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《两种常见外来入侵赤潮藻的PCR鉴定》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、第31卷第3期海洋渔业Vo.l31,No.32009年08月MarineFisheriesAug.,2009文章编号:1004-2490(2009)03-0325-05研究简报两种常见外来入侵赤潮藻的PCR鉴定1,21111郑俊斌,张凤英,马凌波,陆亚男,马春艳(1.上海海洋大学水产与生命学院,上海201306;2.中国水产科学研究院东海水产研究所,农业部海洋与河口渔业资源重点开放实验室,上海200090)摘要:米氏凯伦藻与环状异帽藻为日本海域流入我国的两种外来入侵赤潮藻。利用核糖体ITS区分别设计出针对该两种藻的特异性PCR
2、引物。通过prmier5.0软件设计多对引物,经PCR扩增,琼脂糖凝胶电泳检测、以筛选目标藻的特异性引物,并以链状亚历山大藻、立玛原甲藻、牟氏角毛藻、赤潮异弯藻作为阴性对照,做进一步PCR验证。筛选到米氏凯伦藻最佳引物Ki1F3/Ki1B3和环状异帽藻最佳引物YiF3a/YiB3a。两对特异性引物成功鉴定了两种外来入侵藻,而对其它藻种则是阴性反应,可为赤潮的预测预报提供分子鉴定基础。关键词:米氏凯伦藻;环状异帽藻;核糖体ITS区;特异性引物;PCR鉴定中图分类号:Q949.24文献标识码:APCRidentificationoftwoal
3、ieninvasivespeciesofRedTideAlgae1,21111ZHENGJunbin,ZHANGFengying,MALingbo,LUYanan,MAChunyan(1.CollegeofFisheriesandLifeScience,OceanUniversityofShanghai,Shanghai201306,China;2.EastChinaSeaFisheriesResearchInstituteChinseseAcademyofFisherySciences,Shanghai200090,China)
4、Abstract:KareniamikimotoiandHeterocapsacircularisquamaweretwoalieninvasivespeciesofredtidealgaefromJapanesewaters.SpecialPCRamplifiedprimersweretargetedrespectivelybasedonribosomalITSregions.Softwareprimer5.0wasusedtodesignpairsofprimers,andPCRamplificationandagarosegelelect
5、rophoresiswerealsousedtoselectspecialprimerstargetedatthesetwospecies.WhilePCRspecificitywasvalidatedbythecontrastalgaeofAlexandriumcatenella,Prorocentrumlima,Chaetocerosmuelleri,iHeterosigmaakashiwo,onlythetargetalgaeshowedpositivereactions.Sowehadchosentwopairsofbestprimer
6、sofKi1F3/Ki1B3andYiF3a/YiB3a.Thesetwoalieninvasivespeciesofredtidealgaehadbeensuccessfullyidentifiedbythetwopairsofspecialprimersandtheresultwashelpfultoforecastredtide.Keywords:Kareniamikimotoi;Heterocapsacircularisquama;ribosomalinternaltranscribedspace(ITS);specialprimer;
7、PCRidentification收稿日期:2009-04-21基金项目:上海市科学技术委员会科研计划项目(062358101);中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金(中国水产科学研究院东海水产研究所)资助项目(2007M22)作者简介:郑俊斌(1983-),男,浙江衢州人,硕士研究生,研究方向为水生生物学。E-mai:lzhengjunbin1983@163.com通讯作者:马凌波.Te:l021-65688139;E-mai:llingboma@hotmai.lcom326海洋渔业200
8、9年赤潮是国际上公认的全球性的海洋灾害之一。我国海域宽阔,每年都有大量赤潮暴发事件发生。许多赤潮因藻种富含藻毒素,这些藻毒素往往是次生代谢产物,种
