资源描述：
《单晶结构解析讲义完美版》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在行业资料-天天文库。
1、晶体结构解析1.Shelxtl使用流程※解析原始文件有hkl文件（或raw文件），包含衍射数据；p4p文件，包含晶胞参数※为一个晶体的数据建立project，该项目下所有文件具有相同的文件名；一旦在XPREP中发生hkl文件的矩阵转换，则需要输出新文件名的hkl等文件，因此要建立新的project。※首先运行XPREP，寻找晶体的空间群※然后运行XS，根据XPREP设定的空间群，寻找结构初解※在Xshell中观察初解是否合理，如不合理，需重回XPREP中设定其他的空间群2.Xshell使用流程※找出重原子或者确定性大的原子
2、※找出其余非氢原子※精修原子坐标※精修各项异性参数※找到氢原子(理论加氢或差值傅里叶图加氢)※反复精修，直到wR2等指标收敛。最后的R1<0.06(0.08)wR2<0.16(0.18)※通过HTAB指令寻找氢键，判定氢的位置是否合理，并且将相关氢键信息通过HTAB和EQIV指令写进ins文件中※将原子排序(sort)3.cif文件生成和检测错误流程※在步骤1、2完成后，在ins文件中加入以下三条命令bond$Hconfacta※此时生成了cif和fcf文件，将cif文件拷贝到planton所在文件夹中检测错误，也可以通过
3、如下在线检测网址：http://journals.iucr.org/services/cif/checkcif.html※根据错误提示信息，修改或重新精修，将A、B类错误务必全部消灭，C类错误尽量消灭。4.ActaE投稿准备流程投稿前，请务必切实做好如下工作：※按步骤1、2、3解析晶体并生成相应cif和fcf文件。※准备结构式图(Chemicalstructuraldiagram)、分子椭球图(Molecularellipsoiddiagram)和晶胞堆积图(Packingdiagram)，最好是pdf格式。※按要求撰写文
4、章的文字部分，填写cif中相应段落，注意格式要求！_publ_section_title题目_publ_section_abstract摘要_publ_section_related_literature相关文献_publ_section_comment评论_publ_section_exptl_prep制备方法_publ_section_exptl_refinement精修说明_publ_section_references参考文献_publ_section_figure_captions插图说明_publ_sectio
5、n_table_legends表格说明_publ_section_acknowledgements致谢※将cif中需要填写的其他部分（在cif的标准空白样本中以！标注）全部完成，并再次检查整个cif文件格式和内容。1参考书目•单晶结构分析原理与实践O723/0301陈小明，蔡继文,科学出版社20032007年第2版O723/10001•固体科学中的空间群O711/8401(美)(G.Burns),(A.M.Galzer)高等教育出版社1981•结晶化学导论O711/8401(英)(R.C.Evans),人民教育出版社198
6、0•结晶化学导论O74/10002钱逸泰,中国科学技术大学出版社2005•晶体结构的周期性和对称性O723/9201周公度,高等教育出版社1992•X射线分析的发展O434.1/8901(英)(Bragg,W.L.),科学出版社1988•X射线衍射分析原理与应用O657.39/0401刘粤惠，刘平安,化学出版社2003•晶体生长O78/81001张克从，张乐惠,科学出版社1981•超分子化学O631.1/0402(法)Jean-MarieLehn,北京大学出版社20022应用软件ShelxtlV6.10,Bruker200
7、0晶体解析、分析、作图的首选软件PlatonV1.15,A.L.Spek,UtrechtUniversity,Padualaan8,3584CHUtrecht,TheNetherlands2008Cif文件查错、解析结构全面解析的软件，下载及更新地址：http://www.chem.gla.ac.uk/~louis/software/platon/MercuryV1.4.2,CCDC2007晶体结构分析、作图辅助软件下载及更新地址http://www.ccdc.cam.ac.uk/free_services/mercury
8、/downloads/enCIFerV1.2,CCDC2005cif填写、检查格式软件http://www.ccdc.cam.ac.uk/free_services/encifer/downloads/publCIFv1.9.2,IUCr2008cif填写、检查格式、预览软件http://journal
