Cytophaga+hutchinsonii纤维素吸附突变株筛选与相关吸附蛋白的分析

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1、L目录摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．iABSTRACT⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯、，第一章绪论⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．11．1纤维素的结构特征⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．11．2微生物降解纤维素的三种可能策略⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯21．2．1好氧菌降解纤维素策略⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯41．2．2厌氧菌降解纤维素策略⋯⋯⋯⋯⋯

2、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．51．2．3第三种纤维素降解机制⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯71．3纤维素吸附与纤维素降解⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯71．4CytophagahutchinsoniiATCC33406简介⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯101．5微生物突变体的获得⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．131．6膜蛋白研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯151．6．1膜蛋白的基本类型⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯161．6．2膜蛋白研究中所面临的困难及相

3、关研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯。171．7蛋白质组学研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯l81．7．1蛋白质组学的简介⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯。181．7．2双向电泳技术在蛋白质组学研究中的应用⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯181．7．3同位素相对标记与绝对定量技术(iTRAQ技术)简介⋯⋯⋯⋯．231．7．4蛋白质组学研究中所面临的问题⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯241．8论文的立题依据和工作思路⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯25第二章Cytophagahutchinsonii突变株的筛选⋯

4、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯272．1实验材料⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．272．1．1菌株⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯272．1．2培养基和试剂⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯272．1．3主要仪器⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯282．2试验方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯282．2．1紫外线诱变Chutchinsonii⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．282．2．2EMS诱变Chutchinsonii⋯⋯⋯

5、⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯292．2．3Chutchinsonii的自发突变⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯。292．2．4转座子突变Chutchinsonii⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯302．2．5Chutchinsonii及其突变株纤维素吸附特性分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯3l2．2．6Chutchinsonii及其突变株运动特性分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯312．2．7Chutchinsonii及其突变株的生长分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯312．2．8转座子随机插入突变子的验证及插入位点分析⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

6、．．322．3实验结果⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯332．3．1紫外线及EMS诱变最佳条件的选择⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯332．3．2c．hutchinsonii突变株筛选⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯342．3．3Chutchinsonii突变株吸附特性研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯342．3．4Chutchinsonii突变株运动特性研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯352．3．5Chutchinsonii突变株生长特性的研究⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯372．3．6Chutchinsonii转座

7、插入突变株插入验证及插入位点分析⋯⋯⋯372．4本章小结⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯40第三章Cytophagahutchinsonii膜相关蛋白的提取及纤维素吸附蛋白的分析鉴定⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．4：13．1实验材料⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯433．1．1菌株和培养基⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯一433．1．3主要仪器⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．453．2实

8、验方法⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯453．2．1全膜蛋白的提取⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．453．2．2膜蛋白的细分级分离⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．463．2．3纤维素吸附蛋白的SDS／PAGE分离⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．473．2．4IEF．SDS／PAGE鉴定纤维素吸附蛋白⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯483．3实验结