如何查询基因结构.docx

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1、作为科研新手,菜鸟入门,研究一个目标基因怎么办?真核细胞基因结构包括4个部分:①编码区,包括外显子与内含子;②前导区,位于编码区上游,相当于RNA的5’末端非编码区(非翻译区);③尾部区,位于RNA的3’编码区下游,相当于末端非编码区(非翻译区);④调控区,包括启动子和增强子等。真核细胞基因结构示意图调控区,编码区,到底是“什么鬼”?基因结构怎么查?今天,小编以人类的β-Actin基因为例,与大家分享一下NCBI数据库上的查询方法吧。β-Actin是PCR常用的内参基因,β-Actin抗体是WesternBlot很好的内参指数。内参在各组织和细胞

2、中的表达相对恒定,在检测蛋白的表达水平变化时常用它来做参照物。1.登录NCBI主页,选择Gene,输入基因以及对应的种属名并进行搜索:2.找到需要查询的目标基因,点击链接:在搜索结果中,找到Name/GeneID为ACTB即为我们需要查询的目标基因!此外,还可以看到该基因对应的描述(Descxxxxription):actinbeta[Homosapiens(human)];基因位置(Location):位于7号染色体上5527148-553060bp处,序列号为NC_000007.14;别称(Aliases)有BRWS1,PS1TP5BP1等信

3、息。3.查询目标基因的信息点击ACTB的链接后,即可查询β-Actin基因的信息了!在这个界面下,包括总结(Summary)、该基因在基因组上下游的基因位置信息(Genomiccontext)、各组织器官的表达谱(exxxxxpression)和生物学功能(Bibliography)等等,信息十分齐全!4.查询目标基因的基因结构重点来了!在Genomicregionstranscxxxxriptsandproducts项目栏里,即可直观的看到β-Actin的基因结构。从该图中可以看出,β-Actin基因包含6个编码区包喊了6个外显子和5个内含子。

4、那么基因序列是什么呢?在Tools的SequenceTextView可以直观的看到基因的序列与结构哦!如下图SequenceTextView中标注的基因结构:此外,如果要了解基因的具体位置信息,可以点击GenBank的链接,或者在GenBank直接查询目标基因的序列号。序列号对于每一段序列来说都是唯一的。根据各个区域给出的位置信息,同样地,也可以得知序列中基因结构。其实,除了在在NCBI上直接查询目标基因结构的方法外,还有非常多的生物学软件可以帮助我们进行基因结构分析,如DNAStar等,只要输入序列,即可预测得到基因的结构。本文转载自GenSt

5、ar

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