丹参遗传多样性的srap标记分析

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1、万方数据576文章编号：1000—8551(2008)05—576．05核农学报2008，22(5)：576。580Journa／旷NuclearAgriculturalSciences丹参遗传多样性的SRAP标记分析李廷春1樊洪泓2高正良1周应兵1杨华应1(1．安徽省农业科学院烟草研究所，安徽合肥230031；2．安徽农业大学，安徽合肥233211)摘要：相关序列扩增多态性(sRAP)是一种新发展起来的分子标记。试验通过建立优化的丹参SRAP反应体系，从88对引物组合中筛选得到36对多态性引物组合，对生长在四川中江、陕西商洛、山东临沂、安徽亳州和安徽凤阳5个丹参主产区的6个丹参种群进

2、行了遗传多样性分析。结果表明：36对多态性引物组合共产生782条多态性条带，平均每个引物组合产生21．7条多态性条带，显示了较高的多态性。应用NTSYS软件聚类分析36对引物组合的扩增结果，供试材料分为两大类，Jaccard’s遗传相似系数在0．6774～0．8225之间，说明SRAP技术可有效地应用于丹参的遗传多样性及亲缘关系的研究。关键词：相关序列扩增多态性；丹参；分子标记；遗传变异STUDⅢSoNGENETICDIVERSITYOFSalviamiltiorrhizaBUNGEWITHAMoLECULARⅣ【ARKERSRAPLITing—chunlFANHong—hon92GA

3、OZheng．1ian91ZHOUYing—bingYANGHua．ying(1．TobaccoResearchInstitute0，AnhuiProvincialAgriculturalScienceAcademy，Hefei，Anhui230031；2．Schoolof啦Science，AnhuiAgricultureUniversity，Hefei，Anhul233211)Abstract：Sequence—relatedamplifiedpolymorphism(SRAP)isanewlydevelopedmolecularmarkertechnique．Inthispaper

4、，thegeneticdiversityof6speciesSalviamiltiorrhizaBungewhichwerecollectedfromprimaryproducingarea，includingZhongjianginSichuan，ShangluoinHenan，LinyiinShandong，BozhouandFengyanginAnhui，weretestedbyusingtheoptimizedSRAPreactionsysteminthestudy．TheNTSYSsoftwarewasusedtoanalyzethemarkers．Asaresult，36p

5、rimerpaimwereselectedfrom88，andamplified782polymorphicbandswithanaverageof21．7polymorphicbandsperprimerpair．ClusteranalysisusingUPGMAmethodbasedonthedataofSRAPamplifiedbandsby36primerpairsshowed6speciesofSalviamiltiorrhizaBungecouldbedistinguishedintotwomaingroups．Jaccard’Ssimilaritycoefficientr

6、angedfrom0．6774—0．8225．TheresultshowedthatSRAPmolecularmarkerWaSefficienttostudythegeneticdiversityofSalviamiltwHhuaBunge．Keywords：SalviamiltiorrhizaBunge；SRAP；molecularmarker；geneticdiversity丹参系唇形科鼠尾草属植物丹参(SalviomiltiorrhizaBunge)的于燥根及新鲜根茎，是我国被列为上品的传统中药之一，始载于《神农本草经》，《本草纲目》中也有相关记载n’21。中医有“一味丹参饮，

7、功同四物汤”之说，其药用价值可见一斑。现代对丹参的研究主要集中在其化学成分、药理作用等方面口]，而对其遗传方面的研究相对较少。丹参的生态适应强，在我国广泛分布于华北、华东、中南，西北、西南部分省区也有分布。目前，国产栽培丹参因长期采用无性繁殖，品种严重退化，商品质量和产量极不稳定，已成为国产丹参出口创汇和生产质量管理规范(GAP)研究的“瓶颈”[4]。利用分子标记技术鉴定栽培种与野生种之间的遗传差异及相似系数可为育种工作提供亲本组配参考系数，对