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1、PCR-DGGE技术在水牛瘤胃产甲烷菌多样性分析中的应用刘园园1,2姜伟伟1秦红玉1张卉3王士长11广西大学动物科学技术学院,南宁530005;2河北省科学院生物研究所,石家庄050051;3河南黄淮学院,河南驻马店463000摘要：[目的]分析水牛瘤胃产甲烷菌的多样性,为更好地了解水牛瘤胃产甲烷菌提供科学依据。[方法]采集16头广西本地沼泽型水牛瘤胃内容物,提取总DNA,利用产甲烷菌的通用引物扩增16SrRNA基因序列进行DGGE分析,并对DGGE凝胶上7条优势条带进行回收克隆测序。[结果]共获得9条序列(5条为古菌序列、4条
2、为非古菌序列),5条古菌序列中有3条与甲烷短杆菌(Methanobrevibacter)的同源性高达99％、1条与甲烷短杆菌的同源性达98％、1条与广古菌门(Euryarchaeota)热原体目(Thermoplasmatales)的同源性达98％；而4条非古菌序列分别属于拟杆菌(Bacteroidetes)、厚壁菌(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria),且彼此间同源性较小。[结论]通过PCR-DGGE技术可以较好地分析水牛瘤胃产甲烷菌的多样性。水牛；瘤胃；产甲烷菌；PCR-DGGE；多样性分析S82
3、3.8+3A2095-1191(2011)09-1144-04DiversityanalysisofrumenmethanogensinbuffalosusingPCR-DGGEtechniqueLIUYuan-yuanJIANGWei-weiQINHong-yuZHANGHuiWANGShi-chang2011-05-06广西大学研究生创新计划项目(2007105930905M079)刘园园(1982-),女,河北石家庄人,硕士研究生,研究方向为动物营养学。*为通信作者,E-mail:wangshichang20012001@
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