用xml做通讯录实验报告

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1、2011级《生物信息学》课程论文姓名焦苗学号110301134专业11生物技术题目：人与小鼠酪氨酸激酶PTK基因及蛋白的相似性分析摘要：目的了解人与小鼠酪氨酸激酶PTK基因及蛋白的相似性分析。方法在NCBI中查到人和小鼠的PTKcDNA和蛋白序列，然后将人和小鼠的PTKcDNA和人和小鼠的蛋白序列分别进行BLAST比对。结果人和小鼠的PTKcDNA的相似性为89%，人和小鼠的PTK蛋白序列相似性为96%。结论人和小鼠酪氨酸激酶PTK基因及蛋白具有同源性。关键词：人小鼠酪氨酸激酶PTKcDNA蛋白序列BLASTTitle:humanan

2、dmousetyrosinekinasePTKsimilarityanalysisofgeneandproteinAbstractobjective:tounderstandthepeopleandthemiceinthesimilarityoftyrosinekinasePTKgeneandproteinanalysis.Method:detectedintheNCBIandmicePTKcDNAandproteinsequences,thenandmicePTKcDNAandBLASTratioontheproteinsequen

3、cewhichareofmiceandhumans.Results:peopleandmicePTKcDNAsimilarityof89%,peopleandmiceofPTKproteinsequencesimilaritywas96%.Conclusion:thetyrosinekinasePTKgeneandproteinofmiceandhumanshavehomology.Keywords:peoplemicetyrosinekinasePTKcDNAproteinsequenceBLAST前言：蛋白酪氨酸激酶（protei

4、ntyrosinekinase,PTK）是一类催化ATP上γ-磷酸转移到蛋白酪氨酸残基上的激酶，能催化多种底物蛋白质酪氨酸残基磷酸化，在细胞生长、增殖、分化中具有重要作用。迄今发现的蛋白酪氨酸激酶中多数是属于致癌RNA病毒的癌基因产物，也可由脊椎动物的原癌基因产生。小鼠属脊椎动物门，哺乳纲，啮齿目，鼠科，小鼠属动物。小鼠的世代短，成熟早，繁殖很强，属全年、多发情动物，一年可产仔胎数6－10胎，每胎产仔数8－15头，且具有体型小、易于管理等特点。在进化上，小鼠与人类的距离较近，约有1亿年。其解剖学结构、发育过程、生化代谢途径都与人接近，

5、约80%的小鼠蛋白质在人类基因组中具有严格的1：1种间同源体，其序列同一性通常介于70%－100%。为人类疾病的克隆提供了极佳的实验材料。作为经典的医学实验动物，小鼠已经对医学诸多领域的研究作出了卓越贡献。出了卓越贡献。从第一次被作为实验材料，到基因组测序的完成，小鼠在遗传学研究中已经有上百年的历史了。作为十分重要的模式生物之一，小鼠不仅为基础生物学研究做出了一系列重要贡献，更是在人类认识自身，战胜疾病的进程中功不可没方法：第一步：输入网址http://www.ncbi.nlm.nih.gov/也可通过搜索NCBI(NationalC

6、enterforBiotechnologyInformation)进入ncbi主页，选择Nucleotide状态，输入（homoPTKCDs）、（MUSPTKCDs）进行搜索。进入标题，复制基因序列，粘贴到新建的文本，备用。第二步：输入网址http://www.ncbi.nlm.nih.gov/也可通过搜索NCBI(NationalCenterforBiotechnologyInformation)进入ncbi主页，选择protein状态，输入（homoPTKCDs）、（MUSPTKCDs）进行搜索。进入标题，点击FAST,复制蛋白序

7、列，粘贴到新建的文本，备用。第三步：进入NCBI，点击BLAST，点击NucleotideBLAST,点击Aligntwoormoresequences，将人和小鼠cDNA序列复制到两个对话框中，点击BLAST,截图保存。第四步：进入NCBI，点击BLAST，点击proteinBLAST,点击Aligntwoormoresequences，将人和小鼠蛋白序列复制到两个对话框中，点击BLAST,截图保存。结果：一、基因序列：人：atgtctggggtgtccgagcccctgagtcgagt841aaagttgggcacgttacgcc

8、ggcctgaaggccctgcagagcccatggtggtggtaccagt901agatgtggaaaaggaggacgtgcgtatcctcaaggtctgcttctatagcaacagcttcaa961tcct