甲胎蛋白阴性与甲胎蛋白阳性肝细胞癌基因表达谱差异研究要点

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1、万方数据空堡萱道丛壁蓥查!!!!生i旦笙!!查箜!塑鱼!!!!堡!!!!g!丛型!!!!!!!!：!!：堕!：!甲胎蛋白阴性与甲胎蛋白阳性肝细胞癌基因表达谱差异研究安松林肖汀冯林郭宏林荣维淇王黎明吴凡冯莉吴健雄【摘要】目的肝细胞癌是具有不同临床表现和分子生物学特征的异质性疾病，本研究比较甲胎蛋白(alpha—fetoprotein．AFP)阴性和AFP阳性肝癌的mRNA表达谱差异，并进行生物信息学分析。方法采用安捷伦4×44k基因芯片平台，检测合并乙型肝炎病毒(hepatitisBvirus，HBV)感染的20例AFP阴性和20

2、例AFP阳性肝癌组织的mRNA表达谱，用生物信息学方法进行差异基因分析及GOPathwav分析，并用realtimePCR验证芯片结果。结果通过表达谱芯片分析，在AFP阴性和AFP阳性肝癌组织中发现352个差异表达基因。主成分分析及GOPathway分析显示，AFP阴性肝癌组织高表达基因62个，主要参与细胞凋亡和程序性死亡等过程，AFP阳性肝癌高表达基因290个，主要参与有丝分裂和细胞周期等过程。realtimePCR验证差异基因LAMB3和STARD5的表达，结果与表达谱芯片结果一致。结论AFP阴性肝癌和AFP阳性肝癌基因表达

3、特征不同，提示不同AFP水平的肝癌的发生和发展存在不同的分子机制。【关键词】癌，肝细胞；甲胎蛋白类DifferencesinmRNAexpressionprofilesbetweenalpha-fetoproteinnegativeandpositivehepatocellularcarcinomaAnSonglin，XiaoTing，FengLin．GuoHonglin，R。ngWeiqi，WangLiming，WuFan，FengLi．WuJianxiong．DepartmentofOncologySurgery，Belti

4、ngShifitanHospital．Beifingl()0038．ChinaCorrespondingauthor：WuJianxiong，E—mail：dr．wujx@hotmail．corn【Abstract】ObjectiveToeonlparegeueexpressionprofilesbetweenAFPnegativeandAFPpositivehcpatoccllularcarcinoma(HCC)．MethodsTheanalysisofmRNAexpressionwasperformedon20samples

5、ofAFPnegativeand20samplesofAFPpositiveHCCassociatedwithHBVinfectionthroughAgitent@WholeHumanGenomeOligoMicroarrav．Bioinformaticsanalyseswereusedtoidentify'genesandrealtimePCRwasappliedtoverifymieroarravdata．Results352differentiallyexpressedgenesinthetwogroupswereiden

6、tifiedthroughprincipalcomponentanalysis．62up—regulatedgenesinAFPnegativeHCCwerefoundtobeinvolvedincellapoptosisandprogrammedcelldeath，whereas290up—regulatedgenesinAFPDositiveHCCinvolvedinmitosisandeellcycle．TwodifferentiallyexpressedgenesincludingLAMB3andSTARD5werefu

7、rthertestedthroughrealtimePCR．andtheresultswereinhighconcordancewithmicroarrayresults．ConclusionThegeneexpressionprofilesofAFPnegativeHCCweredifierentfromAFPpositiveHCC．ThisstudysuggeststherearedifierentmolecularmechanismsinHCCdevelopmentandprogressionwithdifferentAF

8、Plevels．【Keywords】Carcinoma，hepatocellular；Alpha—fetoproteins肝细胞癌(hepatocellularcarcinoma，HCC，以下简称肝癌)是一种遗传异质性疾病，不同甲胎蛋白(alpha—fetopr