《分子标记技》PPT课件

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1、第十二章园艺植物的分子标记第一节园艺植物遗传标记概述一、遗传标记遗传标记（Geneticmarkers)是指园艺植物基因型特殊的、易于识别的表现形式，包括外部形态、染色体结构与数目、生物大分子结构与序列等方面的变异，而所有的遗传标记则构成了园艺植物的遗传多态性。遗传标记种类形态标记、细胞学标记、生化标记、分子标记第一节园艺植物遗传标记概述一、遗传标记遗传标记特点1.多态性高，标记数目多，提供的信息量大；2.共显性遗传，能区分纯合基因型和杂合基因型；3.表现中性，不影响目标性状表达，与不良性状无必然连锁；4.表现稳定，

2、不受植株内外环境的影响；5.经济方便，易于观察记载。概念：能明确反映遗传多态性的外观性状，如株高、果形、花色、叶形、花瓣数多少、核有无或抗逆性、抗病性等。特点：简单直观，长期以来，作物种质资源鉴定及育种材料的选择一般都是根据形态标记进行的，但是形态标记数目少，多态性差，易受环境因素的影响等。形态标记（Morphologicalmarker）形态学上如何区分概念：能明确反映遗传多态性的细胞学特征。染色体结构特征包括核型(染色体相对长度、臂指数、着丝粒指数、染色体臂数等)和带型(Constitutiveheterochr

3、om-ativebanding带、Necleolarorganizerregionbanding带、Giemsabanding带等)。染色体数量特征包括整倍性（多倍体）和非整倍性（缺体、单体、三体、端着丝点染色体等）。方法：染色体计数、染色体显带优点：较形态学标记稳定，可靠缺点：过程复杂、对材料和仪器要求严格细胞学标记（Cytologicalmarker）人类22对常染色体染色体组型karyotype(Chromosomephenotype)analysis细胞分裂中期（Metaphase）Lesspolymorph

4、icUsedfordistantrelatedplantsorevolutionalanalysis概念：主要包括贮藏蛋白、同工酶等标记，也指以基因表达的蛋白质产物为主的一类遗传标记系统。种类：可分为酶蛋白质和非酶蛋白质两类。在非酶蛋白质中用得最多的是种子贮藏蛋白（清蛋白、球蛋白、醇溶蛋白和谷蛋白）。同工酶（isoenzyes)：催化功能相同，但结构和生理性质不同的一类酶。生化标记的优点：数量更丰富，受环境影响更小。生化标记的缺点：蛋白质受生物体发育的时空影响很大。生化标记（BiochemicalMarker）分子标

5、记（DNAmarker）概念：是以直接检测DNA核苷酸序列的差异为基础的遗传标记，又叫DNA分子标记。优点：标记不需要基因表达，可用个体的任何材料进行检测，不受环境条件的限制；数量多，遍布整个基因组；多态性高，自然界存在着许多等位变异，不需专门创造特殊的遗传材料；有许多分子标记表现为共显性，能够鉴别出纯合基因型和杂合基因型，提供完整的遗传信息；有效区分不同物种之间的同源性和相似性；标记本身无害，很少与不良性状连锁；多是以DNA片段电泳谱带形式表现的。分子标记（DNAmarker）概念：是以直接检测DNA碱基序列的差异

6、为基础的遗传标记，又叫DNA分子标记。分类：1.基于DNA-DNA杂交的标记（RFLP、VNTR等）2.基于PCR的DNA标记（SSR、RAPD、AFLP等）3.以电泳分离技术为基础的标记（SSCP等）4.以基因芯片为核心的标记（SNP等）分子标记（DNAmarker）优点：标记不需要基因表达，可用个体的任何材料进行检测，不受环境条件的限制；数量多，遍布整个基因组；多态性高，自然界存在着许多等位变异，不需专门创造特殊的遗传材料；有许多分子标记表现为共显性，能够鉴别出纯合基因型和杂合基因型，提供完整的遗传信息；有效区分

7、不同物种之间的同源性和相似性；标记本身无害，很少与不良性状连锁；多是以DNA片段电泳谱带形式表现的。不足：1.显性标记问题2.基因型限制问题3.标记的稳定性和可操作性问题分子标记（DNAmarker）第二节园艺植物分子标记的种类及其原理一、分子标记多态性产生的分子基础1.DNA序列酶切位点（或PCR引物结合位点）处的碱基突变，导致酶切位点（或PCR引物结合位点）消失，酶切产物（或扩增产物）减少；WM酶切产物电泳MWPCR扩增产物电泳WM2Kb3Kb3Kb2Kb第二节园艺植物分子标记的种类及其原理一、分子标记多态性产生

8、的分子基础2.DNA序列酶切位点（或PCR引物结合位点）之间缺失（或插入）一段核苷酸序列，或者是之间串联重复单元数目发生了改变，导致酶切产物（或扩增产物）片段长度发生了改变；WWWWWWMMM1M2MMM1M21Kb5Kb5Kb4Kb5Kb4Kb1Kb5Kb4Kb4Kb5Kb3Kb5Kb4Kb3Kb4Kb第二节园艺植物分子标记的种类及其原理一、