巴西橡胶NBS-LRR抗病基因类似物多样性分析.pdf

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1、南方农业学报JOURNAL0FsouTHERNAGRICULTuRE2013，44(3)：371—376ISSN2095—119l：CODENNNxAABhttp：／，www·nfnyxb-c。m一———————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————————一DOI：10．3969／j：issn．2095—1191．2013．3．371巴西橡胶NBS—LRR抗病基因类似物多样性分析游启孙，一，莫廷

2、辉-∥，曾丽星z，张影波3，解辉1，欧阳超1(1海南大学农学院，海口570228；2海南大学环境与植物保护学院，海口570228；3中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所，海南儋州571737)摘要：【目的】克隆巴西橡胶抗病基因同源序列，为巴西橡胶抗病R基因的获取奠定基础：【方法】根据已知抗病基因(Resistancegene，Rgene)编码的蛋白质NBs—LRR保守结构设计一对简并引物P1／P2，采集经水杨酸(sA)处理0、12、24、48h的巴西橡胶叶片，进行cDNA同源序列克隆。【结果】序列分析结果表明，克隆获得的

3、RGAs经系统进化分析分为T瓜．NBs．LRR和non—TIR．NBs—LIm两种类型和9个基因家族；多重比较发现，克隆获得的RGAs具有典型的NBs类抗病基因保守结构域，在与已知植物NBs类序列相似性比较中，与您c—2基因相似性最高，为46．2％，而巴西橡胶NBs类RGAs之间氨基酸相似性为22．1％～100．0％。进一步研究发现，核苷酸非同义替换和同义替换的比率小于l，有低水平的重组，表明点突变逐步积累是导致纯化选择的主要力量。【结论】通过sA诱导作用和NBs类抗病基因结合得到的巴西橡胶NBs类RGAs具有广泛的遗传多样

4、性，并与已知抗病基因氨基酸序列具高度相似性，这些RGAs候补序列可能与某抗病基因有密切联系。关键词：巴西橡胶；水杨酸；NBs—LRR；抗病基因同源序列(RGAs)；核苷酸结合位点(NBs)中图分类号：s794文献标志码：A文章编号：2095—119l(2013)03—0371一06DiVersityofNBS—LRRdisease—resistancegeneanalogsin妇℃veaibrasjliensisYOUQi—sunl一，MOTing—huil’3车，ZENGLi—xin92，ZHANGYing—b03，XIE

5、huil．OUYANGCha01(1CollegeofAgmnomy，HainanUniversity，Haikou570228，China；2CollegeofEnvimnmentandPlantPmtec“on，HainanUniversity，Haikou570228，China；3TmpicalCmpGene“cResourcesInstitute，ChineseAcademyofTmpicalAgriculturaISciences，Danzhou，Hainan571737，China)Abstract：【Obje

6、ctive】Thepresentstudyaimedtoclonethenucleotidebindingsite(NBS)typeresistancegeneanalogs(RGAs)inHeyea6rasme，ls南inordertopmvidereferencesforacquisitionofresistancegenes(Rgenes)．【Method】Theresistancegeneanalogswereclonedf南mthecDNAofleafbySAinductionf'orrespective0，12，

7、24，48husingapairofspecificdegeneratedprimersbasedontheconservedregionsofNBS—leucinerichrepeat(LRR)domainofplantRgenes．【Result】Sequenceanalvsisshowedthattheclonedf拈yea6，asmensJsRGAsbelongedtothenon—TIR—NBS—LRRandTIR—NBS—LRRtypeand9genefamilies．Thmughmultiplecomparis

8、ons，theelonedRGAshadtvpicalconservativedomainofNBS．ComparedwithknownNBSsequence，RGAshadsimilaritvrateof46．2％with12c一2gene，whileaminoacidsimiIarit