博奥芯片分析介绍.pdf

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1、生物分子功能注释系统(CB-MAS)使用快速入门博奥生物有限公司北京2009年目录1注册(REGISTER)....................................................................................................................22登录(LOGIN)..............................................................................................

2、.............................43项目操作(PROJECTOPERATION).....................................................................................54分析操作(ANALYSISOPERATION)....................................................................................65查询(QUERY).................

3、.....................................................................................................115.1全文检索(FREEWORDSEARCH).....................................................................................125.2BLAST比对(BASICBLAST)........................................

4、....................................................12--1MAS系统是一个对高通量生物实验数据(如生物芯片实验数据)提供全面生物学功能注释的分析平台系统。系统可处理多个物种的高通量实验数据,具有全面、快速、准确、直观等特点。MAS将目前多种生物信息学公共数据库中的注释相关信息相整合,提供包括基因、蛋白、功能、表达、蛋白相互作用、信号转导、调控、疾病、甲基化等生物学信息,有助于用户了解表达基因之间的相互关系。系统集成了Genbank、EMBL、SwissProt等通用序列数据库,以及Gene

5、Ontology、KEGG、BioCarta、GenMapp、mirBase、EPD、HPRD、MIND、BIND、intAct、TRANSFAC、UniGene、dbSNP、OMIM、InterPro等功能数据库,以及HUGO、MGI、RGD等物种专业数据库,为多种生物分子提供功能分类、代谢通路、表达调控、遗传疾病等全方位的注释信息。此外,系统支持多种查询方式,提供图形化的显示结果,系统还提供了比较基因组、序列比对、全文检索等功能。MAS系统是用户深入挖掘和理解高通量实验数据(如生物芯片)生物学意义的有力工具。1注册(REGISTER)在IE

6、浏览器中输入访问网址,进入MAS系统登录界面。图1-1MAS系统登录页面--2新用户需要首先注册电子邮箱。点击“Register”,弹出用户注册窗口,填写登录信息和用户信息(其中带红色星号标记的字段为必填项),完成后点击提交按钮,提交注册信息,为了能顺利通过审核,请完整真实的填写用户注册信息。图1-2注册信息填写--3系统管理员会根据用户提交的信息的真实和完整与否审核用户信息,发激活用户账号的电子邮件给注册用户。图1-3激活账号的邮件信息用户自行查收邮件(在MAS系统中注册所用的邮箱地址),并点击邮件中的“ActivemyMASaccount”

7、链接,激活MAS中的帐户。如果未收到此邮件,可以直接致电给博奥生物有限公司生物信息组或者给登录首页上的FeedBackemail发送邮件,追踪注册进展情况。2登录(LOGIN)注册用户,可以直接在登录界面输入email和密码,点击login按钮登录系统。图2-1登录系统点击“Manual”按钮,下载MAS系统使用的快速入门,供用户使用系统时做参考。--4登录系统后,系统会有通知消息弹出,用户可以从中关注MAS系统的最新信息。图2-2系统通知3项目操作(PROJECTOPERATION)点击ProjectList下方的图标,弹出项目添加窗口,定义

8、Project相关信息后点击“Submit”,提交生成一个新项目。图3-1新建一个project--5在ProjectList的Operation中,

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