日本血吸虫转录组学研究

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1、博士学位论文日本血吸虫转录组学研究所院：姓名：导师：指导教师：学科专业：研究方向：完成日期：病原生物学研究所刘帅洪涛院士陈启军教授病原生物学分子寄生虫学2012年5月31日独创性声明IIIIlllllllll(1lllll(1<((UllllflllY2123833本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。论文中除了特别加以标注和致谢的地方外，不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得其他教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。学

2、位论文作者签名：签字日期：≯夕位年歹月岁／日学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解j匕塞迹塑医堂瞳有关保存、使用学位论文的管理办法。有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅。本人授权j星塞拯塑医堂院可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。(保密的学位论文在解密后适用本授权书)学位论文作者签名：妒导师签名：递f弩签字日期：7．夕／2年y月≥f日签字日期：夕汐厶2年．歹月罗J日学位论文作者毕业后去向：工作单位：通讯地址：电话：邮编：目录摘要⋯⋯

3、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．1Abstract⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．3前言⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯5日IJ舌⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯)一、血吸虫与血吸虫病概述⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯5二、血吸虫基因组最新研究进展⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯7三、血吸虫转录组学研究进展⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯12材料与方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．19一、实验材料⋯⋯⋯⋯⋯

4、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯19二、实验方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯21实验结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．241．日本血吸虫虫体总RNA质检结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯242．日本血吸虫寡核苷酸芯片的序列及探针信息⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯303．日本血吸虫寡核苷酸芯片可靠性分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯304．日本血吸虫看家基因分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯365．日本血吸虫基因组预测基因的qPCR验证⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯476．日本

5、血吸虫不同发育阶段虫体差异表达基因分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯487．雌雄成虫差异表达基因分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯558．不同终宿主体内成虫基因组表达谱比较分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯599．日本血吸虫全基因组蛋白酶表达谱分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯61讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯66总结⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯69参考文献⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．70附录⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯80附录I英语缩略词列

6、表⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯80附录11日本血吸虫249个蛋白酶基因的表达谱数据⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯81附录III在学期间发表的学术论文⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯90致谢⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯91摘要血吸虫病是一种严重危害人类健康的寄生虫疾病，主要流行于热带和亚热带的76个国家及地区，我国流行的是日本血吸虫病。2009年，日本血吸虫和曼氏血吸虫基因组草图公布，为实现世界范围控制和消除血吸虫病的战略目标提供了前所未有的生物信息资源和平台。本研究依据最新公布的日本血吸虫基因组序

7、列信息构建寡核苷酸芯片，并将其应用于虫卵、尾蚴、肝期童虫和成虫四个发育阶段的基因表达谱解析研究，为从分子水平揭示血吸虫生长发育机制、致病机理以及血吸虫与宿主相互作用机理奠定基础，为寻找新的抗血吸虫病药物标靶及疫苗候选分子提供思路；同时，应用该芯片比较分析了我国血吸虫病主要传染源宿主．水牛体内成虫与日本血吸虫病研究常用实验动物．新西兰大白兔、BALB／c小鼠以及C57BL／6d、鼠体内成虫基因表达谱差异，为血吸虫病动物模型研究成果转化应用于家畜血吸虫病的预防治疗提供理论依据。所取得的研究结果如下：1．日本血吸虫寡核苷酸芯片构建及可靠性分析本研究首次

8、利用最新公布的日本血吸虫基因组序列构建了目前为止包含日本血吸虫基因信息量最大的寡核苷酸芯片。对14组血吸虫样本各进行三次生物学重复杂交实