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江南大学微生物学综合

'江南大学微生物学综合'
第十章 微生物的分类和鉴定 第一节 通用分类单元? 一、种以上的系统分类单元? 二、学名? 三、几个概念 第一节 通用分类单元? 种以上的系统分类单元 界 Kingdom 门 Phylum(或Division)——亚门 纲 Class ——亚纲 ——超目 目 Order ——亚目 科 Family ——亚科 ——族 ——亚族 属 Genus 种 Species 分类单元之间科加入亚 门、亚纲、亚目、亚科 等次要分类单位。种以 下又可分为亚种、变种、 型、菌株等种的概念 ? 种(Species) :最基本的分类单位 ? 定义:种是一个基本分类单位,是一大群表型特征高度相似、亲缘 关系极其接近、与同属内其他种有明显差异的菌株的总称。 ? 在微生物中,一个种只能用该种内的一个典型菌株作为具体标本,它 就是该种的模式种。 ? 新种:(Species nova, sp. nov或nov sp.) 指权威性的分类鉴定手册中从未记载过的一种新分离并鉴定过的微 生物 ? 新被鉴定的种发表时应在其学名后标上sp.nov.的符号,亚种以下的分类单元 ? 变种(Variety,Var.) ,某纯种的某一主要特征与典型菌种不同,其 余特征则完全相符,而这一特征又是稳定的,就称该纯种为典型种 的变种。 ? 典型的枯草芽孢杆菌:不产黑色素 ? 一种芽孢杆菌:酪氨酸培养基上产黑色素,其它特征都相同——称枯 草芽孢杆菌的黑色变种(Bacillus subtilis Var. niger)? 亚种(Subspecies,subsp.,ssp.) ? 种的进一步细分亚种与变种是近义词,两者经常混用 ? 常在种名、署名的加词后写上subsp.然后再写具体亚种的加词;? 亚种以下 ? 生物变型——表示特殊的生化或生理特征 ? 血清变型——表示抗原结构不同 ? 致病变型——表示某些寄主的专一致病性 ? 噬菌变型——表示对噬菌体的特异性反应 ? 形态变型——表示特殊的形态特征? 菌株(strain)或称品系:表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成的纯 种群体极其一切后代;实际上是一个微生物达到遗传性纯的标志。? 同一菌种的不同菌株 ? 作为分类鉴别的主要性状——相同 ? 非鉴别用的“小”性状——很大的差异 ? 尤其是生化性状,如代谢产物(抗生素、酶、有机酸等)的产量性状等? 类群(group):有些微生物的种类特征介于两种微生物之间,把这两种微 生物和介于它们之间的种类统称为一个“群”。 ? 没有分类地位 ? 彼此不易严格区分 ? 在研究的某一阶段还不准备作进一步鉴定 ? 把大肠杆菌和产气杆菌(两个种区别明显)以及许多介于这两种细菌之间的中 间类型,统称为大肠菌群 二、微生物的学名 ? 俗名(Common name,Vernacular name) ? 结核杆菌 ? 红色面包霉 ? 绿脓杆菌 ? 学名(Scientific Name) ? 结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis) ? 粗糙脉胞菌(Neurospora crassa) ? 铜绿假单胞菌 (Pseudomonas aeruginosa) ? 学名:为了便于交流和避免混淆,根据一个统一的命名法则,给每种微 生物取一个为大家公认的科学用名。 微生物的命名原则? 学名(Scientific Name, Scientific nomenclature ) 菌种的科学名称,是按照《国际细菌命名法规》命名的国际学术界公认, 并通用的名称。? 由拉丁词或拉丁化的词组成菌种的学名 ? 林奈的“双名法” Binomial nomenclature ? 三名法 ? 学名的其他知识 一个微生物学工作者必须牢记常用常见的微生物学名 微生物的命名原则? 规定与常识: ? 属名应大写首字母、单数、通常是拉丁字的名词,用来描述微生物的主要特 征,如形态、生理特征等 ? 种的加词代表一个种的次要特征,首字小写,是拉丁字的形容词,来补充说明 微生物的次要特征,如颜色、形状、用途? 1.学名=属名+种的加词+(首次定名人)+现名定名人和鲜明定名年份 ? 大肠埃希氏菌 Escherichia coli (Migula) Castellani et Chalmers 1919 ? 两歧双歧杆菌 Bifidobacterium bifidum (Tissier)Orla-Jensen 19242.学名=属名+种名+菌株(用字母、符号等字形表示)? 表示菌株的符号: ? 随意的或研究机构的名称缩写; ? 如“BF”为“北纺”,即北京纺织工业局科学研究所 ? Bacillus subtilis AS 1.389 枯草芽孢杆菌(可生产蛋白酶) ? B. subtilis BF 7658(可生产淀粉酶) ? 菌种保藏机构的缩写 ? 如“AS”为Academia Sinica(中国科学院),“ATCC”即American Type Culture Coll ection(美国模式菌种保藏中心) 双名法的实例 3.学名=属名+sp.(或spp.) ? 只鉴定到属名,对具体的种不能肯定 ? 枯草芽孢杆菌 Bacillus subtilis (Ehrenberg) Cohn 1872 ? 缩写:B. subtilis 或 Bac. Subtilis ? Bacillus sp. 表示尚未定种名的芽孢杆菌(芽孢杆菌的某一种) Bacillus spp.表示一批尚未定名的芽孢杆菌(若干芽孢杆菌)? 菌株 (品系)表示由一个独立的单细胞繁殖而成的纯种群体及其一 切后代? Bacillus subtilis AS 1.389 枯草芽孢杆菌(可生产蛋白酶)? B. subtilis BF 7658(可生产淀粉酶) 亚种/变种的命名——“三名法”学名=属名 + 种名 + subsp.或var. + 亚种(或变种)的加词 排成斜体 排成正体,但可省略 排成斜体? Saccharomyces cerevisiae Hansen ellipsoideus (Hansen) Dekker ? 汉斯酿酒酵母的椭圆形变种,原来由Hansen定名,后来Dekker将其划为椭圆变种? 亚种(subspecies,简称“subsp.”,排成正体字)? 变种(variety,简称“var.”,排成正体字) ? Candida lipolytica (Harrison) Diddens et lodder Var.,lipolytica 表示解脂假丝酵 母解脂变种 新种的命名? 新种: ? 在实际工作中获得并鉴定了一个新种(sp.nov.或nov.sp.,是species nova 的缩写) ? 按照法则命名发表时,应在其学名后附上“sp.nov.”符号,排成正体字。? 谷氨酸发酵新菌种 ? Corynebacterium pekinense sp.nov.AS1.299 (北京棒杆菌AS1.299,新种) ? C.crenatum sp.nov.AS1.542(钝齿棒杆菌AS1.542,新种)? 新种发表前,模式菌株的培养物就应存放在一个永久性的菌种保藏机构,并允许人 们从中获得该菌种。 第二节 微生物在自然界的地位? 生物的界级分类学说:是在认识发展过程中存在的对生物分类的不 同阶段的不同观点。? 二界→ 三界→四界→五界→六界→三原界 (1753) (1860) (1956) (1969) (1949) (1978)? 五界系统包括动物界、植物界、原生生物界(原生动物、单细胞藻 类、粘菌)、真菌界以及原核生物界。? 六界系统在五界系统的基础上增加一个病毒界。 六界系统表解原生生物界 原生动物、单细胞藻类、粘菌原核生物界 细菌(真细菌和古生菌)、放线菌、蓝细菌、支 原体、立克次氏体、衣原体真菌界 酵母菌、霉菌、蕈菌植物界动物界病毒界 病毒、亚病毒(类病毒、拟病毒、朊病毒)? 三原界系统是1978年由R.H.Whittaker和L.Margulis提出的。 ? 所有生物存在一个共同祖先,由它分三条进化路线,就形成了三个原界: ? 古细菌原界(Archae bacteria),包括产甲烷细菌、极端嗜盐菌和嗜热嗜酸菌; ? 真细菌原界(Eubacteria),包括蓝细菌和各种除古细菌以外的其它原核生物; ? 真核生物原界(Eucaryotes),包括原生生物、真菌、动物和植物。? 提出了内共生学说,主要是Margulis的贡献三原界系统示意图 第三节 各大类微生物的分类系统纲要? 一、原核微生物分类系统纲要 ? 伯杰氏手册? 二、真菌分类系统纲要 ? Ainsworth菌物分类系统纲要 一、原核微生物分类系统纲要? 原核生物分类学手册的发展 ? 细菌分类图说 ? 伯杰氏鉴定细菌学手册 ? 细菌与放线菌的鉴定 ? 细菌分类学 ? 原核生物 ? 伯杰氏系统细菌学手册 伯杰氏手册? Breed 《伯杰氏系统细菌学手册》 所有细菌(包括古细菌在内)放在原核生物界 细菌分类和鉴定的依据? Buchanan, R. E. et al. Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology, 伯杰氏鉴定细 菌学手册 ? 1923年, 1925年, 1930年, 1934年, 1939年, 1948年, 1957年, 1974年分别出版了第 一至第八版,1994年出了第九版 ? 以形态、生理生化、G + C mol%、生态分布等特征为主 ? 体现了现代分子生物学的研究成果 ? B e r g e y ’ s M a n u a l o f S y s t e m a t i c B a c t e r i o l o g y 1 9 8 4 , 9 版 细菌(古细菌)、支原体、衣原体、立克次氏体、蓝藻、放线菌 细菌的分类高级单位? 第九版《伯杰氏系统细菌学手册》对所有微生物的高级分类单元的划分如 下(19类, 250属) : ? 原核生物界 (Procaryotae) ? 薄壁菌门 (Gracilicutes) ? 暗细菌纲 (Scotobacteria) ? 不产氧光细菌 (Anoxyphotobacteria) ? 产氧光细菌 (Oxyphotobacteria) ? 厚壁菌门 (Firmicutes) ? 厚壁菌纲 (Firmibacteria) ? 放线菌纲 (Thallobzcteria) ? 软壁菌门 (Teneribacteria) ? 软皮体纲 (Mollicutes) ? 伪壁菌纲 (Mendosicutes ? 古细菌纲 (Archaeobacteria) 二、真菌分类系统纲要 ? 代表性的真菌分类系统 ? Ainsworth(1973)真菌分类系统 ? N. J. W. Kreger-van Rij , The yeasts: a taxonomic study, 1984 ? 菌物与真菌 第四节 微生物的分类鉴定方法? 分类鉴定步骤 ? 获得该微生物的纯种培养物(pure culture) ? 测定一系列必要的鉴定指标 ? 查找权威性鉴定手册? 微生物分类中使用的技术水平 ? 细胞形态水平 ? 细胞组分水平 ? 蛋白质水平 ? 基因组水平1. 经典分类法 早期,在细胞的形态和习性的水平。2. 现代分类鉴定方法 60年代起,核酸和蛋白质,红外光谱、气相色谱和质谱以及计算机的应 用3. 数值分类法 经典的微生物分类方法? 经典分类法: ? 根据少数几种特征进行分类的方法 ? 随机,不系统? 经典分类方法的分类依据: ? 形态特征:个体 群体 ? 生理、生化特征:营养要求(碳源,氮源,生长因子);代谢产物(种类,产量,显色反 应等);酶(产酶种类,反应特性等) ? 生态特征:生长温度,对氧需要,酸碱要求,宿主种类等 ? 生活史特点 ? 血清学反应 ? 噬菌体的敏感性 ? 其他 形态特征? 形态特征包括个体特征和群体特征。? 个体特征: ? 细胞形态,染色反应,各种特殊构造等? 群体特征:菌株在一定的培养基中的菌落特征 ? 菌落形态,在半固体或液体培养基中的生长状态 生理和生化特征? 营养来源 ? 多种糖能否被用作碳源和能源,对特定有机化合物和CO2的利用能力 ? 氮源的利用,是蛋白质、蛋白胨、氨基酸或铵盐、硝酸盐中的氮,还是 大气中的游离氮。? 代谢产物 ? 检测是否形成有机酸、产生气体,能否分解色氨酸产生吲哚,能否还原 硝酸盐,能否产生色素或抗生素等? 与温度和氧气的关系 经典的分类依据? 生态特性 ? 微生物与其它生物的寄生或共生等关系的专一性 ? 微生物在自然界的分布(是否耐高渗、嗜盐)? 血清学反应 ? 将已知菌种或菌株制成抗血清,未知菌是否与其发生特异性血清反 应 ? 用于微生物的亚种分类、病毒分类(尤其是噬菌体分类) 经典的分类依据? 生活史 ? 上代个体经一系列生长、发育阶段而产生下一代个体的全部经历 ? 微生物个体发育的阶段变化? 对噬菌体的敏感性 ? 各噬菌体有严格的寄生范围 ? 菌体对噬菌体的敏感性,区分不同类型 现代微生物分类方法? 遗传分类法: ? 从遗传学的角度估价微生物之间的亲缘关系的分类方法 ? 主要的分类依据:GC含量和DNA杂合情况。? 化学分类法: ? 指除核酸成分以外的其它化学成分的测定 ? 细胞壁、类脂、细胞色素组成,蛋白质的氨基酸顺序,红外吸收光 谱,核磁共振谱等 G+C含量? G+C含量:DNA中碱基G和C在整个DNA中的摩尔百分比。? 判断微生物种属间的亲缘关系的远近 ? 亲缘关系越远的种,碱基数目和排列顺序相差越大。? 各类微生物的G+C含量:27-75摩尔% ? G+C含量相差10%以上,肯定不属于同一个种 ? 完全不相关的两种微生物,G+C含量可能相同/近? 注意:使用G+C含量性状,必须结合其它性状 DNA杂交试验? 原理:不同来源的DNA在体外加热解链,合适条件,使互补的碱基配 对结合成双链DNA,然后测定杂合百分率 ? 杂合率越高,两个DNA碱基序列的相似性越高,亲缘关系也越近? 两条单链DNA的碱基序列 ? 完全相同,完整双链,杂合率100% ? 部分相同,生成的“双链”含部分单链,杂合率小于100%。? 比较不同来源DNA的碱基序列类似性? DNA-rRNA杂交? 16SrRNA寡核苷酸的序列分析 ? 分析后作出相似性图,关系近的集中到一起,关系远的在图上占据不 同的位置 细胞壁成分分析? 组成单位或结构,明显特殊性 ? 霉菌的细胞壁主要含有几丁质; ? 细菌细胞壁的主要成分是肽聚糖。 ? 革兰氏阴性菌细胞壁的肽聚糖含量较低,还有多肽、脂蛋白及脂多 糖等; ? 革兰氏阳性菌细胞壁肽聚糖的比例较高,还有蛋白质、多糖、磷壁 酸和磷壁质等。? 广泛用于放线菌的分类,并作为分属的依据 红外光谱? 每种物质的化学结构都具有特定的红外光谱? 测定微生物的化学成分? 比较适用于“属”的分类,但不适于“种”间分类? 优点:简单快速,样品用量少 数值分类法? 又称统计分类法 ? 用数理统计方法来处理微生物的各种特征,求出相识值,以相似 性的大小决定它们在分类学的关系,并把它们分为各个类群 。 ? 特点: ? 采用的分类特征较多; 一般是50-60个,多到100个特征以上 ? “等重原则” 各个分类特征不分主次,均等对待 数值分类法? 又称阿得逊氏法(Adansonian classification)? 以两两菌株的形态、生理生化特征,对环境的反应和忍受性及生态特征为依 据? 由计算机计算两者之间的总近似值,列出相似值矩阵,将相似度高的菌株列 在一起,然后将矩阵图转换成树状谱(Dendrogram)? 基本步骤: ? 收集50个以上(几百个)数据 ? 分别计算简单匹配相似系数和Jaccard相似系数 ? 列出相似度矩阵 ? 将矩阵图转换成树状谱? 优点: ? 结果偏向少, 所提供的分类群更稳定 ? 有些分类群,数值法和经典法之间已显示出很好的关联度微生物的数值法分类 数值分类法与经典分类法的比较 项目 经典分类法 数值分类法分类原则 所用特征有主次之分 所用特征无主次之分鉴定项目 较少 大量(50到数百) 人工统计数据整理 计算机运算检索方法 使用双岐检索表 根据相似系数大小 主要特征相同者为同 相似系数小者为同属,确定种属 属,次要特征相同者 相似系数大者为同种 为同种 常用微生物的分类鉴定指标? 细菌 ? 形态特征和生理生化特征相结合,而又重于生理生化特征? 放线菌 ? 以形态和培养特征为主,生理生化和生态特征为辅? 酵母 ? 形态特征与生理、生化特征兼重? 霉菌 ? 形态特征为主要指标? 病毒 ? 使用电子显微镜和各种生化、免疫技术,以及一系列独特方法第十章 微生物的分类和鉴定 第一节 通用分类单元? 一、种以上的系统分类单元? 二、学名? 三、几个概念 第一节 通用分类单元? 种以上的系统分类单元 界 Kingdom 门 Phylum(或Division)——亚门 纲 Class ——亚纲 ——超目 目 Order ——亚目 科 Family ——亚科 ——族 ——亚族 属 Genus 种 Species 分类单元之间科加入亚 门、亚纲、亚目、亚科 等次要分类单位。种以 下又可分为亚种、变种、 型、菌株等种的概念 ? 种(Species) :最基本的分类单位 ? 定义:种是一个基本分类单位,是一大群表型特征高度相似、亲缘 关系极其接近、与同属内其他种有明显差异的菌株的总称。 ? 在微生物中,一个种只能用该种内的一个典型菌株作为具体标本,它 就是该种的模式种。 ? 新种:(Species nova, sp. nov或nov sp.) 指权威性的分类鉴定手册中从未记载过的一种新分离并鉴定过的微 生物 ? 新被鉴定的种发表时应在其学名后标上sp.nov.的符号,亚种以下的分类单元 ? 变种(Variety,Var.) ,某纯种的某一主要特征与典型菌种不同,其 余特征则完全相符,而这一特征又是稳定的,就称该纯种为典型种 的变种。 ? 典型的枯草芽孢杆菌:不产黑色素 ? 一种芽孢杆菌:酪氨酸培养基上产黑色素,其它特征都相同——称枯 草芽孢杆菌的黑色变种(Bacillus subtilis Var. niger)? 亚种(Subspecies,subsp.,ssp.) ? 种的进一步细分亚种与变种是近义词,两者经常混用 ? 常在种名、署名的加词后写上subsp.然后再写具体亚种的加词;? 亚种以下 ? 生物变型——表示特殊的生化或生理特征 ? 血清变型——表示抗原结构不同 ? 致病变型——表示某些寄主的专一致病性 ? 噬菌变型——表示对噬菌体的特异性反应 ? 形态变型——表示特殊的形态特征? 菌株(strain)或称品系:表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成的纯 种群体极其一切后代;实际上是一个微生物达到遗传性纯的标志。? 同一菌种的不同菌株 ? 作为分类鉴别的主要性状——相同 ? 非鉴别用的“小”性状——很大的差异 ? 尤其是生化性状,如代谢产物(抗生素、酶、有机酸等)的产量性状等? 类群(group):有些微生物的种类特征介于两种微生物之间,把这两种微 生物和介于它们之间的种类统称为一个“群”。 ? 没有分类地位 ? 彼此不易严格区分 ? 在研究的某一阶段还不准备作进一步鉴定 ? 把大肠杆菌和产气杆菌(两个种区别明显)以及许多介于这两种细菌之间的中 间类型,统称为大肠菌群 二、微生物的学名 ? 俗名(Common name,Vernacular name) ? 结核杆菌 ? 红色面包霉 ? 绿脓杆菌 ? 学名(Scientific Name) ? 结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis) ? 粗糙脉胞菌(Neurospora crassa) ? 铜绿假单胞菌 (Pseudomonas aeruginosa) ? 学名:为了便于交流和避免混淆,根据一个统一的命名法则,给每种微 生物取一个为大家公认的科学用名。 微生物的命名原则? 学名(Scientific Name, Scientific nomenclature ) 菌种的科学名称,是按照《国际细菌命名法规》命名的国际学术界公认, 并通用的名称。? 由拉丁词或拉丁化的词组成菌种的学名 ? 林奈的“双名法” Binomial nomenclature ? 三名法 ? 学名的其他知识 一个微生物学工作者必须牢记常用常见的微生物学名 微生物的命名原则? 规定与常识: ? 属名应大写首字母、单数、通常是拉丁字的名词,用来描述微生物的主要特 征,如形态、生理特征等 ? 种的加词代表一个种的次要特征,首字小写,是拉丁字的形容词,来补充说明 微生物的次要特征,如颜色、形状、用途? 1.学名=属名+种的加词+(首次定名人)+现名定名人和鲜明定名年份 ? 大肠埃希氏菌 Escherichia coli (Migula) Castellani et Chalmers 1919 ? 两歧双歧杆菌 Bifidobacterium bifidum (Tissier)Orla-Jensen 19242.学名=属名+种名+菌株(用字母、符号等字形表示)? 表示菌株的符号: ? 随意的或研究机构的名称缩写; ? 如“BF”为“北纺”,即北京纺织工业局科学研究所 ? Bacillus subtilis AS 1.389 枯草芽孢杆菌(可生产蛋白酶) ? B. subtilis BF 7658(可生产淀粉酶) ? 菌种保藏机构的缩写 ? 如“AS”为Academia Sinica(中国科学院),“ATCC”即American Type Culture Coll ection(美国模式菌种保藏中心) 双名法的实例 3.学名=属名+sp.(或spp.) ? 只鉴定到属名,对具体的种不能肯定 ? 枯草芽孢杆菌 Bacillus subtilis (Ehrenberg) Cohn 1872 ? 缩写:B. subtilis 或 Bac. Subtilis ? Bacillus sp. 表示尚未定种名的芽孢杆菌(芽孢杆菌的某一种) Bacillus spp.表示一批尚未定名的芽孢杆菌(若干芽孢杆菌)? 菌株 (品系)表示由一个独立的单细胞繁殖而成的纯种群体及其一 切后代? Bacillus subtilis AS 1.389 枯草芽孢杆菌(可生产蛋白酶)? B. subtilis BF 7658(可生产淀粉酶) 亚种/变种的命名——“三名法”学名=属名 + 种名 + subsp.或var. + 亚种(或变种)的加词 排成斜体 排成正体,但可省略 排成斜体? Saccharomyces cerevisiae Hansen ellipsoideus (Hansen) Dekker ? 汉斯酿酒酵母的椭圆形变种,原来由Hansen定名,后来Dekker将其划为椭圆变种? 亚种(subspecies,简称“subsp.”,排成正体字)? 变种(variety,简称“var.”,排成正体字) ? Candida lipolytica (Harrison) Diddens et lodder Var.,lipolytica 表示解脂假丝酵 母解脂变种 新种的命名? 新种: ? 在实际工作中获得并鉴定了一个新种(sp.nov.或nov.sp.,是species nova 的缩写) ? 按照法则命名发表时,应在其学名后附上“sp.nov.”符号,排成正体字。? 谷氨酸发酵新菌种 ? Corynebacterium pekinense sp.nov.AS1.299 (北京棒杆菌AS1.299,新种) ? C.crenatum sp.nov.AS1.542(钝齿棒杆菌AS1.542,新种)? 新种发表前,模式菌株的培养物就应存放在一个永久性的菌种保藏机构,并允许人 们从中获得该菌种。 第二节 微生物在自然界的地位? 生物的界级分类学说:是在认识发展过程中存在的对生物分类的不 同阶段的不同观点。? 二界→ 三界→四界→五界→六界→三原界 (1753) (1860) (1956) (1969) (1949) (1978)? 五界系统包括动物界、植物界、原生生物界(原生动物、单细胞藻 类、粘菌)、真菌界以及原核生物界。? 六界系统在五界系统的基础上增加一个病毒界。 六界系统表解原生生物界 原生动物、单细胞藻类、粘菌原核生物界 细菌(真细菌和古生菌)、放线菌、蓝细菌、支 原体、立克次氏体、衣原体真菌界 酵母菌、霉菌、蕈菌植物界动物界病毒界 病毒、亚病毒(类病毒、拟病毒、朊病毒)? 三原界系统是1978年由R.H.Whittaker和L.Margulis提出的。 ? 所有生物存在一个共同祖先,由它分三条进化路线,就形成了三个原界: ? 古细菌原界(Archae bacteria),包括产甲烷细菌、极端嗜盐菌和嗜热嗜酸菌; ? 真细菌原界(Eubacteria),包括蓝细菌和各种除古细菌以外的其它原核生物; ? 真核生物原界(Eucaryotes),包括原生生物、真菌、动物和植物。? 提出了内共生学说,主要是Margulis的贡献三原界系统示意图 第三节 各大类微生物的分类系统纲要? 一、原核微生物分类系统纲要 ? 伯杰氏手册? 二、真菌分类系统纲要 ? Ainsworth菌物分类系统纲要 一、原核微生物分类系统纲要? 原核生物分类学手册的发展 ? 细菌分类图说 ? 伯杰氏鉴定细菌学手册 ? 细菌与放线菌的鉴定 ? 细菌分类学 ? 原核生物 ? 伯杰氏系统细菌学手册 伯杰氏手册? Breed 《伯杰氏系统细菌学手册》 所有细菌(包括古细菌在内)放在原核生物界 细菌分类和鉴定的依据? Buchanan, R. E. et al. Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology, 伯杰氏鉴定细 菌学手册 ? 1923年, 1925年, 1930年, 1934年, 1939年, 1948年, 1957年, 1974年分别出版了第 一至第八版,1994年出了第九版 ? 以形态、生理生化、G + C mol%、生态分布等特征为主 ? 体现了现代分子生物学的研究成果 ? B e r g e y ’ s M a n u a l o f S y s t e m a t i c B a c t e r i o l o g y 1 9 8 4 , 9 版 细菌(古细菌)、支原体、衣原体、立克次氏体、蓝藻、放线菌 细菌的分类高级单位? 第九版《伯杰氏系统细菌学手册》对所有微生物的高级分类单元的划分如 下(19类, 250属) : ? 原核生物界 (Procaryotae)
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