虚拟筛 选与新 药发 现

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1、第17卷第2期生命科学Vol.17,No.22005年4月ChineseBulletinofLifeSciencesApr.,2005文章编号:1004-0374(2005)02-0125-07·技术与应用·虚拟筛选与新药发现李洪林1,沈建华2,罗小民2,沈旭2,朱维良2,王希诚1,陈凯先2,蒋华良2,3*(1大连理工大学工程力学系,大连116023;2中国科学院上海生命科学研究院上海药物研究所新药研究国家重点实验室药物发现与设计中心,上海201203;3华东理工大学药学院,上海200237)摘 要:虚拟筛选是创新药物研究的新方法和新技术

2、,近年来引起了研究机构和制药公司的高度重视,并且已经成为一种与高通量筛选互补的实用化工具,加入到了创新药物研究的工作流程(pipeline)中。本文介绍国际上虚拟筛选及其在创新药物发现中应用的研究进展,特别介绍了我国这方面研究的状况。关键词:虚拟筛选;分子对接;药物设计;功能基因组中图分类号:R965.1  文献标识码:AVirtualscreeningandnewdrugdiscoveryLIHong-Lin1,SHENJian-Hua2,LUOXiao-Min2,SHENXu2,ZHUWei-Liang2,WANGXi-Cheng1,

3、CHENKai-Xian2,JIANGHua-Liang2,3*(1DepartmentofEngineeringMechanics,DalianUniversityofTechnology,Dalian116023,China;2DrugDiscoveryandDesignCenter,StateKeyLaboratoryofDrugResearch,ShanghaiInstituteofMateriaMedica,ShanghaiInstitutesforBiologicalSciences,ChineseAcademyofScien

4、ces,Shanghai201203,China;3SchoolofPharmacy,EastChinaUniversityofScienceandTechnology,Shanghai200237,China)Abstract:Asanewmethodortechnologyfordrugdiscovery,virtualscreeninghasbeenappreciatedbyresearchinstitutionsandbigpharmaceuticalcompanies.Moreover,virtualscreeninghasbe

5、eninvolvedintothepipe-lineofdrugdiscoveryanddevelopmentasapracticaltoolcomplementedwithhighthroughputempiricalscreening.Inthisreview,wewillintroducerecentadvancesinvirtualscreeninganditsfunctioninnewdrugdiscovery.Inparticular,wewilldiscusstheresearchsituationofvirtualscre

6、eninginourcountry.Keywords:virtualscreening;moleculardocking;drugdesign;functionalgenome20世纪下半叶以来,生命科学和生物技术的研等)计划的实施,深刻地改变了药物研究与开发的究成果成为最激动人心的科学成就之一。这些领域思路和策略,形成了新药研究的新模式——从基因日新月异的发展,推动药物研究与医药产业进入了组到药物(图1)[1~2]。这就是首先通过功能基因组研一个大变革的新时代。人类基因组计划的完成以及究,从细胞和分子层次弄清疾病发生的机制与防治后续功能

7、基因组(结构基因组、蛋白质组和代谢组的机理,发现并确证药物作用的靶标,然后有的放收稿日期:2005-02-24基金项目:“973”项目(2002CB512802)作者简介:李洪林(1979—),男,在读博士生;沈建华(1965—),男,博士,研究员,博士生导师;罗小民(1970—),男,博士,副研究员;沈 旭(1964—),男,研究员,博士生导师;朱维良(1963—),男,博士,研究员,博士生导师;王希诚(1948—),男,教授,博士生导师;陈凯先(1945—),男,博士,研究员,博士生导师,中国科学院院士;蒋华良(1965—),研究员,

8、博士生导师,*通讯作者。126生命科学第17卷图1 后基因组时代创新药物研究新模式矢地寻找药物。因此,现在的新药研究与开发由三生物大分子结构的药物设计(structure-baseddrug部

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