1-Materials Studio 与 CASTEP 快速入门.doc

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时间:2018-12-07

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1、unit_MS_quick-start打開MaterialsSautio,它會問是要開始一個新的project還是要打開一個前次的project。如果是第一次用的話要選開啟新的project,如果一旦這樣回答的話,它還問你是什麼project,那我們就給它一個project的名稱。我們現在要以氯化鈉為例,你可以給任何名稱,但是我現在要以NaCl為名稱。一開始進來要先介紹幾個重要的視窗,它們關係到我們進行模擬計算時所會處理及操作到的對象。姑且可以分為這三類:一、進行計算的工作,己跑完的、正在跑的都算;二、計算工作總是有各有些不同的

2、輸入與輸出檔案,我們經常會需要審視結果、修改輸出入的相關設定;三、材料的原子及電子結構3D模型帶有很多我們想要知道之關於這個材料的物性資料,例如晶體的晶胞邊長、原子的元素種類等等。從Veiw的Explorer,它有三個Explorer,jobExploroer、projectexploroer、propertyexplorer。jobexplorer的開跟關是這樣按一次它就開起來。這個是你跑什麼job近端遠端它都可以顯示,跑完了沒有、要不要把它移除等等,在這邊都可以操作,有很多job的時候會很好用。projectexplorer

3、預設值是開著的,就是靠左邊垂直的這一塊,裡面對於跑project的相關物件,如文字輸出、3D結構等等都是在這裡選取,很像微軟視窗(MSWindows)裏頭的『檔案總管』。要做東西總是需要選取一個job相關的目錄等等,所以jobexplorer在操作上來講是很重要的。另外我也常常會打開的是propertyexplorer,propertyexplorer在MS是新的東西,相對Cerius2而言是新的東西。在Cerius2裡如果你想要知道一些3D物件的屬性,像是鍵長、鍵角,晶胞內原子數,就要分別去打開一些相關的表單,它才會印給你看,

4、然而初學者還得學會這些表單藏在那裏。但是現在新的propertyexplorer,你只要是3D物件有呈現的狀況之下,可以直接在上面顯現出來,這些待會都會有例子來為大家介紹。也就是說,這是一個非常方便的東西,你都不必記住要打開哪些選單你才可以看到它,各種可以看得見的特性還有可以改得到的選項通通都是在propertyexplorer。  一個要跑CASTEP的方法,你首先要有晶胞,裡面建立原子結構,你可以透過file==>import打開來進入structure有內建的分類,然後裡面有選單,這個你可以得到,我現在要示範的是你自己用手

5、工輸入氯化鈉的晶體結構,首先的做法先打開newdocument,有很多種類可以選,我們要選3datomisticdocument,確定之後會給出一個空的3d物件的工作稿, 然後到build的地方按crystal,它所打開來的東西首先會要我輸入spacegroup,跟據icsd上查到的是225,把225輸進去,把滑鼠在別的地方點一下它就會顯示出225的fm-3m結構。option裡面偶爾看一下是好,那這個地方目前沒有其它的option,接下來下一步到latticeparameter,裡面不能夠填的都灰色化,能填的在這邊,那它的a是

6、5.64,所以把5.64打進去,其實我已經可以apply了,apply之後它就會做一個出來,那option後面其實可以不用管,其本上是預設就好,這裡的option是為了整個晶包在絕對坐標裡面排列成某個特定方向,這裡可以選,latticeoption這裡orientationstandard,一般而言預設的就可以了。選單關起來,這裡我們已經有一個有空間群、有晶包邊長的model,再來我們要加入原子。從選單上有個+,然後有一顆藍色球,按下去,這就是加原子,選擇我們要的原子Na然後名字它自己會補,abc它預設是用分數坐標abc,我們看

7、icsd告訴我們剛好是零,所以我就加上去,這是第一顆,另外cl在icsd告訴我們是0.50.50.5所以我們也把它加下去,當然我們已經在3d的model裡面看到這個實在是非常像氯化鈉晶體,但是我們為了進一步確認的話很想要看一看某個表單白紙黑字告訴我們NaCl的比例相同,在這個情況下我們來到propertyexplore的filter,filter選單拉下來有3Dlattice,atom,跟symmetrysystem,這個晶包裡面有什麼東西是屬於symmetrysystem的,我們選下去以後所有跟這個晶包symmetrysyst

8、em相關的資訊都會顯現,從cellformula這裡我們可以看到Na4Cl4所以果然確定目前的晶包大小是一個八顆原子的氯化鈉晶包,並且比例是1:1沒有問題,甚至像密度體積等等的這些它都一併給出來,接下來我要補充,如果你打開filter裡面的3dlattice的地

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