质粒构建流程

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1、质粒构建流程一、引物设计1)収得目的基因序列,可选用数据库NCB12)软件分析FI的基因可用酶切位点。使用primer5分析出序列不包含的酶切位点,即为可用没切位点。3)选择载体。根据•转染细胞和实骑室资源,选择合适载体。如pcDNA3.1(+),4)选择酶切位点。对照0的基因可用酶切位点和载体上的酶切位点,选择二者共有的作为备选。载体上两个酶切位点的距离应有几十bp以上,选实验室常用酶切位点。5)使用primer5设计目的基因引物,FI的产物应包含从启动子到终止子企部碱基。6)根裾选择的酶切位点,查找对应的酶切位点保护碱基,将对应片段添加到设计的引物两端

2、,注意酶切位点的前后顺序。一般选择三个保护碱基。7)引物设计完成,送公司合成。二、目的片段获取1.RNA提取试剂盒:Biotcke高纯总RNA快速提取试剂盒离心柱型(裂解液RL4DC、漂洗液RW-20°C保存)准备:冰盒、4°C预冷离心机、EP管2套、吸附柱RA—套操作步骤:1)将lOOOpl裂解液RL加入细胞屮,混合5mino2)加200(.11氣仿混合,震荡15s,室温孵育3min。3)4°C,12000rpm离心lOmin。4)最上层水相转移至新EP管巾(体积约550Ml)5)加入1倍体积(550gl)70%乙醇,混匀6)全部转移到套收集管的吸附柱R

3、A屮,4°C,lOOOOrpm离心45s7)弃废液,重套收集管,加500pl去蛋白液RE,12000rpm离心45s8)弃废液,重套收集管,加700pl去漂洗液RW,12000rpm离心60s9)弃废液,重套收集管,加500Ml去漂洗液RW,12000rpm离心60s10)弃废液,重套收集管,12000rpm空离2min11)吸附柱放入新EP管,加50glRNasefreewater于膜上,室温放貫2min12)4°C,12000rpm离心60s13)点样:5plRNA+lpl10Xbuffer,1.5%琼脂糖凝胶电泳,100V,3min,可见3条亮带。1

4、4)-20°C保存2.RNA反转录试剂盒:TaKaRapriincscriptRTreagentkitwithgDNAeraser(-20°C保存)准备:冰盒,②④⑤⑥取山解冻,①③为酶不可取出,预冷离心管操作步骤:1)基因组DNA去除(10pl体系)②5XgDNAeraserbuffer2pi①gDNAeraserlglTotalRNA4jJ(可根据RNA浓度调整)©RNasefreewaterPCR仪中进行,程序:42°C,2min->4cC注:RNA的量可根据浓度调整,混合液冰上配制,酶最后加入2)反转录反应(20pl体系)④5XprimerScri

5、ptbuffer24gl②primerScriptRTenzymemixI1pi⑤RTprimermix1pi⑥RNasefreewater4}.il1)反应液10ulPCR仪:37°C,15min^85°C,5s^4°C注:可直接将第2步反混合液好后加入到第1步反应液屮3)1.5mlEP管收集,-2CTC长期保存3.PCR扩增高保真酶primerstar扩增,50(il体系如•卜5XPSbuffer10glPCR程序:dNTP4pl95°C5min1dH2O32.5gl95°C30sIPrimerstar0.5gl56°C30sJ35cyclecDNAi

6、y(可变)72°ClminR-primerlpl72°ClOminF-primerlul注:可根据不同基因调节返货温度,延伸时间,循环数。点样:5(11?€尺产物+1(_116乂1)1^0',1.5%琼脂糖凝胶电泳,100V,15min4.PCR产物纯化1)液相纯化(产物电泳结果只含目的条带)试剂盒:Microelutecycle-purespinprotocol(OMEGAbio-tek)D6293-01①将PCR产物加入1.5mlEP管,加入5倍体积bufferCP,混匀。②转移至HiBindMicroElutionDNA柱(套收集管),室温离心100

7、00g,lmin。③弃废液,At)700glDNAwashbuffer(含乙醇)到柱子,室温离心10000g,Imino④弃废液,重复③⑤弃废液,空管离心13000g,lmin⑥柱子放入新EP宵,加10-20plElutionbuffer到膜上,室温孵育3-5min,离心10000g,lmin⑦电泳检测2)割胶回收(产物电泳结果含杂带)①将含目的条带的琼脂糖凝胶切下(切得尽量小),放入1.5mlEP管。②加等体积(lg=lml)bindingbuffer(XP2),60°C金属浴7min左右至胶溶解(溶液为淡黄色),混匀2min③溶液加入离心柱,离心100

8、00g,lmin,废液倒冋再离一次④弃废液,加3OOplbindi

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