林木半同胞子代测定遗传模型统计分析及软件开发

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1、分类号S722.3学位代码309密级学校代码10298学号3120423南京林业大学硕士研究生学位论文论文题目：林木半同胞子代测定遗传模型统计分析及软件开发作者：王德源专业：林木遗传育种研究方向：森林遗传学指导教师：童春发教授二○一五年六月学位论文原创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下进行的研究工作所取得的成果。’尽我所知，除文中已经特别注明引用的内容和致谢的地方外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写过的研究成果。对本文的研究做出重要贡献的个人和集体，均已在文中以明确方式注明并表示感谢。本人完全意识到本声明的法律结果由本人承担。学

2、位论文作者(本人签名)：別巧多年Z月曰学位论文出版授权书本人及导师完全同意《中国博士学位论文全文数据库出版章程》、《中国优秀硕士学位论文全文数据库出版章程》（以下简称“章程”，见WWW.cnki.net)，愿意将本人的学位论文提交“中国学术期刊（光盘版）电子杂志社”在《中国博士学位论文全文数据库》、《中国优秀硕士学位论文全文数据库》中全文发表和以电子、网络形式公开出版，并同意编入CNKI《中国知识资源总库》，在《中国博硕士学位论文评价数据库》中使用和在互联网上传播，同意按“章程”规定享受相关权益。论文密级：^公开□保密（_年_月至_年_月）（保密的#像备式在辦f后

3、雇遂守此你试）作者签名：导师签名:年汐月^5曰加/厂年乡月ST日致谢岁月如梭，转眼间，三年的研究生生活即将结束，站在毕业的门槛上，回首往昔，奋斗和辛劳成为丝丝记忆，甜美与欢笑也都尘埃落定。母校以其优良的学习风气、严谨的科研氛围教我求学，以其博大包容的情怀胸襟、浪漫充实的校园生活育我成人。值此毕业论文完成之际，我谨向所有关心、爱护、帮助我的人们表示最诚挚的感谢与最美好的祝愿！本论文是在导师童春发教授的悉心指导之下完成的。三年来，导师渊博的专业知识，严谨的治学态度，精益求精的工作作风，诲人不倦的高尚师德，朴实无华、平易近人的人格魅力对我影响深远。导师不仅授我以文，而

4、且教我做人，虽历时三载，却赋予我终生受益无穷之道。本论文从选题到完成，几易其稿，每一步都是在导师的指导下完成的，倾注了导师大量的心血，在此我向我的导师童春发教授表示深切的谢意与祝福！论文的完成，亦要感谢林木遗传育种学科的王章荣教授、黄敏仁教授、施季森教授、尹佟明教授、徐立安教授、诸葛强教授、季孔庶教授、徐进教授、李火根教授、潘惠新教授、陈金慧教授、席梦利教授、陈英副教授、胥猛副教授、程强副教授、边黎明副教授、刘光欣老师以及赵利达老师等给予的指导和帮助。祝老师们身体健康，工作顺利！感谢一直关心与支持我的同学和朋友们，感谢你们的鼓励和帮助。还要感谢60635实验室的兄

5、弟姐妹以及林学院2012级科硕一班的全体研究生同学，三年来，我们朝夕相处，共同进步，感谢你们给予我的所有关心和帮助。祝大家前程似锦、永远幸福快乐！同窗之谊，我将终生难忘！最后，要特别感谢我的父母和家人，谢谢你们一如既往的支持鼓励与理解包容，无论何时何地，你们都是我坚强的后盾，你们对我无私的爱与照顾是我不断前进的动力。硕士研究生阶段的学业即将完成，我将带着师长、家人和朋友的鼓励和期望，迈入人生的崭新阶段。作者：王德源二○一○年六月六日摘要子代测定是林木遗传改良中的关键环节，直接影响着林木育种计划的进程。通过子代测定获得的表型数据可以对遗传力等遗传参数进行估算，为育种

6、材料的评价和选择提供可靠依据，促进林木遗传改良的进程。但是有关子代测定试验的遗传参数及其统计量的计算还存在不少问题，加之林木遗传育种群体大、周期长，得到的试验数据大多是不平衡的，增加了统计分析的难度。虽然SAS、ASReml等统计软件通过编程可以实现一些遗传参数的分析计算，但是这对于很多育种工作者来说还是比较困难的。本研究的目的在于阐明林木半同胞子代测定试验中遗传参数计算的相关统计理论和方法，并开发相应的R语言计算程序包，为遗传参数的计算提供一个简单有效的工具。针对林木多地点半同胞子代测定遗传模型中的平衡和不平衡试验数据，首先建立固定效应模型，使用最小二乘法（ML

7、S）估计家系亲本的一般配合力及其他固定效应。其次，建立随机效应模型，使用方差分析法（ANOVA）得到方差分量和遗传协方差的估计，进而计算遗传力。同时，还推导了每一个参数估计的标准误和方差分量假设检验统计量的计算公式。对于多个数量性状，给出了任意两个性状在家系效应、地点与家系互作效应以及地点内区组与家系互作效应水平上的遗传相关系数及其标准误的计算方法。然后，建立混合线性模型，采用限制性极大似然（REML）法估算方差分量和遗传协方差，在此基础上对遗传力和遗传相关系数进行了计算分析。阐述了使用混合模型方程对家系和子代个体育种值进行最佳线性无偏预测（BLUP）的方法，并实

8、现了由简单