详解 linux系统集群的安装与并行计算

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1、详解Linux系统集群的安装与并行计算　　1.Linux安装　　安装过程就不多说了。需要注意的是安装时，如果机群不与外界联网则可以不考虑安全方面的因素而把rsh选为可信赖的服务，注意安装相应的软件包；如果还要与外界保持联网，出于安全需要应把ssh选为可信赖的服务。安装以后，应该保证各节点之间能够用ssh相互登录。每个节点的sshd都应该能正常提供服务。主机名：node1...noden(我所构　　建的系统n=2)　　2.创建NFS服务　　在服务器节点public目录下建立mpi目录，并将其配置成NFS服务器，在/etc/exports文件中加入一行：　

2、　/public/mpinode1(rpinfsrpi这个目录从服务器节点输出，并装载在各客户端，从而便于在各节点间分发任务　　3.修改/etc/hosts文件　　将所有节点名称极其ip地址填入。例如：　　127.0.0.1　localhost.localdomainlocalhost　　192.168.1.1　node1　　192.168.1.2　node2　　.　　每个节点都进行类似的配置。这样做的目的是使节点之间能够通过node1...noden的名称相互访问。你可以通过pingnoden或sshnoden进行测试。　　4.修改(或创建)/etc

3、/hosts.equiv文件　　将所有你允许访问本机进行mpi计算的机器名填入，一行一个机器名。这一步是为了使节点对其它的节点放权。　　例如，我的node1是我用于启动mpi集群计算的机器，其他的节点是参与计算者，在node1的/etc/hosts.equiv文件是这样的：　　node1#给自己放权，这样在只有一台机器时也可以模拟并行计算环境　　node2　　.....　　noden　　在node2...noden的/etc/hosts.equiv文件：　　node1#对node1放权　　node2　　......　　noden　　5.修改~/.bas

4、h_profile文件　　首先决定一个用于启动集群计算的用户名，不提倡使用root进行集群计算。这里在每个节点上建立新用户chief，他们的主目录都是/home/chief，必须采用同样的密码，将来　的计算程序必须放在相同的路径上。譬如你的程序为：fpi.f和a.out，则必须把a.out放在同样的路境内，比如~/mpirun/a.out，每个节点都是如此。修改~/.bash_profile文件，主要是加入下列几行脚本：　　exportPATH=$PATH:/usr/local/mpich/bin　　exportMPI_USEP4SSPORT=yes　

5、　exportMPI_P4SSPORT=22　　exportP4_RSHMAND=rsh或ssh　　这里我们预定了将来mpich的运行环境安装在目录/usr/local/mpich下面。其余的三个变量是用来通知mpi运行环境采用rsh(或ssh)来作为远程shell。linux的运行环境到此就配置完毕了。　　6.配置rsh或ssh　　对于采用rsh来作为远程shell运行MPI的用户只要保证在各个节点上都具有相同的用户，并把这一用户的密码设为空密码就可以运行了。　　若采用ssh作为远程shell则按如下配置：以你设定的用于启动mpi计算的用户登录，运行

6、ssh-keygen，这将生成一个私有/公开密钥对，分别存放在~/.ssh/identity和~/.ssh/identity.pub文件内。然后进行访问授权，运行：　　cp~/.ssh/identity.pub~/.ssh/authorized_keys　　chmodgo-rail。　　如果是使用su命令转为root用户的则很可能运行ntsysv并不出现ntsysvs实用程序。此时可以直接去修改/etc/xid.d下的rlogin,rsh,tele的设置。用vi编辑器打开xin　　etd.d:　　vi/etc/xid.d　　则可看到如下所示的配置文件:

7、　　关于rsh的设置如下　　#default:off　　#description:Thershdserveristheserverforthercmd(3)routineand,　　#consequently,forthersh(1)program.Theserverprovides　　#remote123下一页....，。executionfacilitiesbersfromtrustedhosts.　　serviceshell　　{　　disable=yes　　socket_type=stream　　.Theserver　　　　#providesa

8、remoteloginfacilitybersfromtrustedhosts.　　servi