中国沿海鲆鲽鱼类进化关系研究.pdf

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1、水产科技情报2014，41(6)275doi:10．3969/j．issn．1001－1994．2014．06．001中国沿海鲆鲽鱼类进化关系研究方一锋(浙江自然博物馆生命科学部，杭州310003)摘要:为研究中国沿海鲆鲽鱼类的进化关系，利用生物信息学方法，分析了53种中国沿海鲆鲽鱼类以及3种国外沿海鲆鲽鱼的COⅠ基因，采用邻接法(neighbour－joining)和最大似然法(maximumlikelihood)构建了系统发生树，并结合形态学特征进行分析。结果与传统的形态学分类基本一致，但也有不同之处:舌鳎科的东方无线鳎(Symphurusoriental

2、is)和多线无线鳎(S．strictus)，它们同鳎科聚为一个大的分支;冠鲽科的三斑沙鲽(Samariscustriocellatus)同舌鳎科聚为一支;牙鲆(Paralichthysolivaceus)并没有与牙鲆科的其它鱼类聚为一支，而是同鲽科关系更为密切。关键词:鲆鲽鱼类;鲽形目;进化;NCBI;COⅠ基因;系统发生;邻接法;最大似然法鲆鲽鱼类是鲽形目(Pleuronectiformes)鱼类nih．gov/)检索鲆鲽鱼类的线粒体COⅠ基因序的总称，俗称比目鱼(flatfishes)，在海洋鱼类中占列。有十分重要的地位。鲆鲽鱼类广泛分布于全球各1．2系统

3、进化分析海域，其中牙鲆、大菱鲆、圆斑星鲽、大西洋庸鲽和采用鲆科的大菱鲆(Scophthalmusmaximus)、半滑舌鳎等种类均为我国沿海养殖的主要鱼类，鲽科的大西洋庸鲽(Hippoglossushippoglossus)和但属于中国本地种类的并不多。上述种类中，只鳎科的欧鳎(Soleasolea)作为外群，用ClustalX软有半滑舌鳎的模式产地为中国。件对各类鲆鲽鱼的线粒体COⅠ序列进行多重序生物间群体遗传结构和进化关系的研究是生列比对和分析。针对多重序列比对结果，使用物学研究的基础和重要组成部分。目前，利用分MEGA6软件，借助邻接法(neighbou

4、r－joining)和子遗传学手段揭示物种演化关系已经成为研究生最大似然法(maximumlikelihood)构建系统进化物系统进化的趋势。本研究中的53种鲆鲽鱼类树。基本涵盖了我国沿海鲽形目的代表种属(见2结果和分析表1)。笔者利用线粒体DNA的COⅠ基因的部分序列作为分子标记，对我国沿海鲽形目鱼类的2．1NCBI检索结果进化关系进行了比较分析，以期为鲆鲽鱼类的分经NCBI检索，分布于中国沿海的鲆鲽鱼类类及修订提供参考。共有53种公布了COⅠ序列(见表1)，其中包括模式产地为中国的鲆鲽鱼15种，分别为:中华舌1材料和方法鳎(Cynoglossussinic

5、us)、长吻红舌鳎(C．lighti)、1．1线粒体COⅠ序列检索短吻红舌鳎(C．joyneri)、短吻三线舌鳎(C．abbre-使用NCBI数据库(http://www．ncbi．nlm．viatus)、半滑舌鳎(C．semilaevis)、双线舌鳎(C．bi－收稿日期:2014－01－17作者简介:方一锋(1970—)，女，馆员，研究方向:无脊椎动物和鱼类。276水产科技情报2014，41(6)lineatus)、黑鳃舌鳎(C．roulei)、斑头舌鳎(C．(Arnoglossustenuis)、马来斑鲆(Pseudorhombuspuncticeps)、

6、宽体舌鳎(C．robustus)、长钩须鳎(Pa-malayanus)、五眼斑鲆(P．pentophthalmus)和石鲽raplagusiabilineata)、卵鳎(Soleaovata)、纤羊舌鲆(Kareiusbicoloratus)。表1本研究分析所用的数据信息科种模式产地在中国的分布情况序列来源舌鳎科中华舌鳎Cynoglossussinicus温州广东、广西到浙江舟山群岛DQ116753长吻红舌鳎Cynoglossuslighti温州、厦门珠江口到渤海HQ711865短吻红舌鳎Cynoglossusjoyneri上海珠江口附近到黄渤海JQ73861

7、3短吻三线舌鳎Cynoglossusabbreviatus中国东海、黄海到渤海DQ116750半滑舌鳎Cynoglossussemilaevis烟台厦门附近到渤海FJ797309双线舌鳎Cynoglossusbilineatus中国海南岛、广东、广西到福建、台湾EF607349黑鳃舌鳎Cynoglossusroulei广东广东、广西到舟山群岛以南JQ937270斑头舌鳎Cynoglossuspuncticeps中国广东、广西到福建及台湾等近海EF607352宽体舌鳎Cynoglossusrobustus上海黄海、渤海、东海到粤东沿岸HM180553大鳞舌鳎Cy

8、noglossusmacrolepid