《基因基因组结构》ppt课件

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1、基因、基因组的结构李凌讨论题基本概念:基因、基因组、基因组学、人类基因组计划真核生物基因组与原核生物基因组有何主要区别?以图解说明真核细胞编码蛋白质的基因的一般结构。第一节基因的概念遗传因子,“一个因子决定一个性状”。“基因论”,基因是直线排列在染色体上的遗传颗粒三位一体的概念:携带生物体遗传信息的结构单位。控制一个特定性状的功能单位。突变单位和交换单位。“一个基因一个酶”“一个顺反子,一条多肽链;一个基因一条多肽链基因的定义基因(gene)合成有功能的蛋白质多肽链或RNA所必需的全部核苷酸序列

2、。一般是DNA序列(或RNA病毒中的RNA)。具有编码一定生物功能分子的核苷酸序列。一个典型的真核基因①编码序列:外显子(exon)②插入外显子之间的非编码序列:内合子(intron)③5'-端和3'-端非翻译区(UTR)④调控序列(可位于上述三种序列中)基因组(genome)是指一种生物体中的整套遗传信息,一般为一个受精卵或一个体细胞的细胞核中所有DNA分子的总和。一特定生物体的整套(单倍体)遗传物质的总和。基因组的大小用全部DNA的碱基对总数表示。每种真核生物的单倍体基因组中的全部DNA量称

3、为C值(C-Value)。人的23对染色体C值(C-Value)第二节原核生物基因组一、细菌基因组的特点细菌染色体基因组:通常仅由一条环状双链DNA分子组成1.细菌DNA大部分为编码序列。2.结构基因中没有内含子,也无重叠现象。3.具有操纵子结构。质粒:某些细菌中独立于染色体外的能自主复制的共价环状双链DNA。第二节原核生物基因组二、病毒基因组的特点1.每种病毒核酸只有一种,或者DNA,或者RNA;2.病毒核酸大小差别很大,3kb-300kb;3.大部分病毒核酸是由一条双链或单链分子(RNA或D

4、NA),仅少数RNA病毒由几个核酸片段组成.4.具有操纵子的结构,具有重叠基因的结构.5.真核病毒基因有内含子,而噬菌体(感染细菌的病毒)基因中无内含子.6.除逆病毒外,所有病毒基因都是单拷贝的。第三节真核生物基因组一、真核生物基因组的特点:1.体细胞内的基因组为二倍体。2.基因组远远大于原核生物的基因组,具有多复制起点。3.基因组中不编码的区域多于编码区域。4.大部分基因含有内含子,因此,基因是不连续的(断裂基因)。5.真核细胞基因转录产物为单顺反子。一个结构基因经过转录和翻译生成一个mRNA

5、分子和一条多肽链。6.单一序列为主,存在大量重复序列。真核生物基因组二、真核基因组中DNA序列的分类(一)高度重复序列(重复次数:>1O6)(二)中度重复序列(重复次数:1O2-1O5)(三)单拷贝序列(UniqueSequence)包括大多数编码蛋白质的结构基因和基因间间隔序列。Typesofrepeat二、真核基因组DNA序列的分类(一)高度重复序列(重复次数>lO6)约占10-60%,在人基因组中约占20%1.卫星DNA(SatelliteDNA)2.反相重复DNA:回文结构:GGTACC

6、CCATGG常见于基因的调控区和特异蛋白结合区。卫星DNA(SatelliteDNA)(二)中度重复序列1.中度重复序列的特点①重复单位序列相似,但不完全一样,②散在分布于基因组中.③序列的长度和拷贝数非常不均一,④中度重复序列一般具有种属特异性,可作为DNA标记.⑤中度重复序列可能是转座元件。(二)中度重复序列2.中度重复序列的分类①longinterspersedrepeatedsegments,LINES,长散在重复序列长度>1000bp(可达7Kb),拷贝数104-105,如人LINES

7、②Shortinterspersedrepeatedsegments,SINES,短散在重复序列长度<500bp,拷贝数>105.如人Alu序列*人类基因组中的重复序列标记1、A1u序列2、可变数目串联重复序列(VNTR)(小微卫星DNA)3、微卫星DNA(microstalliteDNA)1、A1u序列含有Alu酶切位点重复单位长300bp:130bp+31bp+130bp,其5′端有-17-21bp的正向重复序列。通过RNA,再反转录成cDNA,插入人类基因组可转录成hnRNA,但在mRNA

8、成熟过程中被切除2、可变数目串联重复序列Variablenumbertandemrepeat,VNTR.又称小卫星DNA(minisatelliteDNA)短重复单位(6-70bp)串联重复(6-100次以上),核心序列:GGTGGG。VNTR多态性—分子标记—DNA指纹图(fingerprint)3、微卫星DNA(microstalliteDNA)Simplerepeatsequence,SRS2-6个核苷酸组成的重复单位串联重复(10-60次),两侧为特异的单拷贝序列。双核苷酸重复:(AC)

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