第3章 核酸分子的酶切、连接和修饰课件.ppt

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1、第四章核酸分子的酶切、连接和修饰第一节DNA分子的酶切一、限制性核酸内切酶(Restrictionendonuclease)1、限制性核酸内切酶的发现限制修饰系统(Restrictionmodificationsystem)是存在于细菌等一些原核生物体内,可保护自身免于外来DNA(如噬菌体)侵入的一个系统,包括限制和修饰两个方面的作用。限制(Restriction)是指细菌的限制性核酸酶对入侵DNA的降解作用,这就限制了外源DNA侵入所造成的危害。修饰(Modification)是指细菌的修饰酶对于

2、自身DNA碱基分子的甲基化等化学修饰作用,经修饰酶修饰后的DNA分子可免遭细菌限制酶的降解作用。2、限制性内切酶的类型和命名Ⅰ型和Ⅲ型酶在基因工程研究中的应用价值不大,通常所说的限制性内切酶都是Ⅱ型酶。表4-1三种限制性内切酶的特点比较使用限制性内切酶寄主菌的种属名称,来命名限制性内切酶限制酶来源剪切方式EcoRIEscherichiacoliRY13G↓AATTCHindⅢHaemophilusinfluenzaeRdA↓AGCTT3、Ⅱ型限制性内切酶的作用方式(1)识别并切割特异核苷酸序列(2)

3、识别序列都是回文序列(3)切割后形成各种粘性末端或平整末端图4-1几种Ⅱ型限制性内切酶的识别和切割序列图4-2杂交位点的形成及其切割二、限制性内切酶切割DNA的方法(一)单酶切割DNA样品图4-3单酶切割的DNA通过互补末端载体DNA的连接图4-4质粒的图谱及其酶切检测结果(二)双酶或多酶切割DNA样品图4-5双酶切割的DNA通过互补末端载体DNA的连接(三)DNA样品的部分酶切图4-6DNA样品的部分消化(A)基因组DNA电泳;(B)基因组DNA部分酶切结果三、影响限制性内切酶活性的因素1.DNA

4、样品纯度2.DNA甲基化程度3.缓冲液条件4.酶切反应温度5.DNA分子结构四、DNA酶切的应用图4-7重组质粒构建实例第二节DNA分子的连接一、连接酶连接酶(Ligase)是一类能将两个核酸片段连接起来的酶。目前已研究发现多种不同来源或作用于不同底物的连接酶类,这里主要介绍:E.coliDNA连接酶、T4DNA连接酶、热稳定DNA连接酶和T4RNA连接酶。二、粘性末端DNA片段的连接(一)相同粘性末端的连接(二)不同粘性末端的连接三、平末端DNA片段的连接(一)平末端DNA片段的直接连接(二)同聚

5、物加尾法(三)接头连接四、影响连接反应的因素图4-8同聚物加尾连接示意图图4-9利用接头分子的连接示意图第三节DNA分子的修饰一、DNA修饰酶1、末端转移酶2、T4多聚核苷酸激酶3、碱性磷酸酶二、T4多聚核苷酸激酶对DNA的修饰作用1、5’-OH末端磷酸化2、核酸分子5`-端的标记三、碱性磷酸酶对DNA的修饰作用思考题1、什么是DNA限制性内切酶;基因工程中常用的是哪种类型,如何命名?2、Ⅱ型限制性内切酶有哪三个主要的作用特性?3、请以表格比较并说明常用DNA聚合酶及其性质。4、利用逆转录酶和mRN

6、A模板合成cDNA的主要步骤是什么?5、请总结出DNA单酶切分析的一般实验方法。6、为什么通过碱性磷酸酶处理可以防止质粒载体DNA自连的作用?

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