《结构化学选读》PPT课件

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1、结构化学选读课程基本目的生物大分子结构与生物分子识别的基本原理研究生物大分子结构与识别的生物物理化学方法生物大分子结构与生物分子识别研究进展绝世唐门www.50xs.com课程主要内容1、蛋白质及核酸结构原理2、蛋白质结构预测方法3、蛋白质折叠研究4、用于蛋白质、核酸构象研究的光谱学方法（紫外、荧光、圆二色光谱等）5、生物分子识别研究的物理化学方法（等温滴定量热，超速离心等）6、 生物大分子结构测定7、蛋白质及药物分子设计蛋白质结构分类：球蛋白（水溶性蛋白）膜蛋白纤维蛋白蛋白质功能分类催化功能运输功能营养和贮存功能收缩和运动功能结构功能防御功能调控功能其它蛋白质折

2、叠问题蛋白质序列、结构、功能序列结构功能有关的蛋白质结构数据库蛋白质晶体结构数据库BrookhavenPDB(生物信息服务器）RCSB-PDB（http://www.rcsb.org)蛋白质结构分类库SCOPCATHPDBSUM一级结构二级结构三级结构四级结构蛋白质的一级结构20种氨基酸残基由肽键相连成的序列AGPFSCHEDSGPFCSFPGA?..蛋白质结构原理1、20种标准氨基酸疏水性AlaValLeuIlePheProMet带电：ArgLysAspGlu(His)极性：SerThrCysAsnGlnHisTyrTrp特殊：Gly(Pro)2、多肽链状结构3

3、、二硫键CYS-S-H+H-S-CYSCYS-S-S-CYS20种标准氨基酸疏水性AlaValLeuIlePheProMet带电：ArgLysAspGlu(His)极性：SerThrCysAsnGlnHisTyrTrp特殊：Gly(Pro)氨基酸的稳定性与后修饰Cys,MetAsnSer,Thr,TyrGlyProHis0.360Cys0.210Ser0.130Lys0.100Thr0.100Asn0.080Arg0.055Gln0.050Glu0.050Asp0.045Ala0.025Met0.025Ile-0.005Tyr-0.040Val-0.060Gly

4、-0.070Phe-0.120Trp-0.140Leu-0.180Pro-0.200氨基酸残基在活性部位出现的几率