转录组学技术在水产动物研究中的运用

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1、第/0卷第1期水6产6学6报./01/0"%/112345年1月6!"#$%&'"(()*+,$),*"(-+)%&&231"2345文章编号!433373845#2345$31735097434")!431440815678123414430514(综述(转录组学技术在水产动物研究中的运用4!22/24"4!/"罗6辉!6叶6华!6肖世俊!6郑曙明!6王晓清!6王志勇#41湖南农业大学动物科学技术学院"湖南省水产高效健康生产协同创新中心"湖南长沙6143429%21西南大学鱼类繁育与健康养殖研究中心"重庆

2、6132183%/1集美大学水产学院"农业部东海海水健康养殖重点实验室"福建厦门6/84324$摘要!近年来!转录组学技术及其在水产动物中的研究备受研究者的广泛关注%转录组学技术主要有基于杂交技术和测序技术为基础的两大类技术'两类技术在水产动物的转录组学研究中均得到了广泛运用%尤其是二代测序技术的出现使得水产动物的转录组学研究达到了前所未有的热度%本实验综述了近年来水产动物在免疫应答$生长发育$生物进化和毒理学方面的转录组学研究进展%在综述已有成果的基础上!分析了转录组学技术自身存在的局限性和现阶段转录组学

3、在水产动物研究中面临的问题与挑战!并对未来水产动物转录组学研究趋势进行了展望%关键词!水产动物'转录组学'基因表达'生物信息学中图分类号!E;5'*04;11666666666文献标志码(&66近年来"转录组学&基因组学和蛋白质组学等变剪切&反义转录本&基因结构&新基因&差异表达各种组学技术在揭示水产动物抗病免疫&生长发基因和单核苷酸多态性等)即使所研究的物种没育&系统进化和生物毒理过程及相应机理方面的有现成的基因组信息可供参考"同样可以进行JB研究中越来越重要)通过组学研究"可以深刻理G/T/测序研究"将

4、所得序列信息通过JBG/T/组解水产动物各种生命活动规律的内在联系和分子装拼接"得到该物种的单一基因序列集数据)进机制"并根据相应结果进一步运用到抗病育种&药一步可以对基因进行功能注释&基因差异表达分物筛选&种质资源保护和环境监测等多个研究领析&R"富集分析&?

5、织或作为研究工具)器官在特定生长发育阶段或某种生理状况下所有依据转录组学技术原理的不同"可以将其划'2('8(转录本的科学)这所有的转录本就称之为转分为两类技术#图4$)一种是基于杂交的转录录组"包括编码蛋白质的;$%&和非编码$%&组学技术"如利用84%&微阵列#84%&'/(#3$%&"I$%&和其他G8$%&$)与基因组相对;=83/<33

6、的)因此"转录组组学技术"如84%&文库或表达序列标签分析成为研究生物生长发育&应激生理&抗病免疫#BW23BCCBJCBUQBG8BI

7、专项#O4!D2345-3/1"O4!D2341-452$通信作者!王晓清",9;<=0!V?**$技术#GBWIMBGB3

8、BG8=GM"$%&9CBU$技术等)'U)图')主要转录组测序技术的工作流程'U)C4D(')L@3=421&8%3%5%=9%<3A1;.4238.29584&3%;1&=.3<%8;966以杂交为基础的技术通常是通过原位合成或84%&的序列而获得转录组信息)这种方法依赖微阵列方法将众多序列已知的核酸探针固定于支于样本中产生可代表转录本的特定,*@标签"在持物上"然后与带荧光标记的样品进行序列杂交"经过连接&