微生物的分类与鉴定1

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1、Chap.12微生物的分类和鉴定§.1通用分类单元§.2微生物在生物界的地位§.3各大类微生物的分类系统纲要§.4微生物的鉴定Chap.12微生物的分类和鉴定●微生物分类学（microbialtaxonomy）●分类:在研究微生物相似性的基础上，把每一微生物编排在一定的分类单元中，制定出检索表。●鉴定：运用现代分类系统，通过具体菌株描述，给未知物一个具体的分类位置。●命名：按照国际命名法规，给每个新的分类群一个新的学名。（一）种的概念●种(species)：微生物的基本分类单位，具有许多共同特征的菌株的集合。●典型菌株（typestrain）

2、模式种（typespecies）●亚种●型、菌株§.1通用分类单元●细菌新种发表的要求1）在IJSB上发表2）国内发表应送副本给IJSB编辑，以获有效目录公布3）提供模式种4）符合命名法规要求5）符合优先律●菌种保藏中心与菌种目录ATCC：美国典型菌种保藏中心CCTCC：中国典型菌种保藏中心：---下设：CCGMC、ACCC、CICC、CMCC等6个中心---菌种目录及菌种保藏和购买二、学名的命名及有关法规●双名法：Bacillussubtilis●三名法：Acetobacterpasteurianussubsp.pasteurianus●名

3、字的应用：BacillussubtilisCMCC63501BacillussubtilisCohn1874Bacillussp.Bacillusspp.●缩写：B.subtilis§.2微生物在生物界的地位五界系统：●三域学说●真核生物起源的内共生学说●古细菌生物学特征：§.3各大类微生物的分类系统纲要一、细菌、古生菌分类系统纲要《Bergey’sManualofSystematicBacterialogy》1,2版《Bergey’sManualofDeterminativeBacterialogy》1~9版1.古生菌：《系统手册》（二版）

4、原核生物----古生菌界（2门63属208种）----泉古生菌门----广古生菌门----细菌界2.细菌的分类●《系统手册》（一版，1984~1989年，共4卷）卷类型群（Section）主要代表Vol.1G-1~11section肠杆菌，假单孢菌，Vol.2G+12~17section芽孢杆菌，梭菌，Vol.3古生菌等18~25section甲烷菌，嗜盐菌，光合细菌Vol.4产孢放线菌26~33section链霉菌3.真菌（Fungi）的分类系统●Ainsworth系统《Thefungi》,Ainsworth,1973《Ainswortha

5、ndBisby’sDictionaryoftheFungi》----7版，1983年，Hawksworth----8版，1995年，Hawksworth书355一、经典分类鉴定方法（生理生化为主，形态为辅）●通常指长期以来，在常规鉴定中普遍采用的（形态、生理、生化、生态、生活史、血清学反应等指标）◆传统分类的细菌鉴定程序●细菌自动鉴定系统API数值鉴定系统BBL鉴定系统Biolog鉴定系统程序：1、辅助特征2、培养菌悬液加入生化反应板培养自动扫描自动鉴定打印结果二、现代分类鉴定方法●细菌化石二、现代分类鉴定方法1．微生物遗传型的鉴

6、定（1）DNA碱基比例的测定（G+C）mol%：●(G+C)mol%值只能做否定判断；●（G+C）mol%值差别>5，属不同的种；差别>10，属不同的属。（2）核酸分子杂交法●DNA-DNA分子杂交原理：DNA分子解链的可逆性和碱基配对的专一性。DNA-DNA杂交（固相杂交法）单链DNA（待测菌株）↓转硝酸纤维素膜↓加入放射性标志参照菌DNA（单链）↓洗去未杂交DNA↓闪烁计数器计数测定放射强度结论：1.DNA同源性≥60%（同种）2.DNA同源性≥70%（同亚种）3.DNA同源性60~70%（不同亚种）4.DNA同源性20~60%（同属）1

7、6srRNA分析作为细菌进化的计时器●生物共有的●一定的信息量（1542个核苷酸）●一定的保守性●便于比较研究（4）16srRNA核苷酸序列分析●DNA-PCR法提取DNA↓PCR扩增16SrRNA↓PCR产物纯化分析↓16SrRNA序列测定↓递交Genbank检索●相似性结果的一般判断：1.SAB≥95%同种2.SAB为85~95%同属3.SAB≤85%不同属2．细胞化学组分的鉴定（放线菌）细胞结构成分壁肽聚糖、化学组分膜枝菌酸（棒杆菌酸；分枝菌酸）甲基萘醌全细胞水解糖类1.细胞壁化学类型（分为9种类型）-----氨基酸：DAP（二氨基庚二

8、酸）、Gly、Lys、Asp、Orn----糖类：阿拉伯糖、半乳糖（2）全细胞水解液的糖型糖类型特征糖类A半乳糖、阿拉伯糖、B马杜拉糖C无特征糖类D木糖、阿拉伯糖E