DB32∕T 1775-2011 I型鸭肝炎病毒的检测RT-PCR 方法.pdf

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1、ICS65.020.30B41备案号:DBDBDBDB32323232江苏省地方标准DB32/T1775—2011I型鸭肝炎病毒的检测RT-PCR方法MethodofRT-PCRdetectingDuckVirusHepatitisI2011-05-06发布2011-07-06实施江苏省质量技术监督局发布DB32/T1775—2011前言为规范I型鸭肝炎病毒分子生物学检测技术,提高鸭肝炎病毒检测的灵敏度、稳定性、特异性,特制定本标准。本标准按GB/T1.1-2009《标准化工作导则第1部分:标准结构和编写》编制。本标准的附录A为规范性附录。本标准由江苏省农业科学院提出。本标准起草单位:江苏

2、省农业科学院。本标准起草人:魏雪涛、李银、刘宇卓、张敬峰。IDB32/T1775—2011I型鸭肝炎病毒的检测RT-PCR方法1范围本标准规范了I型鸭肝炎病毒分子生物学检测技术RT-PCR的所用引物大小、所涉及的样品范围、操作流程、反应条件等技术标准。本标准适用于检测鸭肝脏和病毒尿囊液中I型鸭肝炎病毒核酸。2规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是必不可少的,凡是注日期的引用文件,仅注日期的版本适用本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。GB/T6682-2008分析实验室用水规格和试验方法NY/T541-2002动物疫病实验室检验采样3方法原理聚合酶链

3、式反应(PolymeraseChainReaction),简称PCR,是一种分子生物学技术,用于放大特定的DNA片段,可看作生物体外的特殊DNA复制。PCR技术却以其快速、敏感和特异等优点在动物疫病检测中得到广泛应用,而且随着PCR技术的不断改进,这种针对病原核酸的诊断方法表现出更准确、灵敏和特异的特点。本标准选取了DHVIVP1基因的保守,设计了一对特异性引物,经过了PCR条件的优化、特异性实验、敏感性试验等,对DHVI的鉴定具有很高的准确性。4仪器设备和主要试剂4.1仪器设备:PCR仪,离心机,电泳槽,微量移液器,凝胶成像系统4.2主要试剂:TRIZOL,氯仿,异丙醇,无水乙醇,焦碳酸

4、二乙酯(DEPC)处理的灭菌双蒸水,AMV反转录酶,5×AMVBuffer,10mmol/LdNTPs,RNA酶抑制剂,25mmol/LMgCl2,EXTaqDNA聚合酶,10×EXTaqDNA聚合酶buffer,2.5mmol/LdNTP,DNAMarkerDL-2000,琼脂糖。5引物上游引物:5′-ATCTAATGTCCCGATACAAGGTG-3′;下游引物:5′-ACGCTAGTGTTTTGAGTCTAAGGC-3′。6样品采集按照NY/T541-2002动物疫病实验室检验采样方法,病死或扑杀鸭,无菌采集肝脏组织。7方法步骤1DB32/T1775—2011试验用水:按照GB-T6

5、682-2008三级水标准7.1样品处理取病料0.5g~1g置研钵中剪碎并研磨,反复冻融研磨,将研磨好的组织,用生理盐水1︰5稀释,以4℃12000r/min离心10min,取上清200µL备用。阴性对照:没有发病的正常鸭肝脏阳性对照:用中和试验检测DHV阳性肝脏样品(见附录A)7.2DHVRNA的提取取已处理的待检样品,以DHV阳性病毒为阳性对照,以正常肝脏作为阴性对照,无菌水为空白对照,每管依次加入Trizol600µL,振荡混匀后,室温放置10min,加入氯仿200µL,剧烈振荡后,室温放置1min,4℃12000r/min,离心15min,取上层水相750µL,加入500µL异丙醇

6、,混匀,﹣20℃放置15min,4℃12000r/min,离心15min,去上清,缓缓加入75%乙醇1mL洗涤,4℃8000r/min离心5min,去上清,室温干燥RNA样品沉淀20min,加入DEPC水10µL,使充分溶解。7.3RT-PCR反转录反应:5×AMVBuffer4μL、10mmol/LdNTPs2μL、下游引物1μL、RNA酶抑制剂0.5μL、RNA模板10μL,AMV反转录酶0.5μL,H2O(DEPC处理)2μL,总体积为20μL,瞬间离心混匀,65℃反应15min,42℃孵育1h,95℃5min,同时设立阴性、阳性对照,产物于﹣20℃保存备用。PCR的反应:按25µL

7、体系进行,含MgCl2(25mmol/L)1.5µL,灭菌水15µL,反转录产物4µL,10×EXTaqDNA聚合酶buffer2.5µL,2mmol/LdNTP0.5µL,上、下游引物50pmol/µL各0.5µL,EXTaqDNA聚合酶0.5µL。94℃3min,然后进入循环94℃30s,52℃30s,72℃30s,30个循环,于72℃延伸10min,4℃保存。7.4结果观察将PCR反应产物于1.2%琼脂糖凝胶进行电

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