遗传变异与食管癌和小细胞肺癌生存的关联研究

遗传变异与食管癌和小细胞肺癌生存的关联研究

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1、学校代码:10023学号:B2010003025博士学位论文遗传变异与食管癌和小细胞肺癌生存的关联研究●■·●⋯.”●J●1一●■一AssociatlOnsOlWeUetlcVarlatlonSancI3UrVlVal0IPatientswithEsophagealorSmall—CellLungCancer所院:北京协和医学院中国医学科学院肿瘤医院肿瘤研究所姓名:指导教师:导师小组:学科专业:研究方向:完成日期:李栋林东听教授陆士新高燕宁谭文教授肿瘤学肿瘤的发生机制及其遗传易感性2013年4月目录图索引⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

2、.1表索引⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯2中英文缩略词表⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..3中文摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯:⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯4英文摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.5第一部分⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯7引言⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.8材料和方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..14结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

3、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..32{寸论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..57参考文献⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯61第二部分⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..68引言⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..69材料和方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一7l结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一75讨论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

4、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..88参考文献⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..9l基金资助⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一98文献综述⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯..99至5[谢⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯121个人简历⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯122独创性声明⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.123北京协和医学院中国医学科学院博士学位论文/李栋图索弓

5、图索引图1.1.rs7242481G>A变异电泳迁移率变动实验结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯32图1.2.与SLC39A6rs7242481G/A结合转录因子的预测⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯33图1.3.SLC39A6在食管癌组织中的表达改变⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯35图1—4.SLC39A6蛋白表达水平与食管癌患者总生存的Kaplan.Meier生存曲线图.37图1.5.食管癌细胞系中SLC39A6mRNA和蛋白水平的表达⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.38图1-6.siI矾A下调YES2和KYSE450中SLC39A6的表达⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯39图1.7.抑制SLC39A6表

6、达对YES2和KYSE450细胞增殖的影响⋯⋯⋯⋯⋯⋯40图1.8.抑制SLC39A6表达对YES2和KYSE450细胞迁移和侵袭能力的影响⋯.4l图1-9.抑制SLC39A6表达对YES2和KYSE450细胞周期和细胞凋亡的影响⋯.43图1—10.抑制SLC39A16表达对上皮间质转化的影响⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯43图1—11.对照组和实验组差异基因聚类分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯.45图2.1.不同风险组小细胞肺癌患者Kaplan-Meier生存曲线图⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯80图2.2.rs4809957和rs716274与小细胞肺癌生存相关的分层分析⋯⋯⋯⋯

7、⋯⋯..82图2.3.rsl878022和rs36600与小细胞肺癌生存相关的分层分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯83北京协和医学院巾国医学科学院博士学位论文/李栋表索弓表索引表1.1.食管癌总生存全基因组关联研究中患者的基本资料⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯11表1.2.rsl050631和rs7242481不同基因型与食管癌患者总生存的死亡风险比⋯.12表1.3.质谱鉴定与rs7242481G/A探针结合的转录因子⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯34表1—4.SLC39A6在不同临床特征食管癌患者组织中的表达差异⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯36表l一5.差异基因GeneOntology生物功能富集分析⋯⋯⋯

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