应斌武教授-结核病的分子诊断技术进展.pdf

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1、结核病的分子诊断技术进展应斌武四川大学华西医院2017.12广西南宁01结核的流行现状02结核的分子生物学诊断03诊断技术发展的多元化华西医院的结核病诊断04的临床应用与研究进展一、结核流行病学现状预计未来20年将有3600万人死于结核病,结核病为感染性疾病中的头号杀手。传统检测方法特点:操作简便、快速、价廉。特异性好,阳性率低,易造成漏诊。涂片特点:提高了镜检的灵敏度,缩短了检测时间;缺点是假阳性率较高,需确证方法(萋-纳染色)Sputum固体培养及药敏试验—孵育4周观察生长情况平均时间2-3个月培养液体培养及药敏试验平均时间20天数小时,快速简便,分子生物学相

2、对传统方法更灵敏二、结核的分子生物学诊断分子诊断RNA水平DNA水平蛋白质水平恒温扩增变温扩增IGRA,TST等扩增杂交SAT,TMAFISH,探针鉴定鉴定+耐药LAMP,RT-PCR,SDALPA,Xpert,HRM,测序RNA作为分子诊断靶标的技术1.GenProbeMTD(TMA技术)原理:以rRNA为靶标,采用线性探针技术检测结核分枝杆菌复合群检测时间:2.5h扩增rRNA,TMA恒温扩增动力快速反应,30分钟产生十亿扩增物反应在单一试管进行,无须移液和清洗产物为易自然降解RNA,防止交叉污染唯一获得FDA推荐的涂阴样本快速检测技术,不使用PCR仪

3、,无需专业PCR实验室认证RNA作为分子诊断靶标的技术2.恒温扩增检测SAT技术DNA作为分子诊断靶标的技术1.TB-DNA检测1.能稳定检测10copy的TB-DNA,较评价灵敏特异2.荧光定量PCR检出MTB阳性率显著高1.TB-DNA检测的限制步骤在于DNA的提取:磁珠法提取DNA较煮沸裂解法和柱子法纯度于涂片染色和培养法高3.早期、快速、准确地诊断结核病2.TB-DNA检测尤其适合于菌量少的体液标痰液、支气管灌洗液——肺结核本血液——播散性结核和各脏器结核病3.血液标本除外,MTB检出率极低,可能和脑脊液——中枢神经系统结核病前处理、核酸提取有关宫颈/尿道

4、拭子——泌尿生殖结核DuoL,YingB,etal.Molecularprofileofdrugresistanceintuberculousmeningitisfromsouthwestchina.ClinInfectDis.2011Dec;53(11):1067-73.DNA作为分子诊断靶标的技术2.环介导恒温扩增LAMP技术原理针对靶基因的6个区域设计4条特异引物,利用链置换DNA聚合酶在等温条件(63-65℃)下30-60min,即可完成核酸扩增特点不需双链DNA先变性成单链扩增反应在等温下可持续进行扩增效率高,15min-1h内实现109-1010

5、倍的扩增对DNA的扩增不需要热循环仪器。当模板为RNA时,仅需加入逆转录酶即可与DNA一样扩增基于TB-DNA的MTB鉴定及分子药敏技术1.Lineprobeassays线性探针测定法Hain(LPAGenoType®MTBDRplus/Rsl)技术2h0.5h2.5-3hWHO建议使用Hain来检测MDR-TB基于TB-DNA的MTB鉴定及分子药敏技术2.XpertMTB/RIF以半巢式实时定量PCR扩增技术为基础,能够自动抽提DNA并且扩增rpoB基因。设计五个重叠的分子信标,检测81碱基rpoB核心区域所有可能的突变;用不同的荧光基团标记每个分子信标,

6、仅在一个反应中完成整个检测2小时内直接从病人痰液中检测是否有MTB及对利福平的耐药性整个过程都在一密闭环境中进行,手动操作时间不超过5分钟,对操作者和周围环境安全2010年12月,WHO首次发布官方文件推荐XpertMTB/RIF技术的使用2013年,WHO又再次发文更新了对XpertMTB/RIF的推荐意见:当成人和儿童患者怀疑MDR-TB感染或合并HIV感染时,强烈推荐XpertMTB/RIF作为首选检测方法,从而替代传统的涂片镜检,培养和药物试验的方法。截止到2014年末,GeneXpert已累积生产了对疑似肺外结核患者的肺外标本如脑脊液,17,88

7、3组模块和10,013,600淋巴结和其它组织,推荐XpertMTB/RIF作组标本盒,销往145个国家和为检测方法。地区。对于痰涂片检测阴性的患者,推荐XpertMTB/RIF作为后续检测方法。GeneXpert残留物进行其它耐药性分析Xpert测定法处理的样品残留物可用于PCR,以发现与MDR和XDR-TB的其他药物的抗性相关的突变,无需培养或生物安全基础设施,特别适合于不可能进行表型药物敏感性测试的环境NeweriterationsofGeneXpertXpertMTB/RIFUltra手动操作时间:<1分钟结果:<80分钟敏感性更高,特别是涂片阴性

8、结核病例

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