2019年一PubMed数据库简介课件.ppt

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1、PubMed数据库检索一、PubMed数据库简介PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW的医学数据库查询系统。PubMed的网址:ncbi.nlm.nih.gov/pubmed特点:收录范围广、内容全、检索途径多、检索体系完备,可少部分获取原文。P75二、通过PubMed可检索 到如下的信息MEDLINEPreMedline出版商提供的书目信息NCBI其它数据库的相关记录MEDLINEMEDLINE:是美国国立医学图书馆MEDLARS系统中最大的生物医学数据

2、库,收录1966年以来70多个国家近4300种生物医学期刊的书目信息和著者文摘,每周更新。每条记录均带有[PubMed--IndexedforMEDLINE]标志。PreMedline:收集未正式给予MeSH词、出版类型等深度标引信息的一个临时库。NLM每天把最新记录加入到PreMedline库中,每条记录均带有[PubMed--inProcess]标志。工作人员在一周内将这些记录标引,然后转入MEDLINE,同时从PreMedline中删去。PreMedlinePre-MedlineMedlineNewDataC

3、ollectPubMedProcessPubMed出版商提供的书目信息:出版商提供的是整本期刊的信息,若有部分没有被MEDLINE收录,PubMed仍保存,在记录中做[PubMed--assuppliedbypublisher]的标记。图1以下是几条PubMed的记录,标记不同,其出自的分库也不同NCBI其它数据库的相关记录:PubMed建立了与NCBI其他数据库之间联系。它们是双向网络互连的关系(见下页图)。其它库NCBI中通过Entrez可互查的数据库三、PubMed页面的结构登录PubMed主页ncbi.nl

4、m.nih.gov/entrez/query.fcgi ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/PubMed页面的结构检索提问区相关数据库链接、检索提问框、辅助检索工具检索提示区对各项检索功能的简单描述辅助功能区Entrez简介、PubMed服务、特有检索、相关资源NCBI数据库Nucleotide:DNA序列数据库Protein:蛋白质序列数据库Genome:基因组序列数据库Structure:分子结构模型数据库Popset:种群、种系发生或突变序列数据库Taxonomy:微生物类别数据库OMIM:人类孟

5、德尔遗传学在线数据库。PubMed辅助检索工具Limits(限制功能)Preview/Index(预览/索引)History(检索史)Clipboard(剪贴板或文件夹)Details(明细栏)JournalBrowser-杂志浏览器MeSHBrowser-主题词浏览器CitationMatcher-在表格输入刊物的引文信息来定位特定文章。ClinicalQueries-与临床相关的疗法,诊断,病因,预后Cubby-提供检索策略存储空间OrderDocuments-购买原文GratefulMed-连接到NLM提供的

6、其他服务。ClinicalAlerts-公布NIH资助重要临床研究结果ClinicalTrials-对公众提供临床科研的当前信息PubMedCentral-可免费提供全文生命科学文献服务功能四、PubMed的基本检索功能词语检索及自动词语匹配作者姓名检索杂志名称检索截词检索短语检索逻辑运算符检索四、PubMed的基本检索功能(一)词语检索及自动词语匹配在检索框中键入一到多个检索词,按“GO”键,即显示检索结果。“clear”按钮可以帮你清除查询框中的内容,然后开始一个新的查询。四、PubMed的基本检索功能(一)自

7、动词语匹配PubMed能自动利用它的“自动词语匹配”功能将重要的词语结合在一起,并将不规范的词语转换成规范的用词。如:输入vitaminccommoncold,系统会将自动转换成(“ascorbicacid”[MeSHTerms]ORvitaminc[TextWord])AND(“commoncold”[MeSHTerms]ORcommoncold[TextWord])进行检索。这种处理能使检索结果更精确和全面。四、PubMed的基本检索功能(二)作者姓名检索在检索框内按照姓+名缩写(不用标点)的格式键入作者姓名,

8、如Smithja,系统会自动在作者字段内进行检索。如果想进行更精确的检索,可以用双引号将作者名引起来,再加[au],如“smithj”[au]四、PubMed的基本检索功能(三)杂志名检索在检索框中键入杂志全名molecularbiologyofthecell也可以直接键入Medline的期刊标准缩写形式,如:molboilcell,键入刊物的ISSN(国际

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