斑头雁成鸟与雏鸟泄殖腔微生物的对比分析

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1、动物学杂志ChineseJournalofZoology2018,53(4):641~651斑头雁成鸟与雏鸟泄殖腔微生物的对比分析①④②③①①①①郑思思王稳王爱真孙浩杨芳王雪莲李来兴①中国科学院西北高原生物研究所,高原生物适应与进化重点实验室西宁810008;②青海大学省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室西宁810016;③青海大学生态环境工程学院西宁810016;④中国科学院大学北京100049摘要:肠道微生物通过维持稳态、辅助消化和促进免疫系统发育等方式维护宿主的健康状态。肠道微生物本身则受

2、到宿主的基因、饮食、年龄和环境等因素的影响。然而,肠道微生物的变化与宿主年龄之间的关系仍有许多未知。本研究分别收集斑头雁(Anserindicus)2只成鸟及3只雏鸟泄殖腔样品,提取肠道微生物总DNA,采用16SrRNA高通量测序的方法,分析并比较两年龄阶段鸟类肠道微生物的菌群结构及组成差异。研究发现,斑头雁雏鸟泄殖腔微生物属于9个门,含量最高的前5个门分别是梭杆菌门(48.29%)、厚壁菌门(22.21%)、变形杆菌门(22.07%)、放线菌门(5.02%)和软壁菌门(1.93%)。成鸟泄殖腔微生物属于

3、17个门,最多的依次是变形菌门(64.69%)、厚壁菌门(23.92%)、蓝细菌(8.48%)、放线菌门(1.43%)和梭杆菌门(0.56%)。在属的水平,斑头雁雏鸟泄殖腔微生物属于18个属,而成鸟含有24个属。成鸟泄殖腔微生物的α多样性显著高于雏鸟(P<0.05,Welch′st-test)。有186个操作分类单元(OTU)属于成鸟和雏鸟共有,而其他640个OTU和90个OTU则分别隶属于成鸟和雏鸟。雏鸟中67.39%的OTUs是成鸟所具有的。基于OTU的聚类结果与年龄分组一致。本结果对认识鸟类肠道微生

4、物与宿主年龄变化之间的关系有一定的参考价值。关键词:斑头雁;泄殖腔微生物;微生物组;高通量测序;年龄中图分类号:Q939文献标识码:A文章编号:0250-3263(2018)04-641-11ComparativeAnalysisoftheCloacalMicrobiomeofbothAdultandChickBar-HeadedGeese(Anserindicus)①④②③①①ZHENGSi-SiWANGWenWANGAi-ZhenSUNHaoYANGFangWANGXue-Lian①LILai-Xin

5、g①*①KeyLaboratoryofAdaptationandEvolutionofPlateauBiota,NorthwestInstituteofPlateauBiology,ChineseAcademyofSciences,Xining810008;②StateKeyLaboratoryofPlateauEcologyandAgriculture,QinghaiUniversity,Xining810016;③CollegeofEco-EnvironmentalEngineering,Qingha

6、iUniversity,Xining810016;④UniversityofChineseAcademyofSciences,Beijing100049,ChinaAbstract:Gastrointestinalbacteriacontributetohosthealthbymaintaininghomeostasis,increasingdigestiveefficiency,andfacilitatingthedevelopmentoftheimmunesystem.Hostgenetics,die

7、ts,agesand基金项目国家重点基础研究发展计划项目(No.2010CB530301);通讯作者,E-mail:lxli@nwipb.cas.cn;第一作者介绍郑思思,女,硕士研究生;研究方向:动物学;E-mail:ssmagic@sina.com。收稿日期:2017-11-07,修回日期:2018-03-15DOI:10.13859/j.cjz.201804015·642·动物学杂志ChineseJournalofZoology53卷environmentsstronglyinfluencethe

8、compositionofthegutmicrobiota.However,changesinmicrobialcommunitystructurewithhostageremainpoorlyunderstood.Inthisstudy,collected2adultsand3chicksBar-headedGeese(Anserindicus)cloacalsamples,extracttotalDNAsamples,an

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