酵母双杂交protocol

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时间:2019-06-30

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1、目录(一)介绍4(二)试剂盒物品清单7(三)额外附加物品列表9(四)酵母菌株11(五)酵母载体14(六)方法简述:单杂交文库的构建和筛选16方法简述:双杂交文库的构建和筛选17(七)构建用于酵母单杂交的报告质粒载体18(八)构建用于酵母双杂交的DNA-BD融合载体19(九)构建生成cDNA文库21(十)构建和筛选酵母单杂交和双杂交文库(简述)27(十一)酵母单杂交文库的构建和筛选28(十二)酵母双杂交文库的构建和筛选30方法A:通过酵母配对(YeastMating)来筛选目的蛋白30方法B:通过共转化的方法筛选目的蛋白35(十三)分析阳性相互作用结果38(十四)问题解决

2、指南44(十五)参考文献47(十六)相关产品50附录A:双链cDNA合成的典型结果51附录B:酵母感受态的制备—LiAc法52附录C:单杂交对照载体信息53附录D:双杂对照载体信息54表格列表TableI.BDMatchmaker酵母菌株的基因型11TableII.BDMatchmaker酵母菌株的表型11TableIII.单杂交系统的载体14TableIV.双杂交系统的载体15TableV.各BD-MatchmakerDNA-BD载体的比较19TableVI.RNA起始浓度和PCR扩增循环数之间的关系24TableVII.单杂交共转化的对照实验的设置29TableVI

3、II.单杂共转化对照实验:期望的结果29TableIX.双杂交转化的对照实验的设置33TableX.双杂交配对筛选的对照实验的设置TableXI.双杂交共转化的对照实验的设置TableXII.双杂交共转化的对照实验:期望的结果TableXIII.用于PCR筛选菌落的AssemblingMasterMixs54图片列表Figure1.使用BDMatchmaker单杂交系统筛选蛋白-DNA相互作用4Figure2.使用BDMatchmaker单杂交系统筛选蛋白-蛋白相互作用4Figure3.酵母单杂交和双杂交筛选的大致步骤5Figure4.构建和筛选BDMatchmaker

4、酵母单杂交和双杂交文库6Figure5.酵母菌株AH109和Y187中的报告基因12Figure6.BDMatchmaker酵母单杂交文库的构建和筛选16Figure7.BDMatchmaker酵母双杂交文库的构建和筛选17Figure8.用BDSMART技术合成高质量的dscDNA21Figure9.BDCHROMASPIN纯化柱和收集管26Figure10.通过酵母重整合作用来构建AD融合文库27Figure11.为双杂交筛选AD融合文库32Figure12.分析和证明可能的单杂交和双杂交相互作用阳性结果的策略39Figure13.通过酵母配对来验证蛋白-蛋白相互作

5、用42Figure14.用对照用人胎盘PolyA+RNA合成双链cDNA51Figure15.p53HIS对照载体的图谱53Figure16.pGAD-Rec2-53AD对照载体的图谱53Figure17.pGADT7-RecTAD对照载体的图谱54Figure18.pGBKT7-53DNA-BD对照载体图谱54Figure19.pGBKT7-LamDNA-BD对照载体图谱5554(一)介绍BDMatchmakerTMLibraryConstruction&Screening试剂盒提供一种简便的方法构建cDNA文库用来进行酵母双杂交和单杂交的筛选,这些试剂盒结合了BDM

6、atchmakerTMSystems和BDSMARTTMcDNASynthesis的技术,只需要用任何组织的1μgpolyA+RNA或totalRNA就能构建cDNA文库。通过一般细胞内克隆步骤,你能利用BDMatchmakerSystems所提供的灵敏的转录方法所构建的文库来进行单杂交或双杂交实验。单杂交实验的原理——蛋白-DNA相互作用实验单杂交实验使你能够确定和描述蛋白与目的顺式DNA激活序列的绑定,该序列可能是处于最小限度的启动子上游的用于增强转录的元件。这个实验也可以用于预测或新蛋白的DNA绑定结构域的确定。通过BDMatchmakerOne-HybridSy

7、stem你可以很容易的获得这些基因表达的蛋白在BDMatchmakerOne-Hybrid实验中,潜在的DNA绑定蛋白基因是与克隆在pGADT7-Rec2(为单杂交设计的低拷贝载体)上GAL4激活结构域(AD)序列一起融合表达的。一个或多个目的DNA序列的串联拷贝被构建在pHIS2(含有HIS3营养缺陷报告基因的报告载体)。DNA绑定蛋白和目标序列的相互作用会激活HIS3的转录(Figure1),该过程要在宿主菌株Y187(组氨酸缺陷型)中进行并在缺少组氨酸的培养基生长双杂交实验的原理——蛋白-蛋白相互作用的原理双杂实验分析能用于鉴定新的

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