鳜鱼泛素连接酶基因的克隆、表达及功能研究

鳜鱼泛素连接酶基因的克隆、表达及功能研究

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1、中山大学硕士学位论文鳜鱼泛素连接酶基因的克隆、表达及功能研究姓名:张慧申请学位级别:硕士专业:水生生物学指导教师:何建国20070609张慧中山大学硕士学位论文鳜鱼泛素连接酶基因的克隆、表达及功能研究专业:水生生物学硕士生:张慧导师:何建国教授中文摘要鳜鱼(SinlpercaChuatsi)是我国重要的养殖品种,而近年来传染性脾肾坏死病毒(infectiousspleenandkidneynecrosisvirus,ISKNV)对鳜鱼养殖造成了严重的经济损失.为了研究病毒与宿主的相互作用,在ISKNV感染鳜鱼的抑制性消减杂交eDNA文库基础上,经NCBI数据库比对分析后发现有一个与泛

2、素连接酶E3基因序列比较相似的EST(expressedsequencetag,EST).泛素连接酶E3是uPP(ubiquitinproteasomepathway)途径中一种重要酶,对底物蛋白的特异性识别起重要作用。根据以上EST,通过eDNA末端快速扩增技术成功获取了鳜鱼E3基因的eDNA全长。该基因eDNA全长3833bp。有一个330bp的5,非翻译区(5'-UTR)和一个932bp的3’非翻译区(3'-UTR),在3’非翻译区有一个很典型的加尾信号(AATAAA).E3全长eDNA含一个长达2571bp的开放阅读框(openreadingframe,ORF),编码856个

3、氨基酸的蛋白质,经生物信息学分析,预测该蛋白分子量为98195.52Daltous,等电点为5.054。比对发现该蛋白为一种E6-AP的泛素连接酶,在其C端有一个保守的约350个氨基酸的HECT(HomologoustotheE6-APCarboxylTerminus)结构域。实时荧光定量PCR检测组织分布的结果显示。该E3基因几乎在各个组织中都有分布.其中,血细胞中的含量最高,而腮中最张慧中山大学硕士学位论文少。进行了鳜鱼E3的大肠杆菌原核表达。以pGEX-4T-1原核表达载体成功构建了pGEX-E3质粒并分别转化BL21(DE3)后获得了目的蛋白的高效表达,且表达蛋白可溶性良好。

4、.蛋白印迹实验证实了正确表达了目的蛋白.为了进一出研究该基因的功能,采用经典的体外泛素化实验,验证该E3泛素连接酶的活性.采用UbcH2,UbcH3,UbcH5a,UbcH5c,UbcH7,UbcH9,UbcHl0,UbcHl2,E2.MFC鳜鱼E2)8种不同类型的泛素聚合酶E2与该E3进行体外泛素化实验,发现其可以与UbcH5a以及UbcH7协作完成体外泛素化;另外还跟鳜鱼的自身的泛素聚合酶E2作用,并且两者之问体外泛素化作用最强.这些结果表明该蛋白具有E3泛素连接酶活性。本文首次从鳜鱼中获得E3全长eDNA序列,并证明了其泛素连接酶活性。uPP途径是生命活动过程中重要的蛋白代谢途

5、径之一,因此,本文为uPP途径在鳜鱼体内生理作用的研究奠定了坚实的基础,同时也为进一步研究鳜鱼与病毒侵染过程中uPP途径的作用开拓了方向,对于研究ISKNV与宿主问的相互作用具有重要的意义。关键词:鳜鱼,泛素连接酶,体外泛素化Ⅱ张慧中山大学硕士学位论文Molecularcloning,expressionandfunctionalreasearhofubiquitinligaseE3frommandarinfish,SinipercaChuatsiMajor:HydrobiologyMastercandidate:ZhangHlliSupervisor:ProfessorHeJian

6、guo,Ph.DInthelastdecade,sig

7、1iljcameconomiclossesinculturedmandarinfish,Sinipercachuatsi,havebeenattn'butedtooutbreaksofinfectiousspleenandkidneyneurosisvirus(IsⅪqv).Inordertostudytheinteractionbetweenthevirusandthehost,suppressionsubtractivecDNAhnorarieswere:constructedfromspleensofmock-andISK

8、NVinfectedmandarinfishinourlab.AcomplementaryDNA(cDNA)fragmentwithsequencesimilartoubiquitinligaseE3,aproteinthathasakeyfunctioninrecognizingthesubstratesinuPP(ubiquitinproteasomepathway).wasthenchosenfromthislibraryforfurtherstud

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