资源描述：
《葡萄CIPK基因家族的鉴定表达分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在工程资料-天天文库。
1、葡萄CIPK基因家族的鉴定表达分析路志浩霍建强马铉胡炜毛娟甘肃农业大学园艺学院摘要：以水稻、玉米、拟南芥中己知CIPK基因注册序列为基础，从葡萄基因组数据库中电子克隆出16条CIPK基因。对其理化性质分析表明，除VvCTPKIO编码的251个氨基酸数目外，其余氨基酸数目基本稳定为300470o整个CIPK家族的理论等电点为6驚基因结构分析表明,VvCIPKOKVvCIPK03、VvCIPK04、VvCIPK08、VvCIPK09、VvClPK13包含外显子数都大于10;VvCIPK02、VvCIPK05、VvCIPK06、VvCIPK
2、07>VvCIPKIO.VvCIPKIKVvCIPK12、VvCIPK14、VvCIPK15、VvCIPK16包含外显子数都小于7。聚类分析表明，CIPK基因被分为4个亚族，且在每一个亚族屮都包含葡萄和拟南芥的CIPK基因家族成员，说明它们具有很高的同源性。对CIPK蛋白质的二级结构分析表明，葡萄CIPK基因家族所编码的蛋白质均以a-螺旋和不规则卷曲为主，而B-转角最少。亚细胞定位后发现，VvCIPK基因在细胞质中表达最多。对葡萄CIPK基因家族上游2kb区域顺式作用元件分析表明，VvCTPK13对于ABA和脱水胁迫的响应最为明显，葡
3、萄CIPK基因家族对于MYB转录因子和WRKY转录因子均有响应。荧光定量分析表明，VvCIPK15在根屮表达量最多，在茎中表达量最少;在不同处理下该基因表达差异性显著。其中，受PEG、ABA、NaCl诱导后呈明显上调表达，其表达量依次为PEG>NaCl>ABAo同时该基因在受到高、低温胁迫时表达量也有明显上调，9个处理中只有在山梨糖中呈下调表达。推测该基因能够参与调控干旱、盐碱、低温等逆境过程。关键词：葡萄;CIPK家族;基因克隆;生物信息学分析;实时定量PCR;作者简介：路志浩，男，在读本科生，研究方向为果树生物技术。E-mail:
4、1790665627@qq.com作者简介：毛娟，女，博士，副教授，研究方向为果树生物技术。E-mai1:maojuan@gsau.cdu.cn收稿日期：2016-06-08基金：廿肃农业大学国家级大学生科技创新项目(201510733005)Genome-wideIdentificationandExpressionAnalysisoftheCIPKGeneFamilyinGrapeLUZhihaoHUOJianqiangMAYuHUWeiMAOJuanCollegeofHorticulture,GansuAgriculturalU
5、niversity;Abstract：Thisworkwasbasedonknowngenesofrice,maizeandarabidopsis.Atotalof16membersofthisfamilywereidentifiedingrapegenome.Analyzingtheirphysicalandchemicalproperticsrevealedallofthegenesofaminoacidnumberdistributeon300-470butVvCIPKIOwhichhas251aminoacid.Theoret
6、icalisoelectricpointofthewholegenesdistributedon6-9.AnalyzingstructureofgenesindicatedthatapartofexonofVvCIPKweremorethan10(VvCIPKOl,VvCIPK03,VvCIPK04,VvCIPKO&VvCIPK09andVvCIPK13),theotherswerelessthan7(VvCIPK02,VvCIPKOS,VvCIPK06,VvClPK07,VvCIPKIO,VvClPKll,VvClPK12,VvCl
7、PK14,VvClPK15andVvCIPK16).Phylogeneticanalysisindicatedthatalltheproteinsfellintofourmajorclusters,andeveryclustercontainedapartofgenesofgrapeandarabidopsis-Itindicatedhighhomologyrelationshipofthosegenes.AnalyzingthesecondarystructureofVvCIPKproteinsequenceindicatedtha
8、tmostratiowerealphahelixandirregularcurly,theratioofbetaanglewastheleast.Thewholegeneschiefexpressedincytoplas
