基于转录组的水稻干尖线虫锌指蛋白基因克隆及功能分析.pdf

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1、中国展亏通报2015，31(7)：175—179ChineseAgriculturalScienceBulletin基于转录组的水稻干尖线虫锌指蛋白基因克隆及功能分析刘晓晗，王峰，李丹蕾，董爱荣，陈俏丽，王博文，零雅茗，江珊，段颜祯，张玉洲(东北林业大学，哈尔滨150040)摘要：为了寻找线虫生殖相关基因，为开发线虫生殖抑制药剂提供理论基础，通过分析水稻干尖线虫转录组文库高通量测序数据，对Unigene进行KEGG路径分析，筛选出一个孕酮介导的卵母细胞形成代谢路径(progesterone—mediatedoocytematuration)，并筛选出该路径的主要调控基因——

2、锌指蛋白基因。通过同源序列比对发现水稻干尖线虫锌指蛋白氨基酸序列中含有核酸结合保守结构域NLS，进一步通过三维结构分析及分子对接验证该蛋白可与DNA分子结合。结果表明，水稻干尖线虫锌指蛋白可与其调控基因的启动子结合从而完成对孕酮介导的卵母细胞形成代谢路径的调控。通过本研究得出最终结论，水稻干尖线虫锌指蛋白具有生物防治价值，值得深入研究。关键词：水稻干尖线虫；锌指蛋白；卵母细胞形成中图分类号：$715．3文献标志码：A论文编号：casbl4110064GeneticCloningofAZincFingerProteinfromAphelenchoidesbesseyi(Aph

3、elenchida：Aphelenchoididae)LiuXiaohan，WangFeng，LiDanlei，DongAirong，ChenQiaoli，WangBowen，LingYaming，JiangShan，DuanYanzhen，ZhangYuzhou(NortheastForestryUniversity，Harbin150040)Abstract：Tofindthegenewhichcaninfluencenematodebreeding，thezincfingerproteingenewascloned，basedontheanalysisofthetra

4、nscriptomeofAphelenchoidesbesseyiandthestudyofKEGGpathway．Thisstudyisthetheoreticalbasisforthedevelopmentofnematicide．Bythemethodofhomologyalignment，theresultsindicatedthatthezincfingerproteinhadaNLSmotif．Theprotein3Dstructurestudyanddockinganalysisindicatedthatthisproteincouldregulatethep

5、rogesterone—‘mediatedoocytematurationpathwaybycombiningwiththepromoterofthetargetgene．Theresultsshowedthatthezincfingerproteingenewasapotentialbiologicalcontroltargetgene，andworthyoffurtherstudy．Keywords：Aphelenchoidesbesseyi；zincfingerprotein；microRNA；oocytematuration0引言(Fragaria，zD)和玉米(Z

6、eamays)等草本植物，水稻干尖线虫(AphelenchoidesbesseyiChristie，还侵染印度榕(Ficuselastica)等园林植物。目前，尚1942)引起的水稻干尖线虫病是一种重要的水稻无水稻干尖线虫基因组测序研究的报道，但已经有该fOryzasativa)线虫病害。该线虫不仅危害水稻、草莓线虫转录组测序和6、X—box结合蛋白基因基金项目：中央高校基本科研业务费专项资金项目“基于RNA．Seq策略研究杨树抗杨褐盘二孢菌侵染分子机理”(DL13BA01)；高等学校博士学科点专项科研基金资助课题(博士点新教师基金资助项目)“水稻干尖线虫诱导水稻防卫反应基

7、因及其相应microRNA克隆与分析”(20100062120002)；林业公益性项目“大兴安岭药用真菌、黄芪栽培”(201004079)。第一作者简介：刘晓晗，女，1991年出生，黑龙江伊春人，硕士，主要从事植物病理学研究。通信地址：150040黑龙江哈尔滨东北林业大学林学院，Tel：0451-82190232，E—mail：nematodefungi@126．tom。通信作者：董爱荣，男，1971年出生，山东人，副教授，博士后，博士，主要从事森林病理学研究。通信地址：150040黑龙江哈尔滨东北林业大学林学院，