外周全血中与老化相关的DNA甲基化标记的来源.pdf

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1、篷Hereditas(Beijing)2015年2,el，37(2)：165-173WWW．chinagene．cn研究报告外周全血中与老化相关的DNA甲基化标记的来源李红东，洪贵妮，郭政，21．电子科技大学生命科学与技术学院，成都610054；2．福建医科大学基础医学院，消化道恶性肿瘤教育部重点实验室，福州350108摘要：机体老化与癌症、神经退行性疾病等许多复杂疾病相关。目前，研究者已在外周全血中识别了大量的与老化相关的DNA甲基化标记，这些标记可能反映外周血白细胞在机体老化过程中发生的变化，也可能反映外周血中与年龄

2、相关的细胞构成比例的变化。文章利用3组正常个体外周全血DNA甲基化谱，采用Spearman秩相关分析识别了与老化相关的CpG甲基化位点(age-relatedDNAmethylationCpGsites，arCpGs)并评价了其可重复性；利用去卷积算法估计了各外周血样本中髓性和淋巴性细胞的比例并分析了其与年龄的相关性；比较了在外周全血、CD4+T细胞和CD14+单核细胞中识别的arCpGs的一致性。结果显示，在独立外周全血数据中识别的arCpGs具有显著的可重复性(超几何检验，P=I．65x10)外周血髓性和淋巴性细胞的

3、比例分别与年龄显著正、负相关(Spearman秩相关检验，P

4、4+单核细胞、外周全血以及CD4+T细胞中的DNA甲基化水平与年龄的正、负相关性一致，提示它们可能主要反映细胞间共同的改变在外周全血中识别的arCpGs主要反映某些白细胞共同或特异的DNA甲基化改变，但是也有一部分反映外周血细胞比例构成的变化。关键词：外周全血；老化；DNA甲基化；CD4+T细胞；CD14+单核细胞Age-relatedDNAmethylationchangesinperipheralwholebloodHongdongLi，GuiniHong，ZhengGuo’，．SchoolofZifeScience

5、andTechnology,UniversityofElectronicScienceandTechnologyofChina，Chengdu610054,China，‘2．KeyLaboratoryofMinistryofEducationforGastrointestinalCance~FujianMedicalUniversity,Fuzhou350108，ChinaAbstract：Agingisassociatedwithmanycomplexdiseasessuchascancerandneurodegene

6、ratiVediseases．Re-cently,manyage-relatedDNAmethylationbiomarkersinperipheralwholebloodhavebeenidentified．Thesebio-markersmayreflectDNAmethylationchangesderivedfromchangesinthenumberofaspecificleukocytecelltypeduringaging．Toclarifythesourceoftheseage—relatedDNAmet

7、hylationchanges，weanalysedDNAmethylationprofileofperipheralwholebloodfromthreeindependentcohortsofhealthysubjectsandidentifiedage—relatedDNA收稿日期：2014-11-12；修回日期：2014-11-20基金项目：国家自然科学基金项目(编号：8I372213，81201822)资助作者简介：李红东，博士研究生，研究方向：生物信息学。Tel：028—83207187；E—mail：bio

8、mantis_lhd@163．com通讯作者：郭政，博士，教授，研究方向：生物信息学。E—mail：guoz@ems．hrbmu．edu．cnDOI：10．162880．yczz．14—394网络出版时间：2014．10一l58：06：17URL：http：／／www．cnki．net／kcms／detail／l1．