本体论在医学知识组织中的作用

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1、MeSH、本体论在医学知识组织中的作用牟冬梅(吉林大学白求恩医学部公共卫生学院医药信息学系,长春,130021)摘要医学知识工程的关键是医学知识的组织,即将已积累的信息资源按照一定的知识体系组织起来。本文通过分析研究《医学主题词表》(MeSH)和本体论(ontology)在医学知识组织中的作用和特点,建议应发挥《医学主题词表》描述概念的精准和本体网状构架的优势,提出构建医学领域本体的原则,并可以利用网上提供的免费软件将建立好的医学领域本体转为医学主题图,实现医学的知识组织。关键词医学主题词表本体论知识组织医学分类号G254EffectofMeSHandOntologyinMedicalKno

2、wledgeOrganizationMuDongmei(DepartmentofMedical&PharmacologicalInformatics,SchoolofPublicHealth,JilinUniversity,Changchun,130021)AbstractThecoreinmedicalknowledgeengineeringistheorganizationofmedicalknowledge,i.e.toorganizeacquiredinformationresourcesaccordingtocertainknowledgesystems.Thepaperfirst

3、analyzedthecharacteristicsandeffectsof“MedicalSubjectHeadings”(MeSH)andontologyinmedicalknowledgeorganization.NextitsuggestedthataccuracyofMeSHindescribingconceptionandnetstructureofontologyindescribingtherelationofconceptionshouldbetakenadvantageof.Thenitproposedprinciplesofdesigningmedicaldomaino

4、ntology.AndatlastitproposedthatfreesoftwareontheInternetshouldbeusedtotransferestablishedmedicaldomainontologytomedicalsubjectmap,realizingmedicalknowledgeorganization.KeywordMeSH,ontology,knowledgeorganization,medicine美国医学泰斗WilliamH.Welch曾指出,19世纪美国对世界医学有四大贡献――麻醉术的发现、昆虫传播疾病的发现、现代公共卫生实验的建立和国立医学图书馆(N

5、ationalMedicalLibrary,NLM)的创建及其馆藏医学索引(Index[1]Medicus,简称IM)的编制,并认为最后一项为四大贡献中最重要的一项。美-1-国医学之所以处于世界领先地位,其中一个重要因素是美国有高度发达的医学图书馆和高效率的信息传播系统。我国医学与发达国家相比还有一定差距,其中一个原因是占有资源少,没有可供广大医学工作者和医学教育者方便查阅最新信息的医学图书馆,那么当前我国是否应建立一个国立医学图书馆呢?医学信息资源有其独特性,一方面医学文献居所有学科文献之首,医学文献数量约占全部科技[2]文献总量的1/5至1/4;另一方面医学文献的寿命最短,半衰期仅为3.

6、5年,明显短于其他学科文献。可见,目前建立一个传统的、“有围墙的”的、收藏价格昂贵且时效性强的纸质文献的医学图书馆似乎是不现实也是不可取的,因此建立依托网络的医学数字图书馆自然成为最佳选择。医学数字图书馆与医学传统图书馆相比不仅资源是数字化、服务是网络化的,最重要的是改变了传统图书馆的以信息资源为中心的信息管理模式,发展为医学知识管理,在医学数字图书馆中融入了知识组织体系,而知识组织体系构建正是现阶段医学知识工程领域所要研究的基础和核心。知识组织是对传统文献组织的拓展,它通过知识置标语言,以知识单元为加工单位,实现知识组织和知识库建设,并提供基于语义的检索功能。参与美国加州大学圣巴巴拉分校进

7、行亚历山大数字图书馆建设的LindaHill等人提出了数字图书馆的知识组织系统,主要由系统分类和大致分组模式(包括大致分组归类的类表、系统分类的分类表、标题表、知识分类表)、元数据的系统模式(包括指南、地名辞典)、关系模式(包括本体论、语义网络、叙词表)、[3]和词汇单(规范文档、字典、术语表)组成。从这个成功经验看,医学知识组织工具既有传统的分类表、元数据、叙词表、还有目前研究的热点――本体论的应用和语义网

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