三种鳈属鱼类线粒体全基因组的测序与比较

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1、？＇？－－＾＼．’０－分类号：单位代码：１３６４密级学号：１３７２０７２３：签傲卷ｉ乂葦＜学位论文Ｈ种錶属鱼类线粒体全基因组的测序与比较ＳｅｑｕｅｎｃｉｎａｎｄｃｏｍａｒｉｓｏｎｏｆｔｈｅｍｔＤＮ乂ｏｆｔｈｒｅｅｇｐＳａｒｃｏｃｈｅｉｌｉｃｈｔｈｙｓｆｉｓｈｅｓ研究生：王ｊｆ指导教苏时萍副教授申请学位口类级别：农学硕古专业名称；殖壶＇研究方向；水生生物遗传育种所在学院；动物科巧学院

2、’＇’主．去＇＇．－，ｒ：ｒ．‘＞Ｖ／Ｖ；年月‘’．Ｋ．Ｒ，，，Ｈ；巧■‘－＇：＼．Ｖ专；．＇ｒＩ＇？１－Ｊ＇＇ｉ＇１．Ｉ＇．广：＂＇；Ｊ．Ｖ．ｖ軒Ｖ’．ｆ．．ｆ．Ｖｉ．．．．．‘寸—．阔這宿雜；，皆．AnhuiAgriculturalUniversityMasterDegreeThesisSequencingandcomparionofthemtDNAofthreeSarcocheilicht

3、hysfishesPostgraduate:HengWangSupervisor:A.P.ShipingSuCollegeofAnimalScienceandTechnology,AnhuiAgriculturalUniversity,Hefei230036Hefei,Anhui,P.R.ChinaJune,20151独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研。究成果尽我所知，除了文中特别加标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为

4、获得安徽农业大学或其它教育机构一的学位或证书而使用过的材料。与我同工作的同志对本研究所做的任何贡献均己在论文中作了明确的说明并表示了谢意。＾〇（月」研究生签名：？一＜麻时间；＞（／年曰关于论文使用授权的说明本人完全了解安徽农业大学有关保留、使用学位论文的规定，目Ｐ：学校有权保留送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借网，可采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意安徽农业大学可用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。保密的学位论文在解

5、密后应遵守此协议（）：３时间研究生签名：年皆月Ｊ曰第一导师签名：若ｒＴｌ冰时间：年名月／曰摘要华鳈、小鳈和黑鳍鳈，隶属于鲤形目（Cypriniformes）鲤科(Cyprinidae)鮈亚科(Gobioninae)鳈属(Sarcocheilichthys)。鳈属鱼类是中国分布较广泛的中下层水体的小型鱼类，由于其肉质细嫩、营养价值高、色泽鲜亮、体型较小、易饲养等特点，作为肉用和观赏兼用鱼类受到人们的喜爱。目前，国内外在鳈属鱼类的分类、分布、食性、饲养驯化等方面进行了零星的报道，而在其遗传结

6、构、系统发生方面则缺乏系统的研究与报道。本研究以PCR扩增技术为基础，成功获得了华鳈、小鳈和黑鳍鳈线粒体基因组DNA的全序列，利用生物物信息学相关软件进行了基因结构和特征的比较分析,联合已知线粒体基因组的鲤科部分鱼类进行了系统发育树的构建及分析,同时采用多个线粒体DNA片段标记探讨了已知序列的五种鳈属鱼类的遗传分化和系统发生情况。研究结果为我国鳈属鱼类的分类和种间亲缘关系的研究、资源利用和保护提供提供了科学依据。主要研究结果如下：1.成功获取了鳈属三种鱼类的mtDNA全序列，三种鱼的mtDNA的长度分别为华鳈

7、：16683bp，小鳈：16674bp，黑鳍鳈：16679bp。其基因排列顺序与己知鲤科鱼类线粒体基因组一致,均包括13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因、2个rRNA基因(12SrRNA和16SrRNA)和一个非编码区(D-Loop区)。其中tRNAGln、tRNAPro、tRNAAla、tRNAGlu、tRNACys、tRNAAsn、tRNATyr和tRNASer(UCN)8个tRNA基因与ND6共9个基因由L链编码,其余28个基因则是由H链编码。2.华鳈、小鳈和黑鳍鳈的A+T含量分别为56.78%、5

8、6.34%、56.45%,平均A+T含量56.52%，明显高于G+C含量，表现出明显的A+T偏好性。A+T富集的D-Loop区，A+T含量平均值高达67.71%，明显高出全序列的平均值。3.13个蛋白编码基因除COX1以GTG为起始密码子，其余12个均以ATG为起始密码子。其中ND6基因由L链编码，H链编码其余的蛋白编码基因。三种鱼的蛋白编码基因的长度分别为：华鳈（11427bp）、小鳈（11424