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《陆地棉农艺性状与ssr标记的关联分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。
1、棉花学报CottonScience2014袁26渊5冤院387~395陆地棉农艺性状与SSR标记的关联分析1,222221,2*梁冰袁范术丽袁宋美珍袁庞朝友袁魏恒玲袁喻树迅(1.西北农林科技大学农学院袁陕西杨凌712100曰2.中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室袁河南安阳455000)摘要院利用关联分析方法以160对SSR引物对68份陆地棉品种2个播期组成的自然群体进行基因型检测袁在利用STRUCTURE2.3.4软件分析群体结构的基础上袁采用TASSEL4.0软件的GLM程序和MLM程序对17
2、个农艺性状进行关联分析遥结果显示袁STRUCTURE群体结构分析将68份供试材料划分为3个亚群袁基于Nei's遗传距离的聚类分析也将68份供试材料划分为3个亚群袁与群体结构划分结果基本一致遥6个SSR位点均能通过GLM和MLM程序检测到袁且在2个播期下稳定出现袁其中袁CER0098-400与全生育期显著关联袁DPL0375-250和HAU2414-147与果枝始节显著关联袁DPL0504-135尧HAU0883-120和NAU1298-524与衣分显著关联遥本研究结果为棉花分子标记辅助选择提供了依据遥关键词院陆
3、地棉曰早熟性曰产量性状曰纤维品质曰关联分析中图分类号院S562.035.2文献标志码院A文章编号院1002-7807(2014)05-0387-091,222221,2*LiangBing,FanShuli,SongMeizhen,PangChaoyou,WeiHengling,YuShuxun(1.712100,;2.,455000,)Inthisstudy,68samplesofuplandcottonsowedontwodifferentdateswerescannedusing160pairsofSSR
4、primerstoperformassociationanalysisof17agronomictraits,includingthoserelatedtoearlymaturity,yieldandfiberquality,whicharemostlyquantitativetraits.STRUCTURE2.3.4softwarewasusedtoestimatethepopulationstructureofthe68varieties,whichcouldbedividedintothreesubgro
5、ups.ClusteranalysisbasedonNei'sgeneticdistancewasalmostidenticaltothatthe68sam-plescouldbedividedintothreesubgroups.Usinggenerallinearmodel(GLM)andmixedlinearmodel(MLM)toperformasso-ciationanalysisbyTASSEL4.0software,sixSSRlociweredetectedatthetwosowingdates
6、,ofwhichCER0098-400isex-tremelysignificantlyassociatedwithgrowthstage,DPL0375-250andHAU2414-147areextremelysignificantlyassociatedwithlocationofthefirstbranch,threeSSRloci,DPL0504-135,HAU0883-120andNAU1298-524,wereextremelysignificantlyasso-ciatedwithlintper
7、centage.Thisresearchprovidesthebasesformarker-assistedselection(MAS)inuplandcottonbreeding.uplandcotton;earlymaturity;yieldtraits;fiberquality;associationanalysis棉花是一种重要的经济作物袁培育早熟尧丰助选择袁可以大幅度提高育种效率遥产和优质的棉花品种是目前棉花育种的主要目目前袁研究植物数量性状的方法有基于遗传标遥棉花早熟尧产量以及纤维品质性状都是数量连
8、锁的QTL作图分析和基于连锁不平衡(Link-性状袁受多个数量性状基因位点渊Quantitativetraitagedisequilibrium,LD)的关联分析遥关联分析locus袁QTL冤控制袁遗传机理复杂且易受环境因素(Associationanalysis)是一种将标记或者候选基因影响遥因此袁传统育种方法进展缓慢袁效率低遥利的等位基因变异与目标性状表型联系起来的分[1]用与QT
