灰枣和酸枣叶绿体trnL-trnF基因序列分析.pdf

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1、第31卷第11期河南科学V01.31No.112013年11月HENANSCIENCENOV.2013文章编号:1004—3918(2013)11-1883—04灰枣和酸枣叶绿体trnL—trnF基因序列分析赵志浩,王杰,李振山,管少华,李继东(1.河南农业大学林学院,郑州450002;2.商丘学院风景园林学院,河南商丘476113)摘要:以灰枣和酸枣叶片为材料,用改良的CTAB法提取总DNA,用通用引物对枣叶绿体trnL基因内含子和trnL一mF间隔区进行PCR扩增,得到了trnL基因内含子和trnL—fmF间隔序列片段。并对trnL—mF间隔序列片段回收测序。测序结果

2、符合植物叶绿体基因trnL—tmF间隔序列特征,用DNAMAN软件进行同源性分析,结果表明灰枣和酸枣trnL一mF基因序列同源性为94.78%.枣和酸枣的分类学地位是一个长期争议的问题,初步开展了灰枣和酸枣叶绿体基因序列分析的研究,为研究枣和酸枣分子系统进化提供参考.关键词:灰枣;酸枣;叶绿体基因;序列分析;trnL—trnF间隔序列中图分类号:S665.1文献标识码:ATheChloroplastGeneSequencetrnL-trnFofZiziphusjujubaMil1.‘huizao’andZiziphusjujubavar.spinosaZhaoZhihao

3、,WangJie,LiZhenshan,GuanShaohua,LiJidong(1.CollegeofForestry,HenanA鲥culturalUniversity,Zhengzhou450002,China;2.DepartmentofLandscapeArchitecture,ShangqiuCollege,Shangqiu476113,HenanChina)Abstract:InthisarticlewecollecttheleafofZiziphusjujubaMil1.‘huizao’andZiziphusjujubavar.spinosa(Rhamna

4、ceae),toisolatethetotalDNAwithmodifiedCTABmethod.ThetrnLgeneintronandtrnL-trnFintergenicspacerareamplifiedwithgeneralprimers.WesequencethetrnL一r几FintergenicspacerandtheresultssatisfythecharacterofplantcpDNA.ThephytoplasmaanalysiswithDNAMANsoftwareshows94.78%homologybetweenthetwosamples.Si

5、ncetheargumentontheclassificationofjujubeandsourjujube,thestudycouldprovidesomereferenceforfutureresearch.Keywords:ZiziphusjujubaMil1.‘huizao’;ZiziphusjujabaVf1.F.spinosa;chloroplastgene;sequenceanalysis;£rn一mFintergenicspacer枣(ZiziphusujubaMil1.)是我国重要的经济林木之一,已有2700余年的栽培历史.曲泽洲等的研究认为,酸枣是枣的

6、野生种.但是关于枣和酸枣的分类地位,尚存有较大争议,利用形态学、细胞学或分子标记的手段进行的研究往往得出不同的结果.叶绿体DNA是高等植物细胞核外的另一类遗传系统,结构较核基因组简单,在结构和序列上相对保守,非编码区序列比编码区序列表现出更快的进化速率,呈单亲遗传,极少(或没有)发生重组,有独立的进化路线,适合应用于植物系统发育的研究.本文以灰枣和酸枣叶片为材料,用CTAB法提取叶绿体DNA,用通用引物对枣叶绿体trnL基因内含子和trnL—trnF间隔区进行PCR扩增,并对trnL—trnF间隔序列进行测序和序列比对.以期从分子水平上揭示枣和酸枣的亲缘关系,为枣种问亲缘

7、关系分析提供分子佐证,为枣属植物分类提供新的研究方法.收稿日期:2013—07—15基金项目:国家林业公益性行业科研专项(200904024);郑州市科技领军人才项目(10LJRC179)作者简介:赵志浩(1990一),男,河南安阳人,硕士研究生,主要从事森林培育研究通信作者:李继东(1976一),男,河南南阳人,副教授,博士,主要从事经济林育种与栽培研究.2013年11月赵志浩.等:灰枣和酸枣叶绿体trnL一mF基因序列分析一1885一大枣.seqATTTTTATCCTATACTCTCATTTCGTTAGCGGTTCAAAA

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