ⅰ型胶原分子模拟

《ⅰ型胶原分子模拟》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、Reminiscence：mo&cu&rmo幽llingoft)pe1-collagenACKNoWLEDGEMENTSThisworkwascarriedoutduringtheyearsSeptember2001一August2003attheKeyLaboratoryofchemistryandleatherengineeringdepartmentofMinistryofEducationSichuanUniversityChengdu．SichuanProvinceP．R．China．1wouldliketoexpressmygratitudetoProfes

2、sorBiShi，forhisguidance，continuousoptimismconcerningthiswork，encouragementandsupport．IalsoexpressmywarmestgratitudetoProfessorWuyongChen，whohelpedmesortoutallmydifficultiesandwithcontinuoushelpfulfeedback．AuthorwishestospecialthankstoDr．E．M．BrownofERRC，ARS．PA．USA；Dr．B．BmdskyofDepartmento

3、fChemistry，RutgersUniversity，NJ．USA；Prof．A．D．CovingtonofUCNNorthamptonUK；andProf．D．JProckopandDr．OrgeiofDepartmentofBiologicalSciences，UniversityofStirling，UKforprovidingmanyhelpfulcomments，picturesanddata．1wouldliketothankMrLuZhongbing，Mr．LiaoXu印in，MissLiuXin，MissJulia，Mr．ZhiHong，Dr．Pen

4、gandespeciallyMr．XiongXizhufortheirfriendshipandassistance1wouldalsoliketothankmywifeLubnaforreadingthemanuscriptandprovidingmanyhelpfulcommentsandmydaughterHaffaforherlove．Iowemygratitudetomybrothersandsistersandallthefamilymembersfortheirunendingfaithandsupport．IacknowledgetheKeylabora

5、toryofleatherchemistryandengineeringofMinistryofEducationforfinancialsupportforthisproject．Andfinallytoallthose(toomanytomention)whomadelivinginChengduenjoyable．2Reminiscencemolecularmodellingoftype1-collagenI型胶原分子模拟的总结摘要这篇报告试图在以下方面提供～些思路：目前我们对I型胶原计算机分了模拟的知识了解多少?对胶原在原予水平上和不同配体作用时，形成稳定的交联

6、方面还有多少不了解?分子模拟是理解和探索胶原的结构一功能关系的有效工具。Chen等人所建立的胶原二股螺旋和微纤维结构的计算机三维模型所具有的参数与x一射线衍射及其他人研究结果报吻合。从确定两条三股螺旋(Gly．Pro-Pro)5之间可能的相互作用中得到的结构信息，被用以协助研究五条三股螺旋(Gly．Pro．Pro)12在“Smith”微纤维结构模型中的装配作用。结果表明，当脯氨酸在x、Y位置都出现的时候，BO(Gly-Pro—Pro)。，微纤维结构的稳定主要依赖于范德华作用。然而，当极性氨基酸如羟基脯氨酸，或侧链残基很短的氨基酸，如丙氨酸存在时，静电作用则很重要。同时需

7、要提及的是，范德华非键相互作用对微纤维结构的形成是至关重要的。然而，静电相互作用进一步提高了其稳定性，也决定了胶原分子之间作用的特异性。近来的分子模型显示了这种方法的一些局限性，主要在于合适的三股螺旋、I型胶原微纤维结构模型的大小。没有理由认为从20倍长的胶原序列中选择此片断是合理的，此外计算过程中的方向性也是随机的。Chen等使用的模型在这方面表现稍好。但由于片断大小和计算机资源的关系，他们的模型对于溶液系统也是无能为力的。配体的几何结构参数很可能主要是对胶原分子成束或微纤维结构形成的途径的确定。可能的活性点、特别的交联作用依赖于I型胶