鸭oih、fshβ基因多态性及其与产蛋性状的关联研究

鸭oih、fshβ基因多态性及其与产蛋性状的关联研究

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1、华中农业大学硕士学位论文鸭O/H,脚基因多态性及其与产蛋性状的关联研究StudiesonPolymoprhisms0fDuckO/HAndFsHBGoneandTheirAssociationsWithEggPerformence硕士研究生:王蒙学号:2011302110028指导教师:龚炎长教授指导小组:龚炎长教授彭秀丽副教授俸艳萍副教授李世军副教授专业:动物遗传育种与繁殖研究方向:家禽分子育种获得学位名称:农学硕士获得学位时间:2015.06华中农业大学动物科技学院与动物医学院二。一五年六月万方数据华中农业大学学位论文独创性声明及使用授权

2、书学位论文是否保密吞如需保密,解密时间年月目独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究_-E作及取得的研究成果。尽我所知,除了文中特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果,也不包含为获得华中农业大学或其他教育机构的学位或证书而使用过的材料,指导教师对此进行了审定。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中做了明确的说明,并表示了谢意。研究生签名:.王豪时间:加I岁年占月·7日’㈨黼牦王彖’名:彦哌签名日期:扣彦年6月17日签名日期:纱c沣么月f7日万方数据鸭OItL劂基因多态性及其与

3、产蛋性状关联研究目录中文摘要..iABSTRACT..iii缩略词表.v1文献综述.11.1研究课题的由来l1.2DNA分子标记及其应用..11.3鸭基因组研究现状31.4本研究涉及的候选基因研究现状31.4.1卵(类粘蛋白)抑制剂基因31.4.2促卵泡激素基因41.5研究的目的和意义52实验材料和方法.62.1实验材料62.1.1实验鸭群与生产性状资料62.1.2主要实验仪器和设备62.1.3主要试剂72.I.4常用溶液及其配制72.1.5主要分子生物学软件和分子生物学网站92.2实验方法92.2.1鸭血基因组DNA提取与检测..92.2.

4、2总RNA提取102.2.3cDNA样品准备102.2.4PCR扩增条件及产物检测112.2.5PCR产物酶切体系及检测112.2.6DNA池的构建..122.2.7PCR产物测序与序列比对分析122.3引物设计.132.3.1鸭。!.孵基因引物设计132.3.2鸭FSHfl基因引物设计13万方数据华中农业大学2015届硕士研究生学位(毕业)论文2.4数据统计.142.4.1基因型频率和等位基因频率142.4.2Hardy-Weinberg群体遗传平衡检验及卡方适合度检验142.4.3基因型与性状关联分析143结果与分析153.1鸭0111基

5、因结果153.1.1OIH基因引物扩增153.1.2DNA池的PCR产物测序.163.1.3011-1基因A一316G位点及其与产蛋性状关联分析.173.1.4OIH基因A.1287C位点及其与产蛋性状关联分析193.1.5A一316G和A一1287C位点重构单倍型与产蛋性状关联分析.2l3.2鸭脚基因结果一233.2.1鸭FSHfl基因引物扩增233.2.2DNA池的PCR产物测序.233.2.3脚基因C一82G位点及其与产蛋性状关联分析.243.2.4脚基因T-308G位点及其与产蛋性状关联分析273.2.5C一82G和T.308G位点重

6、构单倍型与产蛋性状关联分析.284讨{念..3l4.1鸭Off/基因多态性与多个产蛋性状相关314.2鸭脚基因具有高度多态性一324.3鸭脚基因变异会影响鸭的产蛋性状..325小结..346结论和展望356.1本研究已取得结果.356.2本研究的特色.356.3本研究的不足和下一步研究设想.35参考文献36附录..4l致谢一44II万方数据鸭OIH,FSHfl基因多态性及其与产蛋性状关联研究中文摘要本研究以卵抑制剂(011-1)基因和促卵泡激素(FSH,a)基因为鸭产蛋性状相关候选基因,先克隆获得了两基因部分序列,并采用DNA池技术检测了两基

7、因的DNA多态性,两个基因各选择两个SNP位点做PCR-RFLP,以连城白鸭与白改鸭杂交第3代群体为材料,检测各个体的基因型并研究性状的关联,主要研究结果如下:1.克隆获得了鸭卵抑制剂(D脚基因Exonl0一Exonl2和Intoml0一Intoml2的部分序列,采用DNA池加测序的方法对鸭卵抑制剂(D四)基因编码区及其侧翼序列进行SNP扫描,共检测到4个新的SNP位点,其中位点c.316A>G和C.1287A>C分别导致了限制性内切酶AccI和AluI酶切位点多态性的改变。在连城白鸭与白改鸭杂交第3世代群体中,c.316A>G位点等位基因G

8、和A频率分别为0.33和O.67,c.1287A>C位点等位基因C和A频率分别为O.91和O.09;关联分析结果显示,位点c.316A>G与群体的420天产蛋量(P

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