b外源性dna残留量测定法

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1、附录ⅨB外源性DNA残留量测定法第一法DNA探针杂交法供试品中的外源性DNA经变性为单链后吸附于固相膜上,在一定温度下可与相匹配的单链DNA复性而重新结合成为双链DNA,称为杂交。将特异性单链DNA探针标记后,与吸附在固相膜上的供试品单链DNA杂交,并使用与标记物相应的显示系统显示杂交结果,与已知含量的阳性DNA对照比对后,可测定供试品中外源性DNA的含量。试剂(1)DNA标记和检测试剂盒(2)DNA杂交膜尼龙膜或硝酸纤维素膜。(3)2%蛋白酶K溶液称取蛋白酶K0.20g,溶于灭菌水10ml中,分装后储藏于-20℃备用。(4)3%牛血清白蛋

2、白溶液称取牛血清白蛋白0.30g,溶于灭菌水10ml中。(5)1mol/L三羟甲基氨基甲烷(Tris)溶液(pH8.0)用盐酸调pH值至8.0。(6)5.0mol/L氯化钠溶液(7)0.5mol/L乙二胺四乙酸二钠溶液(pH8.0)用10mol/L氢氧化钠溶液调节pH至8.0。(8)20%十二烷基硫酸钠(SDS)溶液用盐酸调pH至7.2。(9)蛋白酶缓冲液(pH8.0)量取1mol/LTris溶液1.0ml(pH8.0),5mol/L氯化钠溶液2.0ml,0.5mol/L乙二胺四乙酸二钠溶液(pH8.0)2.0ml,20%SDS溶液2.5m

3、l,加灭菌水至10ml。(10)TE缓冲液(pH8.0)量取1mol/LTris溶液(pH8.0)10ml,0.5mol/L乙二胺四乙酸二钠溶液(pH8.0)2ml,加灭菌水至1000ml。(11)1%鱼精DNA溶液精密称取鱼精DNA0.10g,置10ml量瓶中,用TE缓冲液溶解并稀释至刻度,摇匀,用7号针头反复抽打以剪切DNA成为小分子,分装后贮藏于-20℃备用。(12)DNA稀释液取1%鱼精DNA溶液50μl,加TE缓冲液至10ml。用于探针标记和阳性对照的DNA制备用于探针标记和阳性对照的DNA,由生产供试品用的传代细胞、工程菌或杂交

4、瘤细胞提取纯化获得,其提纯和鉴定可参考下述推荐方案进行,具体方法可参考《分子克隆实验指南》([美]J.萨姆布鲁克等著,黄培堂等译,科学出版社,2002)或《精编分子生物学实验指南》([美]F.奥斯伯等著,颜子颖、王海林译,科学出版社,1998)。将待提取的细胞基质悬液的细胞浓度调整为每1ml含107个细胞,如果为细菌,则将其浓度调整为每1ml含108个细胞细菌。取悬液1ml,离心,在沉淀中加裂解液400μl混匀,37℃作用12~24小时后,加入饱和酚溶液450μl,剧烈混合,以每分钟10000转离心10分钟,转移上层液体,以饱和酚溶液450

5、μl重复抽提一次;转移上层液体,加入三氯甲烷450μl,剧烈混匀,以每分钟10000转离心10分钟;转移上层液体,加入pH5.2的3mol/L醋酸钠溶液40μl,充分混合,再加入-20℃以下的无水乙醇1ml,充分混合,-20℃以下作用2小时,以每分钟15000转离心15分钟;用适量-20℃70%乙醇溶液洗涤沉淀1次,以每分钟15000转离心15分钟,弃上清液,保留沉淀,吹至干燥后,加适量灭菌TE缓冲液溶解,RNase酶切,酚/三氯甲烷抽提,分子筛纯化DNA,即得。用1%琼脂糖凝胶电泳法和分光光度法鉴定阳性对照品的DNA纯度:应无RNA和寡核

6、苷酸存在;A260/A280比值应在1.8~2.0之间(测定时将供试品稀释至A260为0.2~1.0)。用于阳性对照和标记探针的DNA在使用前应进行酶切或超声波处理,使其片断大小适合于DNA杂交和探针标记。阳性对照品的DNA浓度根据下式计算DNA浓度(ng/μl)=50×A260阳性对照品可分装于适宜的小管中,-20℃以下保存,长期使用。探针的标记按试剂盒使用说明书进行。测定法(1)蛋白酶K预处理按下表对供试品、阳性和阴性对照进行加样,混合后37℃保温4小时以上,以保证酶切反应完全。加样量2%蛋白酶K溶液蛋白酶缓冲液3%牛血清白蛋白溶液加水

7、至终体积供试品100μl1μl1μl200μlD1100μl1μl1μl适量200μlD2100μl1μl1μl适量200μlD3100μl1μl1μl适量200μl阴性100μl1μl1μl适量200μl注意事项:供试品的稀释根据成品最大使用剂量,用DNA稀释液将供试品(原液)稀释至每100μl含1人份剂量;如成品最大使用剂量较大,而供试品的蛋白含量较低,可用DNA稀释液将供试品稀释至每100μl含1/10人份剂量或每100μl含1/100人份剂量。D1、D2、D3为稀释的阳性DNA对照。用DNA稀释液稀释至每1ml中含DNA1000ng

8、。然后依次10倍稀释成10ng/100μl(D1)、1ng/100μl(D2)、100pg/100μl(D3)三个稀释度;如成品使用剂量较大,而且DNA限量要求(100pg/剂量

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