疑难样本处理_医学院.pdf

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1、疑难样本处理方案王翔凯杰企业管理(上海)有限公司SampletoInsightQIAGEN:全球布局服务全球超过500,000客户VenloHamburgManchesterHildenHombrechtikonStockachGermantownMarseilleGaithersburgFrederickShanghaiShenzhenHilden全球总部“Gaitherstown“Shanghai美洲地区总部亚太区地区总部R&DFacilitiesHilden,HamburgandStockachShenzhenHombrechti

2、konManchester“Gaitherstown”,FrederickMarseilleOver35sitesinmorethan20countriesSampletoInsight2PAXgeneSystem—组织样本的最完美解决方案PAXgeneSystem新颖的组织样本解决方案鱼和熊掌可以兼得SampletoInsightPAXgeneSystem—组织样本的最完美解决方案SampletoInsightPAXgeneSystem—组织样本的最完美解决方案SampleTechnologiesAssay在核酸纯化的同时保存样品

3、形态和免疫组化性能Technologies继续检测采样,稳定化~保存和运输核酸纯化BD公司的PAXgeneBloodRNA采血管PAXgeneBloodRNAKIt(负压)PAXgeneBloodDNA负压采血管PAXgeneBloodDNAKitPAXgeneBoneMarrowRNATubePAXgeneBoneMarrowRNAKitPAXgeneTissueContainerNEWPAXgeneTissueRNAKitPAXgeneTissuemiRNAKit组织形态固定(代替福尔马林浸泡)PAXgeneTissueDNAKi

4、t稳定核酸专利成分保密SampletoInsightPAXgeneTissueWorkflow(1)实际解剖輸送・保部位切除固定核酸稳定脏器组织干燥固定存(1)PAXgene(2)PAXgeneTissueStabilizerTissueFix室温7天活检组织2–4小时4°C4周厚4mm-20°C6个月面积大约10mmx10mm核酸稳定性实验在不断进行中SampletoInsightPAXgeneTissueWorkflow(2)包埋处理各种分子生经过运输路途切片机免疫组化核酸纯化冻干机物学检测RNAincl.miRN

5、ARNAIHCH&EDNASampletoInsight人腭扁桃体染色结果PAXgeneTissueFormalinSampletoInsightJulie.SAS.Shanghai8PAXgenesystem更有助于保持核酸完整性SampletoInsightQIAGEN的FFPE样本解决方案获取FFPE样本中的生物大分子SampletoInsightQIAGEN的FFPE样本解决方案甲醛固定、石蜡包埋技术(FFPE)应用至今已有上百年全世界目前有数十亿份FFPE样本巨大的财富,同时也是巨大的挑战FFPE样本处理主要难点甲醛

6、固定之前某些分子已开始降解甲醛固定使得大量分子相互交联某些蛋白翻译后修饰状态发生改变SampletoInsightQIAGENFFPE系列试剂盒主要特点化学性恢复分子交联和修饰提取过程中对核酸进行保护根据样品情况处理全基因组扩增在较困难的小RNA或蛋白质分子等方面表现优异SampletoInsightQIAGEN的FFPE试剂盒一览SampletoInsightNew!GeneReadDNAFFPEKit甲醛固定样品会随机产生C-U转化SampletoInsight14一种解决方案:独立测2条链,大数据量SampletoI

7、nsight15SampletoInsight16消除“人为突变”试剂盒内包含了脱蜡液裂解液的配方做了改进,提高了产量可以修复“人为突变”对微量样品的产量更高SampletoInsight17移除假阳性突变信息SampletoInsight18可移除90%以上的C-U“人为突变”,同时真实的突变信息被很好的保留下来。SampletoInsight19在各种不同组织中均有最高的DNA得率SampletoInsight20富集前的质控与优化——QUANTIMIZE系统QUAlity+QuaNTIty+OptiMIZE=QUANTIM

8、IZESampletoInsight21QUANTIMIZE原理SampletoInsight22Noninvasivebiomarker新技术概念:液体活检LiquidBiopsyEvaluationBl

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