高级生态学-生态学仪器201411.pptx

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1、杨盛昌2014-11-11科学研究中的大型仪器《高级生态学》内容提要:科学研究与大型仪器公共仪器平台的大型仪器第一部分科学研究与大型仪器工欲善其事,必先利其器!2003P.C.Lauterbug(USA)andS.P.Mansfield(UK)magneticresonanceimaging.2007年，诺贝尔生理学或医学奖授予美国的马里奥·卡佩奇、奥利弗·史密斯和英国的马丁·伊文思在涉及胚胎干细胞和哺乳动物DNA重组方面的一系列突破性发现”而获得这一殊荣的。“基因打靶”技术的诞生2008年，诺贝尔化学奖MartinChalfie、RogerTsien、OsamuS

2、himomura绿色荧光蛋白质GFP及其一系列应用通常情况下,高水平的论文离不开好的方法和技术大型仪器例1例2例3第二部分公共仪器平台的大型仪器高通量测序系统公司名称技术原理技术开发者ApplyBiosystems(ABI)基于磁珠的大规模并行克隆连接DNA测序法美国Agencourt私人基因组学公司（APG）Illumina合成测序法英国Solexa公司首席科学家DavidBentleyRoche大规模并行焦磷酸合成测序法美国454LifeSciences公司的创始人JonathanRothbergCompleteGenomicsDNA纳米阵列与组合探针锚定连接测

3、序法美国CompleteGenomics公司首席科学家RadojedrmanacIlluminaHiSeq2500两种运行模式:快速运行和高产量运行模式快速运行模式提供快速的结果、数量有限样品的高效处理，以及更长的末端配对150bp读取高产量模式可处理的样品量是快速模式的-5倍，让大型项目可通过尽可能少的运行来完成惊人的速度和通量:既能在7小时内获得-10Gb或-3亿个单端读取，又能在11天内获得600Gb或60亿个末端配对读取600M核磁共振仪NMR（AVANCEⅢ600MHz）DigitalNuclearMagneticResonanceSpectrometer

4、●有机分子、生物小分子等合成或天然产物的鉴定；●制药新工艺或新技术应用，药代产物分析，药代动力学；●发酵工程中微生物、酶法生产精细化工品分析；●生化产品分离纯化及活性成分鉴定。Q-TOFMS(Quadrupole-Time-of-FlightMassSpectrometer)●自动denovo蛋白质测序、蛋白多肽序列测定、肽谱分析及数据库检索技术；●ICAT蛋白质定量技术；●蛋白磷酸化，糖化、甲基化位点确定；●蛋白小分子结合分析、药物代谢产物的检测、天然产物的结构、中药成分分析，可以将基因型与表型进行关联分析。独脚金内酯(strigolactone,SL）Tripl

5、eTOF5600System(TripleQuadrupole-Time-of-FlightMassSpectrometer)QualitativeandquantitativeanalysisofMoleculesandProteomicsresearch.Aswellasformuladeterminationinpharmaceuticalimpurityanalysis,metaboliteidentification,pesticidescreeningandtoxicology&dopinganalysis.MALDI-MSMatrix-Assisted

6、LaserDesorptionIonizationTimeofFlightMassSpectrometry●蛋白质和多肽的分析：分子量、肽谱、序列、修饰及生物分子相互作用。●多糖结构测定。●寡核苷酸和核酸的分析。●抗肿瘤药物筛选。●微生物鉴定。ICP-MSInductivelyCoupledPlasmaMassSpectrometry快速准确地测定各种重金属元素和其化合物的含量、及其存在形态等。原子吸收分光光谱仪●测定不同材料中不同重金属的含量以及变化等。目前可以检测的金属元素有：K、Na、Ca、Mg、Pb、Zn、Fe、Cd、Pd、Pt、Co、Cr、Mo、Cu、Al

7、、Mn、Ag、Au、Se等。元素分析仪VARIOELcube碳氢氮硫CHNSAA3型连续流动分析仪营养盐的连续测定：水体中的硝酸盐，亚硝酸盐，氨氮，磷酸盐，总氮，总磷，硅酸盐，氯，硫酸盐，苯酚，氰化物，硫化物，阴离子，DOC,COD，硬度，酸度，碱度，铁，镁，铝，氟，尿素气相色谱仪与气质谱联用仪(GC-MS)●用于代谢中间产物及终产物的分离、纯化以及鉴别，药学研究中有机活性物质的制备与分析；●痕量、超痕量化合物定性定量分析、色谱共流出峰分析鉴定和高通量分析。安捷伦7890A气相色谱仪（Agilent7890A）透射电子显微镜JEM2100HC(Transmiss