绵羊famb基因mrna组织表达谱

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1、绵羊FAM134B基因mRNA组织表达谱1、相关定义1.1、脓毒症AKI的定义及存在问题AKI是组临床综合征,其临床表现范围广,从血清肌酐(Creatinine,Cr)的微量超标到无尿期肾衰竭,是公认的预后不良的表现。以往对于AKI的临床研究往往局限于严重AKI,即急性肾衰竭(AcuteRenalFailure,ARF)。这种术语上的转变强调了及早发现肾功能病变的重要性,以便能及早进行干预,阻止肾功能向终末期肾衰竭的演变。2002年急性透析质量促进委员会(Acute43DialysisQualityInitiative,ADQI)提出AKI

2、的RIFLE分类法,将AKI分为5个级别:肾损伤危险(Risk)、肾损伤(Injury)、肾衰竭(Failure)、肾功能丧失(Loss)及终末期肾衰竭(End-stage)[4]。其中前三者用来评估肾功能损伤的严重程度,后两个为预测预后情况。RIFLE分类法根据GFR、尿量、血清肌的变化来诊断AKI存在一定的局限性,其灵敏度、特异度较低。2005年急性肾损伤网络协作组(AcuteKidneyInjuryNetwork,AKIN)在RIFLE分类法的基础上,对AKI的定义和诊断标准进行了修订[5]:(1)AKI定义为:3个月内发生的血、尿及

3、组织检测、肾脏结构影像学检查、肾功能及损害生物学标志物的异常。(2)诊断标准:48h内肾功能突然下降,血清肌酐增加≥26.5μmol/L(0.3mg/dL)或≥50%;或尿量≤0.5mlkg-1h-1,持续6h以上。相对RIFLE标准,AKIN标准提高了AKI的敏感性,而去掉GFR项目,更具有临床实用性。尽管以Cr、尿量的变化为诊断依据,具有一定的局限性,如血清肌配水平受年龄、性别、肌肉代谢等多种肾内、外因素的影响,但采用明确的指标及更具包容性的诊断标准为了能及早发现肾脏损害,提高AKI的临床认识与诊断,并进行早期预防、干预,防止肾脏的进一

4、步损害。针对脓毒症AKI,目前国际上尚没有统一的评价标准,仍参用RIFLE分类法进行临床指导[6]。1.2、ESTs的定义和获得Adams(1991)提出了ESTs的概念和构建以ESTs为界标的人类基因组表达图谱的计划。所谓的ESTs即一个cDNA克隆的3,端或夕端己测序部分,每个ESTs代表一个单拷贝的cDNA表达序列,根据测序方法的不同其测得的长度也不同,-般在Zoobp到soobp左右。ESTs通过从cDNA文库中随机挑取cDNA克隆,采用载体上的序列作为测序性南人学硕l一学位论文三种常见虾类热休克蛋白7()川川的克隆及组织表达分析引

5、物,运用双脱氧链终止法对每个克隆进行单向或双向部分自动测序而获得。。DNA测序的结果包含许多序列卜垂叠的ESTss,将这些ESTsS少lJ几同一条序列,称为contig,即认为它们来源于同一个基因。1.3、ESTs(表达序列标签)的定义及应用,缺点是费时费力且一次只能克隆得到一个或少数几个与功能相关的基因。CostanzoF(1983)提出表达序列标签(Expressionsequencetag,ESTs)概念的雏形,他们随机对肝脏cDNA文库测序,证实所测序列可用于研究DNA序列与基因功能之间的关系。Wilcox(1991)和Okubo(

6、1992)几乎同时描述了ESTs技术。关于ESTs技术的应川的首次报道是Adams(1991)等从三种人脑组织cDNA文库随机挑取6的个克降进行测序,得到一组人!I访l全}t织的ES几,分析结果表明其中36个代表已知基因,337个代表未知基因。Craig、Venter等为ESTs技术的发展进行了多年不懈的努力,Craig所在的美国国立卫生院(NIH)运用自动化测序技术,大规模工业化生产ESTs序列,并将ESTs技术从功能基因组学扩展到结构基因组学,直接推动了人类基因组计划(HumanGenomcproject,HGp)的超前完成。人类基因组

7、计划使基因组测序进入高速发展期。在此推动卜,一些模式生物如人肠杆菌、酵母菌、线虫等,和经济生物包括农作物如玉米、水稻、小麦、棉花等以及家禽家畜如猪、鸡、牛、马、羊、兔的基因组计划也相继启动。1992年开始在圣地亚哥每年召开的国际基因组大会,大量的研究成果显示了基因组研究已成为国际卜最前沿的研究领域。随着人类基因组测许和排序工作的完成,以及研究基因表达和蛋白质组为重点的后基因组时代开始了。最初的人类基因表达图谱的构建是从以ESTs测序方法为基础来获得大量ESTs开始的。已测序的ESTs数量随着大规模自动测序技术的发展而增加。在后基因组时代,E

8、STs作为基因表达的时空标签,依然有着重要的意义。可以说,ESTs是连接结构基因组和功能基因组的纽带之一。1.4、MEF2的概念及定位eEnhancerFactor2,MEF2)

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