。(二)起始氨基酸:是甲硫氨酸,但其转运RNA无T屮C序列。(三)起始信号:密码子为AUG,无富含嗥吟的序列。因为是单顺反子,只有一个起点,所以小亚基先与帽子结合,向3,端移动寻找即可。(四)起始复合物:80S,起始因子(elF)有多种。需GTP和ATP

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