全基因组关联分析馒头比容与质构snp标记

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1、全基因组关联分析馒头比容与质构SNP标记刘娟1陈广凤2田纪春3吴澎1赵子彤1杨艺1李向阳1唐晓珍1（山东省高校食品加工技术与质量控制重点实验室；山东农业大学食品学院1，泰安271018）（德州学院生态与景观学院2，德州253023）（山东农业大学小麦品质育种研究室；山东省作物生物学重点实验室3，泰安271018）摘要为从分子水平研究控制馒头比容与质构性状的基因位点，以205份不同小麦品种为实验材料，利用分布于小麦全基因组的24355个单核苷酸多态性（SNP）标记对馒头比容与质构性状进行关联分析。共检测到42个比容性状显著关联位点，其中8个极显著关联位点（P<0.0001），同时也是

2、高遗传贡献率位点（R2>10%），2个位点至少在两个环境中稳定表达；检测到313个质构性状显著关联位点，其中31个极显著关联位点，46个高遗传贡献率位点，11个位点至少在两个环境中稳定表达。同时，发掘了5个质构性状主效关联位点，如3B染色体上黏聚性关联位点Kukri_c13329_800等。本研究所得到的这些标记为在分子水平上研究馒头品质性状提供了有价值的参考。关键词馒头比容馒头质构单核苷酸多态性标记全基因组关联分析显著关联位点中图分类号：TS201.1文献标识码：AGenome-WideAssociationAnalysisbetweenSNPMarkersandSpecific

3、volumeandTextureRelatedTraitsofSteamedBreadLIUJuan1,CHENGuangfeng2,TIANJichun3,WUPeng1*,ZHAOZitong1,YANGYi1,LIXiangyang1,TANGXiaozhen1(KeyLaboratoryofFoodProcessingTechnologyandQualityControlinShandongProvince；CollegeofFoodScienceandEngineering,ShandongAgriculturalUniversity1,Taian271018)(Coll

4、egeofEcologyandLandscapeArchitecture,DezhouUniversity2,Dezhou253023)(StateKeyLaboratoryofCropBiology；GroupofQualityWheatBreading,ShandongAgriculturalUniversity3,Taian271018)AbstractInordertostudythegenelocithatcontrolspecificvolumeandtextureofsteamedbread,205diversewheatvarietieswereusedtocond

5、ucttrait-markersassociationusing24355singlenucleotidepolymorphism(SNP)markerscoveredthewholegenomeofwheat.Intheresults,42significantmarkersweredetectedforspecificvolumeofsteamedbreaddistributedacross7chromosomesofwheat,including8highlysignificantmarkers(P<0.0001),aswellashighgeneticcontributio

6、nmarkers(R2>10%),2markersdetectedintwoormoreenvironment.313significantmarkersweredetectedfortexturetraitsofsteamedbreadmappedonto15chromosomesofwheat,including31highlyassociatedmarkers(P<0.0001),46highgeneticcontributionmarkersand11stablemarkers.Atthesametime,5mainsitesweredetectedfortextureof

7、steamedbread,suchasKukri_c13329_800onchromosome3B.Theseresultswillfacilitatefurtherresearchesinsensorypropertiesinsteamedbread.基金项目：山东省重点研发计划（公益类）（2017GNC10101）山东农业大学作物生物学国家重点实验室开放课题（2015KF14）收稿日期：2017-10-09作者简介：刘娟，女，1994年出生，硕士，食品科学通讯作者