西瓜bHLH 转录因子家族基因的鉴定及其在非生物胁迫下的表达分析

《西瓜bHLH 转录因子家族基因的鉴定及其在非生物胁迫下的表达分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。

1、园艺学报，2016，43(2)：281–294.ActaHorticulturaeSinicadoi：10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0886；http：//www.ahs.ac.cn281西瓜bHLH转录因子家族基因的鉴定及其在非生物胁迫下的表达分析何洁，顾秀容，魏春华，杨小振，李好，马建祥，张勇，杨建强，*张显（西北农林科技大学园艺学院，陕西杨凌712100）摘要：利用生物信息学方法，在西瓜测序基因组97103中共鉴定出96个bHLH家族成员，其中有94个可以被定位到西瓜的11条染色体上。通过基因结构和结构域

2、序列保守性的预测，发现这些基因的序列长度和内含子数量变化很大，但bHLH结构域序列比较保守。用拟南芥中39条已知的bHLH蛋白序列和西瓜的96条bHLH蛋白序列构建系统发育树，结果显示西瓜的bHLH家族可以进一步被分为11个亚族。运用荧光定量实时PCR技术，分析了该家族中21个基因在西瓜响应非生物胁迫时的表达水平，结果表明，8个基因受低温胁迫诱导表达，13个基因受ABA胁迫诱导表达，14个基因受盐胁迫诱导表达。ClabHLH41在3种胁迫下表达量均显著增加，说明其在低温、ABA和盐胁迫应答中可能发挥着重要作用。关键词：西瓜；bHLH；全基因组

3、鉴定；胁迫响应；基因表达中图分类号：S651文献标志码：A文章编号：0513-353X（2016）02-0281-14IdentificationandExpressionAnalysisUnderAbioticStressesofthebHLHTranscriptionFactorGeneFamilyinWatermelonHEJie，GUXiu-rong，WEIChun-hua，YANGXiao-zhen，LIHao，MAJian-xiang，ZHANGYong，*YANGJian-qiang，andZHANGXian（Collegeof

4、Horticulture，NorthwestA&FUniversity，Yangling，Shaanxi712100，China）Abstract：ThebHLHfamilyisalargesuperfamilyoftranscriptionfactors（TFs）inplants，whichplaycriticalrolesinplantdevelopmentandresponsetodiverseenvironmentalstimuli.TheanalysisofevolutionandstructureofbHLHgenesandthe

5、irexpressionunderabioticstressesinwatermelonconducedtoadeepunderstandingofthemandtheirapplication.Basedonbioinformaticsmethods，atotalof96bHLHgeneswereidentifiedand94ofthemweremappedonto11chromosomes.SequenceanalysisshowedthatbHLHgeneswerediversebothinlengthandnumbersofintro

6、n，butwereconservedinbHLHdomainregion.Thephylogenetictree，whichwasconstructedwithaminoacidsequencesofbHLHdomainof96and39bHLHsfromwatermelonandArabidopsis，indicatedthatbHLHfamilyofwatermeloncouldbefurtherdividedinto11subfamilies.Usingquantitativereal-timePCR，expressionlevelso

7、f21bHLHgeneswereanalyzedunderthreedifferentabiotictreatments.Resultsshowedthat8，13and14genescouldbeinduced收稿日期：2015–12–08；修回日期：2016–02–18基金项目：国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目（CARS-26-18）*通信作者Authorforcorrespondence（E-mail：zhangxian098@126.com）HeJie，GuXiu-rong，WeiChun-hua，YangXiao-zhen，

8、LiHao，MaJian-xiang，ZhangYong，YangJian-qiang，ZhangXian.Identificationandexpressiona