高分辨率溶解曲线.doc

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时间:2020-09-06

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1、高分辨率熔解曲线高分辨率熔解(High-resolutionmelting,简称HRM)分析的主要原理是由于DNA序列的片段长短,GC含量、分布以及碱基互补性差异等的不同,在DNA分子热变性时会使溶解曲线的形状和位置有所不同。同许多荧光PCR技术一样,HRM利用特定的染料可以插入DNA双链中的特性,通过实时监测温度变化过程中双链DNA荧光染料与PCR扩增产物的结合情况记录高分辨率熔解曲线,从而对样品进行检测,可以迅速的检测出核酸片段中 GC 含量和单碱基的突变。高精度PCR仪及饱和性染料(LCGreen、EvaGreen等)的

2、出现使HRM得到广泛的普及和应用。项目:已知SNP位点检测;外显子突变位点筛查;物种鉴定、品种鉴定;甲基化研究;法医学鉴定、亲子鉴定。样本要求:新鲜或异硫氰酸胍保存的细胞(﹥5×106)、组织(﹥50mg)、血液(﹥300μl)等样本原材料,或纯化好的DNA(OD260/OD280在1.7-1.9之间)、总RNA(OD260/OD280在1.9-2.1之间,完整性好),或反转录好的cDNA不少于30μl(纯度在1.9-2.1之间,及反转录好的cRNA完整性好)。技术优势:高通量:1次可同时检测多个样本。高敏度:HRM检测灵敏度

3、达1%-0.1%,是传统“PCR+测序”方法25-250倍。特异性好:PCR产物无需后续处理,特异性强。重复性好:样品经PCR扩增后直接进行HRM,直接在同一个PCR管内进行分析,实现闭管操作,避免交叉污染。操作简便:只需设计PCR引物,进行PCR反应,无需序列特异性探针,无需测序,也不受突变碱基位点与类型的局限。成本低:相比传统的SNP/突变分析法和定量探针法,简化了操作步骤,缩短了实验时间,大大降低了使用成本。

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