细胞总rna的提取操作步骤

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时间:2018-07-11

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1、细胞总RNA的提取操作步骤一、准备1、  物品:Trizol、氯仿(三氯甲烷)、异丙醇、75%灭酶异醇、冷PBS、1.5ml灭酶EP管、灭酶枪头、一次性手套、EP管架、吸管2、  打开冷冻离心机4℃预冷二、操作步骤:将Trizol、氯仿、冷PBS、EP管、灭酶枪头、一次性手套、EP管架、吸管等物品带入细胞室。1、  取出EP管、做好标记2、  取出细胞、收集上清保存备用3、  用冷PBS冲洗细胞两次4、  加入1ml Trizol (24孔板每孔加0.5ml即可),调小刻度用移液器吹打细胞至液体澄清(生化:摇

2、动混匀后室温孵育10min)5、  将裂解液转移至1.5ml灭酶EP管中,用黄枪头加入氯仿0.2ml(1/5 Trizol体积),用手剧烈震摇15秒,置室温5min(生化:3min  dxyer:15min),分层6、  4℃、12000g(12300rcf)离心15min,可见分层。7、  用黄枪头小心收集上层水相约0.5ml置于另一1.5ml灭酶EP管中(确保不要吸入中间层和有机相)。8、  各管分别加入0.5ml异丙醇(等体积),用力摇匀,置室温10min。(提前将异丙醇4℃预冷,或混匀后置-20℃ 6

3、0min,提取效果更好)9、  4℃、12000g离心10min,可见RNA沉淀。10、倒弃上清,用滤纸吸干管口余液,加入预冷的75%灭酶异醇1ml,用指轻弹管壁使RNA沉淀飘起 洗涤。11、4℃、7500g(7700rcf)离心5min,生化为10min,(亦有dxyer用12000g),沉淀即为总RNA。12、弃上清,真空干燥约4min或空气中干燥5~10min,加入20µl(30µl)DEPC水。56℃水浴小于10min助溶,取少量测OD值,其余-70℃保存备RNA制备的问题与解答1、塑料制品、玻璃和金

4、属物品的处理(a)塑料制品:尽可能使用无菌,一次性塑料制品。已标明RNase-Free的塑料制品,如没有开封使用过,通常没有必要再次处理。对于国产塑料制品,原则上都必须处理方可使用。处理方法如下:(1)在玻璃烧杯中注入去离子水,加入DEPC使DEPC的终浓度为0.1%。注意:DEPC为剧毒物,活性很强,小心在通风柜中使用。(2)将待处理的塑料制品放入一个可以高温灭菌的容器中,注入DEPC水溶液,使塑料制品的所有部分都浸泡到溶液中。(3)在通风柜中室温处理过夜。(4)将DEPC水溶液小心倒到废液瓶中,用铝箔封住

5、含已DEPC水处理过的塑料制品的烧杯,高温高压蒸气灭菌至少30分钟。(5)烘箱用合适的温度烘拷至干燥。置于干净处备用。(b)玻璃和金属物品250°C烘烤3小时以上。2、RNase是RNA制备的杀手  RNase酶非常稳定,是导致RNA降解最主要的物质。它在一些极端的条件可以暂时失活,但限制因素去除后有迅速复性。用常规的高温高压蒸气灭菌方法和蛋白抑制剂都不能是RNase完全失活。它广泛存在于人的皮肤上,因此,在与RNA制备有关的分子生物学实验时,必须戴手套。RNase的又一污染源是取液器。根据取液器制造商的要求

6、对取液器进行处理。一般情况下采用用DEPC配制的70%乙醇擦洗取液器的内部和外部,基本达到要求。取RNase-free的物品时必须戴手套。3、采用什么方式纯化总RNA?答:我们提供多种RNA纯化方式,根据您对RNA纯化技术的熟悉程度,选用不同的纯化手段。从产品使用效果看,基于TriBlue的一步法分离总RNA试剂盒(K311,K321系列)无论是新手还熟手都可以得到比较理想的结果。如果您对苯酚过敏,出于对环境的保护,您可以选用整个分离流程都不使用苯酚的试剂盒(K361系列)。从产品形式上,我们的总RNA分离分

7、醇沉淀离心式和离心吸附柱方式两种。沉淀方式总的产量比较高,纯化规模机动,但是纯度不及吸附柱方式;吸附柱方式操作比较简单,纯度高,受吸附容量的影响,产量收到影响。4、什么时候需要分离mRNA?答:常规RT-PCR鉴定基因表达水平的,一般都可以采用总RNA作为RT-PCR的模板,但是做cDNA文库,克隆丰度极低的基因,大多数DD-PCR,削减杂交等需要纯化的mRNA。一般用oligo(dT)-cellulose或在磁珠上偶连oligo(dT),从组织或总RNA种直接分离mRNA。5、如何判定分离的总RNA的纯度?

8、答:需要从两个方面着手,缺一不可,特别是新手(1)测定OD260/OD280的比值,测定时,RNA需要用10mMTris-HCl,pH7.5稀释。理想的RNA,OD260/280在1.9-2.1之间。比值如果过低,可能有蛋白质污染,过高RNA可能已发生降解。(2)琼脂糖变性电泳观察rRNA的完整性和强度。变性电泳需要采用MOPS系统,不可以采用DNA电泳用的TBE或TAE系统。如果OD260/OD2

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