DB37T 4044-2020 禽腺病毒4型荧光定量PCR检测方法.doc

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1、ICS 11.220B41     DB37山东省地方标准DB37/T4044—2020     禽腺病毒4型荧光定量PCR检测方法Real-timePCRassayforthedetectionoffowladenovirusserotype42020-07-09发布2020-08-09实施山东省市场监督管理局   发布DB37/T4044—2020前  言本标准按照GB/T1.1—2009给出的规则起草。本标准由山东省畜牧兽医局提出并组织实施。本标准由山东省畜牧业标准化技术委员会归口。本标准起草单位:山东省农业科学家禽研究所。本标准主要起草人:孟凯、吴

2、家强、袁小远、宋敏训、张玉霞、杨金兴、艾武、亓丽红。6DB37/T4044—2020禽腺病毒4型荧光定量PCR检测方法1 范围本标准规定了禽腺病毒4型(FAdV-4)荧光定量PCR检测方法。本标准适用于鸡咽喉和泄殖腔拭子及肝脏组织中FAdV-4的检测。2 规范性引用文件下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。GB/T6682 分析实验室用水规格和试验方法3 试验原理实时荧光定量PCR检测是在PCR反应体系中,除采用特异的引物外,还加入了与D

3、NA双链非特异性结合的SYBRGreenI荧光染料。当它与DNA双链结合时,发出荧光,从DNA双链上释放出来时,荧光信号急剧减弱。随着PCR反应的进行,每经过一个循环,收集一次荧光强度信号,这样就可以通过荧光强度变化监测产物量的变化,从而得到一条荧光扩增曲线。4 试剂或材料除非另有说明,在分析中仅使用分析纯的试剂,水为GB/T6682规定的一级水。4.1 10×磷酸盐缓冲液PBS:pH值7.2。4.2 研钵。4.3 病毒DNA提取试剂盒。4.4 SYBRGreenIqPCR混合物。4.5 阳性对照:浓度为1.0×105拷贝/μL的阳性质粒。4.6 阴性对照

4、:水。4.7 DEPC水。5 仪器设备5.1 微量可调移液器:最大量程为10μL、20μL、100μL、1000μL。5.2 台式低温高速离心机:最高转速16000r/min。5.3 分析天平:精度为0.01g。5.4 荧光定量PCR仪:温度范围4.0℃~99.9℃。5.5 冰箱:规格为4℃和-20℃。5.6 二级生物安全柜。6DB37/T4044—20201 引物P1:5’-GTCTATACCAACACGAGCACC-3’P2:5’-TTTTGTACCCGTCGCAGAG-3’2 样品2.1 采集工具棉拭子,剪刀,镊子,1.5mL离心管。2.2 样品采集

5、2.2.1 咽喉拭子/泄殖腔拭子2.2.1.1 咽喉拭子采样:将棉拭子深入喉头来回刮3次,取咽喉分泌液,放于含抗生素(青霉素2000U/mL+链霉素2mg/mL)的10×磷酸盐缓冲液PBS(pH值7.2)的1.5mL离心管中。2.2.1.2 泄殖腔拭子采样:将棉拭子深入泄殖腔转一圈沾取粪便(需有可见粪便),放于含抗生素(青霉素10000U/mL+链霉素10mg/mL)的PBS中。2.2.2 组织样品待检禽无菌采集整个肝脏,装入一次性采样袋或其他灭菌容器,编号。2.3 样品运输与保存样品放于保温箱中加冰,密封,24h内送至实验室,如不能立即检测,需将样品放于

6、-20℃冰箱保存。2.4 样品处理2.4.1 咽喉拭子/泄殖腔拭子将装有咽喉拭子/泄殖腔拭子的1.5mL离心管在振荡器上充分混合后,取出棉拭子,4℃条件下5000r/min离心10min,取上清液转入新的1.5mL离心管中,编号备用。2.4.2 组织样品将组织置于灭菌的研钵中,按照质量体积比(1:5~10)加入灭菌PBS进行充分研磨,4℃条件下5000r/min离心10min,取上清液转入新的1.5mL离心管中,编号备用。3 试验步骤3.1 病毒DNA提取用病毒DNA提取试剂盒,按照说明书步骤提取待检样品的DNA。病毒DNA提取成功后置于-20℃保存备用。

7、3.2 荧光定量PCR反应体系详见表1。6DB37/T4044—2020表1 荧光定量PCR反应体系试剂使用量SYBRGreenIqPCR混合物*10μLPCRForwardPrimer(10μmol/L)1μLPCRReversePrimer(10μmol/L)1μLDNA模板2μLDEPC水6μLTotal20μL每次均应设阴性对照。*内含DNA聚合酶,dNTPMixture,Mg2+和荧光染料SYBRGreen。1.1 荧光定量PCR反应程序设定详见表2。表2 荧光定量PCR反应程序设定阶段1:预变形阶段2:PCR反应阶段3:溶解曲线分析95℃,1m

8、in95℃,5sec95℃,5sec60℃,45sec(收集荧光)

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